代谢组学FAQ汇总

2.5%浓度的甘油在体外厌氧发酵体系中并非惰性成分，可能显著影响微生物群落结构和代谢产物分布。部分厌氧菌能以甘油为碳源，进而在代谢过程中产生短链脂肪酸等，导致群落选择性增殖和代谢通量偏移，从而干扰实验结果的可比性与稳定性。因此，如采用25%甘油保存粪便样本，建议在发酵前尽可能通过离心和PBS

分离血清做代谢组学时要求样本在4度冰箱静止至少30分钟，我收集样本时血液标本被放在室温二三十分钟，又过了十几分钟才将它放在4度冰箱里半小时，这会影响实验结果吗？在代谢组学检测中，血液样本的处理条件对结果的准确性至关重要。根据你描述的情况（室温放置约30-40分钟再移至4℃冰箱半小时），可能对

在代谢组学研究中，利用LC-MS技术获得的数据通常会与已知的质谱库进行匹配，这种匹配过程通常涉及到化合物识别和注释。为此，常用的分析软件包括以下几种，它们可以处理从Excel表格导入的数据并进行进一步分析：

在进行粪便代谢组学研究时，取样的质量直接影响代谢组学分析的结果，因此在粪便取样时需要遵循一定的规范，以确保样品的代表性和稳定性。以下是一些建议： 1、取样时间与频率尽量在同一时间段进行取样，尤其是在临床研究或长期跟踪研究中。对于横断面研究，尽量选择相似的时间段进行样本采集。频率：如

在你的实验设计中，每组做了 3 个平行样（即3个独立生物重复）和3个平行萃取，这实际上为你提供了很好的重复性数据。建议分别取样，即保留每个生物重复。

非靶向代谢组学（untargeted metabolomics）测序时，送混样（pooled samples）还是单样（individual samples）需要根据研究目的来确定。研究目的推荐送样方式探索差异代谢物、生物标志物单样方法预实验、概览代谢谱混样

在进行药物处理前后真菌代谢组学研究时，关键在于确保代谢状态的稳定捕捉与实验条件的一致性。建议在严格控制培养体系和处理时间的基础上，设立对照组与药物组，使用亚抑制浓度处理24小时后，立即进行低温淬灭并快速分离样品，以避免代谢变化延续影响分析结果。根据研究重点，可分别提取胞内或胞外代谢物，整个过

冻干后的代谢物应密封避光、低温（建议-20°C或-80°C）储存，防潮防氧化，可充氮或抽真空处理。容器中可加入干燥剂，避免频繁开盖。部分敏感代谢物建议尽快使用，并根据类型选择合适溶剂重新溶解。

短链脂肪酸（Short-chain fatty acids, SCFAs），如乙酸（Acetic acid）、丙酸（Propionic acid）、丁酸（Butyric acid）等，在-80°C条件下保存具有较好的稳定性。根据已有文献和实验室经验，SCFAs在-80°C可保存至少6个月至1

发SCI论文时，做代谢组学、转录组等高通量组学实验，生物学重复（biological replicates）的数量非常关键，它直接影响文章的可信度和是否能发表。以下是通用建议：

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