蛋白分析FAQ汇总

• • 请问盐分的存在对薄层展开有什么影响？

  盐分的存在可以显著影响薄层展开（薄层色谱）的过程，主要表现为：   1.改变溶剂极性，影响样品分离。 2.调节样品的溶解度，影响迁移速度。 3.改变固定相的吸附特性，影响样品与固定相的相互作用。 4.调整溶剂的离子强度，影响色谱分离效果。   百泰派克生物科技--生物制品表征，多组学生物质谱

• • 请问脂酰化蛋白提取需要什么特殊方法？市面上有脂酰化蛋白的抗体吗？

  脂酰化蛋白提取通常需要使用可以保持脂酰基团稳定的缓冲液和条件，因为脂酰化（如肌醇酰化、棕榈酰化等）是可逆的并且对处理条件敏感。提取中需注意：1）使用含有脂酰化抑制剂的缓冲液：为了保护脂酰化修饰不被酶解，需要在提取过程中使用含有脂酰化抑制剂（如羟肟酸）的缓冲液。2）使用特定洗涤和沉淀步骤：以确

• • 进行二维电泳的时候sds胶是一样有浓缩胶和分离胶吗？

  是的，在进行二维电泳时，SDS-PAGE步骤同样包括浓缩胶和分离胶。浓缩胶用于集中样品中的蛋白，而分离胶则用于按照蛋白的分子量进行分离。   百泰派克生物科技--生物制品表征，多组学生物质谱检测优质服务商   相关服务： 二维凝胶电泳服务

• • 想了解bluenative page实验以及二向BN-SDS-PAGE的步骤，还有阴阳缓冲液。

  一、Blue Native PAGE (BN-PAGE) 实验材料和溶液 样品缓冲液（阴性缓冲液）: 50 mM Bis-Tris (pH 7.0), 50 mM NaCl, 10% (w/v) 甘油, 0.001% Ponceau S, 加入一定量的Coomassie Blue G-2

• • 用trizol提的蛋白可以做组蛋白甲基化的wb吗？

  使用TRIzol提取的蛋白理论上可以用于Western Blot（WB）分析。Trizol（或类似的基于酚-氯仿的提取剂）是一种多功能的提取试剂，能够同时提取RNA、DNA和蛋白质。对于蛋白质提取，特别是组蛋白这类与染色质紧密相关的蛋白质，Trizol提取可以保留其翻译后修饰，如甲基化。但是

• • 糖基化蛋白怎么看？

  基化蛋白的检测和分析可以通过多种方法进行，主要取决于你想要了解的糖基化类型（如N-糖基化或O-糖基化）以及糖基化的具体位置和结构。常用的方法主要包括： 1.质谱分析（Mass Spectrometry, MS）： 质谱是分析糖基化蛋白的强大工具，尤其是在鉴定糖基化位点和糖链结构方面。

• • 糖基化分析的实验该怎么做？详细的实验步骤。

  糖基化分析的实验步骤可以根据分析目的和选择的方法有很大的不同，质谱分析是一种强大的技术，能提供蛋白质糖基化位点和糖链结构的详细信息。这里我们以质谱（MS）分析蛋白质N-糖基化为例，提供一个相对通用的流程： 1. 样本准备 蛋白质提取：从目标样本（如细胞、组织或生物流体）中提取总蛋白。 蛋白

• • 做IP提取的蛋白，能像做Wb的蛋白一样保存在负80负度吗？还是配了马上就用？

  可以的。做免疫共沉淀（IP）的蛋白样本通常也可以在-80°C下保存，就像Western blot（WB）的蛋白样本一样。关键是确保样本在冻存过程中避免反复冻融，因为这可能导致蛋白降解或失活。使用时，应该一次性取用所需量，并在使用前充分解冻。     CO-IP免疫共沉淀法蛋白互作分析 蛋白质

• • 多肽质谱数据一般用什么软件处理呢？

  处理多肽质谱数据通常使用以下软件：   1.MaxQuant： 适用于蛋白质组学数据的定量分析，特别是液相色谱-质谱（LC-MS/MS）数据。   2.Proteome Discoverer： Thermo Fisher Scientific提供，用于蛋白质鉴定和定量的综合平台。   3.M

• • KEGG通路注释及富集分析在有代谢组数据和转录组数据的情况下，怎么筛选差异基因？

  在有代谢组和转录组数据的情况下，进行KEGG通路注释及富集分析以筛选差异基因，可以遵循以下步骤： 1. 数据预处理 转录组数据： 质量控制：使用工具如FastQC检查原始序列数据的质量，然后使用Trimmomatic或fastp进行质量修剪。 序列比对：使用比对工具（如HISAT2、STA