想让一个蛋白形成二聚,可以采用交联剂把蛋白形成二聚嘛?
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天然二聚较弱/可逆,需稳定二聚体结构;
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验证蛋白-蛋白相互作用(PPI)是否存在或发生在哪个区域;
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需要在某一构象或复杂体中捕捉瞬时结合状态;
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用于后续结构学研究(如冷冻电镜、质谱交联分析XL-MS)。
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需要天然构象或功能活性完整的蛋白研究(交联可能干扰活性位点);
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交联剂非特异性反应,导致聚合物/异构体过多,干扰分析。
可以,使用化学交联剂是一种常见策略来促进蛋白形成二聚体(或更高聚体),尤其在原位二聚能力较弱或需验证蛋白相互作用的情况下。不过需注意以下几个关键点:
一、是否适合用交联剂形成二聚体?
交联剂适用于以下情况:
不适合的情况包括:
二、交联剂选择需考虑:
| 特征 | 推荐类型 |
|---|---|
| 与氨基反应(如Lys、N末端) | EDC、DSS、BS³ |
| 可控间距(Spacer arm) | DSS(~11 Å),BS³(~8 Å)等 |
| 水溶性/膜渗透性要求 | 水溶性:BS³;膜渗透性:DSS |
| 可逆性需求 | 某些可逆交联剂,如DSP(带有可还原二硫键) |
| 用于质谱交联分析 | 选择MS-cleavable交联剂如 DSSO、DSBU等 |
三、实验建议
1、在初步验证蛋白本身是否有自发二聚趋势(如SEC、Native PAGE、AUC)后,再设计交联实验;
2、优化交联剂浓度与反应时间,避免形成过度聚合体;
3、进行对照(无交联剂处理 vs. 加交联剂)确认二聚特异性;
4、配合变构突变(如界面突变体)验证交联是否反映真实相互作用界面。
可以使用交联剂诱导或稳定蛋白二聚,但前提是蛋白本身具备一定的二聚趋势,或有合理的结构对接界面。选择合适的交联剂和反应条件至关重要,避免非特异性高聚现象。
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