TPD药物靶向性能蛋白质组分析

随着生物技术的快速发展，药物研发逐渐进入了一个精准化、个性化的新时代。靶向蛋白质降解（Targeted Protein Degradation，TPD）药物是一种新兴的治疗策略，可以通过利用体内的泛素-蛋白酶体系统来降解特定的病态蛋白，实现精准治疗。TPD药物作为一类重要的新型治疗药，正吸引着越来越多的关注和创新。针对特定疾病靶点（TPD）的药物设计，已成为当前药物研发领域的热点。

蛋白质组学作为研究生物体内蛋白质组成、结构、功能及其相互关系的科学，能够全面揭示药物与蛋白质之间的相互作用。结合蛋白质组学技术，我们可以深入探究TPD药物的靶向性能，为药物的优化设计和临床应用提供重要依据。

百泰派克生物科技(BTP)使用Thermo公司Obitrap Fusion Lumos等高分辨质谱仪建立了TPD药物靶向性能蛋白质组分析平台，为您提供基于全蛋白质组学技术的TPD药物靶向降解特性分析服务，一次实验可鉴定8000-10000种全蛋白，我们提供的分析服务包括但不仅限于：

• 靶蛋白降解活性（Target protein degradation activity）分析：

采用非数据依赖采集（Data independent acquisition，DIA）技术和专业的蛋白质检索软件，相比传统DDA技术为代表的TMT/iTRAQ的标记定量技术，更全面地覆盖蛋白质组，同时有效提高目标蛋白（Protein of interesting，POI）定量准确性；

• 靶向选择性（Target selectivity）分析：

通过差异蛋白组分析POI及其他差异蛋白变化，综合评估TPD药物的靶向选择性；

• 潜在脱靶风险及安全性问题（Potential off-target and safety concerns）分析：

基于TPD药物靶向选择性结果，整合多平台数据库分析，探究TPD药物潜在的脱靶风险及安全性问题；

• 生物学功能及其作用机制（Biological functions and mechanisms of action）分析：

采用经典的生物信息学功能分析策略，例如PPI、GO和KEGG等，探究TPD药物介导的生物学功能及其作用机制。

实验设计及流程

• 样本制备：合理的浓度、时间点实验设计；

• 样本前处理：全蛋白提取、蛋白酶切；

• 质谱采集：DIA采集，DIANN搜库；

• 数据处理：自动化分析流程、个性化分析流程。

图1. TPD药物靶向性能蛋白质组分析实验流程

适用样品类型

• 细胞沉淀：每组至少1个处理组，1个对照组，每组建议至少3个样本；

• 组织样本：每组至少1个处理组，1个对照组，每组建议至少5个样本。

结果交付