没有液氮心脏组织,离体后2分钟内就立马放入-80℃,还能做IncRNA测序吗?

    若心脏组织离体后2分钟内迅速冷冻于–80℃,在没有液氮速冻的情况下仍有可能进行lncRNA测序,但需注意以下几点:

     

    一、RNA降解风险分析

    1、组织活性高:心脏组织富含核酸酶,代谢活跃,RNA尤其是长链非编码RNA(lncRNA)在离体后极易降解。

    2、2分钟延迟:虽然时间较短,但在室温暴露期间可能已启动部分RNA降解,尤其对表达量低的lncRNA有较大影响。

     

    二、影响评估与建议

    1、RNA质量检测必做

    • RIN值(RNA Integrity Number)≥7 是测序的基本要求;

    • 建议同时查看28S/18S比值和FastQC/Fragment Analyzer图谱;

    • 低表达lncRNA的丢失可能导致测序数据偏差。

     

    2、组织处理标准建议

    • 理想状态应立即液氮速冻或RNA稳定剂(如RNAlater)预处理;

     

    三、后续建议

    若样本总数较多且该组织为唯一来源,建议:

    • 继续提取RNA并评估质量;

    • 若质量达标,可进入建库;

    • 后期分析时务必考虑样本处理方式作为潜在变量纳入分析模型。

     

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    转录组测序

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