蛋白分析FAQ汇总
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• 一批样品已加入Loading Buffer,但尚未进行煮沸变性,目前存放于-20℃。预计将在几周甚至一个月后使用,应该如何保存?
对于已加入Loading Buffer但尚未煮沸变性的蛋白样品,长期保存需权衡蛋白稳定性与后续实验兼容性。具体建议如下:一、推荐保存条件 温度 建议改为-80°C保存,以最大限度减缓蛋白降解与蛋白酶活性。冻存形式:可直接原管冻存,无需分装,但若样品量较大,建议分装成一次用量,避免反复冻融。注
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蛋白样品复煮(即加热变性)通常用于SDS-PAGE上样前破坏蛋白的高级结构,确保电泳迁移主要反映分子量。具体复煮温度与时间如下:一、常规复煮条件温度:95°C 或 100°C(沸水)时间:5 分钟 若样品粘稠或高浓度、含有膜蛋白等复杂组分,可适当延长至 10 分钟,但避免过度煮沸导致蛋白降解
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• SUMO相关实验通常如何设计?若采用Western Blot,应选择哪类抗体?实验体系可以自行构建吗?
针对SUMO(Small Ubiquitin-like Modifier)修饰的研究,实验设计需根据具体研究目的(如:是否关注全局SUMO化、特定位点修饰、或特定底物蛋白)做精确区分。以下分层说明:一、常见SUMO相关实验设计策略 1、总SUMO化水平检测 目的:观察细胞/组织中SUMO化动
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• 请问完成质谱肽段序列鉴定后,拿到结果接下来要怎么分析呢?
质谱获得肽段序列鉴定结果后,下一步分析需根据研究目标(定性、定量、功能研究)分步骤进行。一般流程如下:一、结果质量控制与过滤 检查数据库搜索结果的打分指标(如Peptide/Protein FDR、Score、Unique peptide数)。剔除低置信度蛋白或仅1条肽段支持的结果,确保数据
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• 请问没有变性的蛋白会更容易降解吗?提取的蛋白放-80°C能保存多久呀?
需要区分两方面:蛋白质自身结构状态与保存条件对稳定性的影响。一、未变性蛋白的降解风险 天然构象的蛋白保留了完整的空间结构,通常也保持活性。如果溶液中存在残留蛋白酶或微量金属离子,这类蛋白因易被识别、切割而降解速度较快。变性处理(如加 SDS、尿素、加热)会失去结构和活性,多数蛋白酶难以切割,
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• 请问液相色谱用面积和时间怎么看不同干预下相对的浓度高低呢?
在液相色谱(LC)分析中,样品中目标物的相对浓度通常通过峰面积(peak area)评估,而时间(保留时间,Retention Time, RT)主要用于判定组分身份,而非直接表示浓度。要比较不同干预条件下目标物浓度高低,应按以下步骤判断:一、锁定对应化合物的保留时间 不同条件下,保留时间可
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通常情况下,用于采集泪液的毛细管并非普通的一次性微量采血吸管,而是专门的无添加、无涂层的玻璃或塑料毛细管,常见规格为内径0.5–1.0 mm、长度约5–10 cm,容量多为1–10 µL。主要区别 1、无抗凝剂或其他添加物:采血用毛细管通常内壁涂有肝素或其他抗凝剂,可能干扰后续蛋白组学或代谢
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要准确比较加药与不加药条件下二聚体含量,需明确:蛋白性质(是否可溶、是否易聚集)、检测环境(体外纯化蛋白还是细胞/组织裂解液)、目标是否为定性或定量分析。通常可考虑以下策略:一、凝胶电泳结合定量 1、原理:二聚体相对单体在非还原、低变性条件下可保持构象差异。2、方法:使用非还原 SDS-PA
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• IP样品于室温放置近一天(已煮沸),但忘记未取出且夜间仪器已关闭,还能继续使用吗?
需重点考虑以下几点:一、蛋白完整性 1、已经煮沸(通常含 SDS、还原剂),样品中大部分天然构象和酶活性已被破坏,理论上不会再发生显著降解。2、但长时间室温暴露可能导致部分易沉淀或不溶的组分聚集,尤其含高浓度 SDS 或尿素时,温度下降后易析出。二、微生物污染与缓冲体系 1、若缓冲液中无抑菌
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• 用docking软件,预测完多肽之后要用什么去验证结合呢?
通常在分子对接(docking)预测出多肽与靶标蛋白的结合模式后,需要通过实验手段验证其结合亲和力与特异性。常用方法可分为两类:一、生化或生物物理方法(直接测定结合)1、表面等离子共振(SPR)可获得实时结合动力学参数(ka、kd)及平衡解离常数(KD),适合验证亲和力及动力学特征。2、等温
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