蛋白分析FAQ汇总

• • 氨基酸连接构成的分子都是蛋白质吗

  氨基酸连接构成的分子大多数情况下被称为蛋白质，但并非所有氨基酸聚合物都被视为蛋白质。

• • 请问多肽组数据怎么看？

  谱检测多肽后，数据分析包括几个关键步骤：检查数据质量以评估多肽数目和信噪比；确认多肽鉴定结果的匹配置信度和修饰信息；进行定量分析以识别蛋白质表达变化；映射多肽数据到对应蛋白质并进行生物学功能分析；最后，通过数据可视化展示表达差异。

• • 请问用戊二醛交联的protocol是怎样的？

  戊二醛是一种常用的交联剂，广泛用于蛋白质、酶、细胞等生物样品的固定和交联。在戊二醛交联实验中，通常用于稳定蛋白质复合物或细胞结构，以下是一个常见的戊二醛交联的基本protocol（以细胞或蛋白为例），可根据实际实验需求进行调整。

• • 请问分子筛分离不同大小的活性蛋白时，这个筛是有成品吗？

  分子筛（也称为凝胶过滤或分子排阻层析）是一种常用的分离技术，主要用于根据分子大小分离蛋白质、核酸等生物大分子。在进行分子筛分离不同大小的活性蛋白时，筛是指用于分离的层析介质（通常是聚合物颗粒），这类介质是有成品可供选择的。

• • far-western跑出来的条带是白色的，请问这是为什么呀？要怎么解决呢？

  在Far-Western Blot实验中，条带出现白色通常与曝光过度、蛋白过量、抗体浓度过高、检测底物不均或膜转印不完全有关。为解决此问题，可以缩短曝光时间、减少样品蛋白和抗体的用量、确保底物均匀分布以及优化蛋白转移条件。这些调整有助于改善实验条带的显色效果。

• • 蛋白质降解的特性有哪些？

  蛋白质降解是一个非常关键的生物过程，其主要特性包括：选择性、时序性、空间性、可逆性、动态性、依赖性、特异性

• • 请问做人血浆蛋白质组学什么情况需要去除高丰度蛋白呢?

  在做人血浆蛋白质组学时，需要去除高丰度蛋白的情况包括：提高低丰度蛋白的检测灵敏度，研究特定生物标志物，提高数据的重现性和准确性，优化样品分离和分析方法。

• • 为什么多聚谷氨酸PH小于等于4时R基团不带电呢？

  多聚谷氨酸的R基团是侧链羧酸基（-COOH），当pH小于或等于4时，环境中氢离子浓度较高，羧酸基会质子化，从而变为不带电的形式（-COOH）。此时，羧酸的离解常数（pKa）未达到，使得R基团中的负电荷被质子中和。因此，在这种酸性环境下，R基团表现为中性，不带电。

• • 请问怎么看一个蛋白的糖基化位点多不多？

  查看一个蛋白的糖基化位点多不多，常用的途径有数据库查询、通过生物信息学预测和实验检测等多种方式。

• • 请问预测N-糖基化位点可以用什么软件来测试呢？

  在生物研究领域，对于N-糖基化位点的预测，研究者们常用到一些生物信息学的软件和平台，如NetNGlyc、GlycoEP、GPP Prediction Server等。这些软件都有各自的特性和优势，一般会根据实际研究需求来选取。