fret怎么做?有什么方法检测构象改变呢?

    关于FRET(Fluorescence Resonance Energy Transfer,荧光共振能量转移)实验设计与其用于构象变化检测的应用,回答如下:

     

    一、FRET原理简述

    FRET是一种基于两个荧光分子之间能量转移的技术,当供体(donor)荧光分子被激发后,若其与受体(acceptor)之间距离小于10 nm,能量可非辐射性地转移至受体,进而导致受体发射荧光。能量转移效率对两者距离变化极其敏感,因此常用于检测生物大分子之间的相互作用或构象变化。

     

    二、FRET的常见实验实现方式

    1、标签设计

    (1)常采用的FRET荧光对包括:CFP/YFP、GFP/mCherry、Alexa488/Alexa594等。

    (2)标签需分别连接于构象变化相关的两个区域(如蛋白质N端/C端,两个结构域,或两条链)。

     

    2. 实验平台

    (1)细胞内表达系统:通过质粒构建表达融合蛋白,在活细胞中观察FRET。

    (2)体外重组蛋白体系:在纯化蛋白上标记荧光探针,适用于精准定量。

     

    3. 检测方法

    (1)荧光光谱法(Spectrofluorometry):测量激发供体后受体的发射强度变化。

    (2)荧光寿命成像(FLIM):检测供体荧光寿命变化,更适用于细胞内FRET。

    (3)共聚焦显微镜+FRET滤镜组:细胞水平动态监测FRET信号变化。

    (4)TCSPC(时间相关单光子计数):高时间分辨率定量寿命变化。

     

    三、实验注意事项

    1、荧光标记位置必须与构象变化区域高度相关。

    2、避免标签自身干扰蛋白功能,建议进行功能验证(如活性保留实验)。

    3、对照设置必须充分(如单标签、无能量转移等负对照)。

    4、温度、pH等条件需严格控制,避免非特异性能量转移或信号漂移。

     

    四、其他可用于检测构象改变的方法

    1. HDX-MS(氘交换质谱):构象变化影响氢交换速率

    2. Cryo-EM(冷冻电镜):直接解析不同构象

    3. SAXS(小角X射线散射):全局构象变化

    4. NMR(核磁共振波谱):分子级构象与动力学

     

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