蛋白分析FAQ汇总

• • 普通的蛋白质组学是不是看不出蛋白质巯基、羰基的变化（已经做了巯基、羰基的理化指标）？

  普通的蛋白质组学技术可能无法直接看出蛋白质巯基和羰基的详细变化，需要特定的质谱技术和化学标记方法来准确识别和定量这些修饰。

• • 乙酸容易跟溶剂峰重合吗？会不太准确吗？

  乙酸在某些条件下确实可能与溶剂峰重合，特别是在气相色谱（GC）或液相色谱（HPLC）分析中使用常见的溶剂时。这种重合可能导致定量不准确。使用适当的色谱条件和检测方法可以减少这种影响，提高准确性。

• • 为什么要进行蛋白质序列分析？

  蛋白质序列分析对于理解蛋白质的结构、功能和进化关系至关重要，为生物过程提供了深入的洞察，促进了医学和生物技术等领域的进步。

• • 如何进行蛋白质序列分析？

  蛋白质序列分析主要使用质谱法、Edman埃德曼降解等技术，以及近期发展的单分子蛋白质测序等先进蛋白质测序技术，能够精确确定蛋白质链中氨基酸的顺序。

• • 什么是蛋白质测序？

  蛋白质测序是确定蛋白质链中氨基酸顺序的过程，旨在揭示其一级结构。单分子蛋白质测序则涉及分析单个氨基酸或蛋白质分子，使复杂生物系统具有高分辨率的洞察力。此外，蛋白质测序在理解疾病机制、药物开发和个性化医学方面具有重要应用价值。

• • DNA测序和蛋白质测序的区别是什么？

  DNA测序用于确定DNA分子中的核苷酸序列，而蛋白质测序用于鉴定蛋白质链中的氨基酸序列。

• • 蛋白质谱实验中常见故障排除指南

  问1：样品中是否表达了蛋白质？ 答：通过免疫印迹法（Western Blot）检查起始样品（即，在细胞收获后直接检查）。 问2：蛋白质是否在实验过程中，即样品处理过程中丢失？ 答：在每个实验步骤中定期取样，以确保蛋白质存在于样品中（通过免疫印迹法进行验证）。

• • 想要研究某个固定蛋白的翻译后修饰，可以通过什么方法检测呢？

  可以通过以下方法检测： 1. 质谱法：通过高通量蛋白质组学分析，可以检测蛋白质磷酸化、乙酰化、泛素化等多种翻译后修饰。 2. 西方印迹（Western blot）：使用特异性抗体，可以检测特定的翻译后修饰，如磷酸化、乙酰化等。 3. 免疫荧光显微镜：使用特异性抗体，可以在细胞中定位特定的翻译

• • 糖基化位点预测是用什么软件做的？做出来怎么看？

  糖基化位点预测通常使用专门的生物信息学软件或在线服务器。比如NetNGlyc、GlycoEP、NetOGlyc等，这些工具可以预测蛋白质序列中的N-连接糖基化和O-连接糖基化位点。使用这些软件或服务时，你需要输入你感兴趣的蛋白质序列。这些工具会分析序列，识别潜在的糖基化位点，并给出每个位点的

• • 戊二醛交联的步骤？有具体protocol吗？

  戊二醛（Glutaraldehyde）交联是一种常用的化学交联方法，用于固定和稳定蛋白质和其他生物大分子。以下基本的戊二醛交联步骤概述：   1.预处理样品： 将样品（如细胞或组织）清洗，使用PBS（磷酸盐缓冲盐水）或其他适当的缓冲液去除杂质。   2.准备戊二醛溶液： 根据需要，将戊二醛稀