代谢组学FAQ汇总
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• 请问混合样本是不同小鼠随机重量的粪便样品放在一个管子里吗?
如果实验目的是做群体水平(群组)分析 比如比较处理组 vs 对照组的整体微生物组成差异、代谢物趋势等:混合样本(Pooled Sample) 通常指:从多只小鼠(一般3~5只)各取等量或比例一致的粪便(如每只取50 mg),混匀后作为一个代表该组的样本。关键点是:各个个体贡献的样本量应相对均
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用于代谢组学分析的血清样本采集,推荐使用红色盖的真空采血管(即无抗凝剂、无添加剂或含促凝剂的管),具体选择如下:一、推荐使用:1、红色盖(Red-top)管类型:无抗凝剂、无添加剂的玻璃或塑料管。特点:血液自然凝固,适合纯血清分离,避免外源化学物干扰代谢物。用途:代谢组学中背景最干净、干扰最
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• 请问从结肠中分离结肠内容物后里面的菌群能在存活多久?里面的厌氧菌是不是在空气很快就会死亡呢?
该问题涉及肠道菌群,尤其是结肠内容物中厌氧菌的存活稳定性,这是进行肠道菌群研究(如16S测序、宏基因组、培养实验等)时的关键环节。以下分点说明:1、结肠内容物中菌群在体外存活时间 菌群整体活性在暴露空气条件下迅速下降,但不等于所有菌群立即死亡;多数优势厌氧菌(如 Bacteroides, C
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复合酶提取多糖的步骤需根据原始材料(如植物、真菌或微生物)及目标多糖的结构特点进行优化,但一般流程如下所述,涵盖关键实验步骤和注意事项:一、原料预处理 干燥与粉碎:将原材料烘干(40–60°C,避免高温破坏多糖),研磨至细粉(60–100 目),增加比表面积。脱脂(可选):用石油醚或乙醇(9
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不同目的下的“活化”方法差异显著。以下按几类常见应用简要说明:一、用于微生物培养的“活化” 若甘油冻存的样品用于后续分离培养,尤其是厌氧菌或肠道共生菌:推荐步骤:1、快速解冻 取冻存样本置于37°C水浴中快速解冻,避免反复冻融造成菌群死亡。解冻后立即转入无菌条件下操作。2、去除甘油 可用无菌
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• 小鼠血清样本,一般检测中每管所需体积一般为多少微升?有三个实验组,每组需要提供多少个样本?
如果未明确提到的“检测”具体指哪类实验(如LC-MS代谢组、ELISA、免疫印迹、临床生化、转录组等),不同平台与分析内容对血清体积和样本量的需求差异显著。但基于常规实验经验,以下是几类典型检测中对小鼠血清体积和样本数量的基本要求,可供参考: 一、每管所需血清体积(按常规实验估算)
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S1P(Sphingosine-1-phosphate)属于鞘脂类代谢物,是鞘氨醇代谢通路中的关键信号分子,具有典型的脂质性质。因此,从分析方法和代谢通路分类角度来看:归类上,S1P更适合纳入“脂质组学(lipidomics)”研究范畴;方法上,脂质组学常采用靶向或非靶向LC-MS/MS方法
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• 如果要采样鱼类肠道内容物进行后续筛菌操作,运输途中应该要怎么进行保存呀?
在采集鱼类肠道内容物用于后续筛菌(分离培养微生物)的实验中,运输与保存条件对微生物活性及群落结构至关重要。以下是专业建议,适用于大多数需分离厌氧/兼性菌、好氧菌的微生物学操作场景: 运输途中保存的关键原则: 1. 保持低温(4°C)运输,抑制代谢 采样后立即放入预冷的无菌离心管或样品
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• 去野外采集叶片,想要测黄酮多糖三萜,叶片要放在液氮里面保存吗?
是的,建议采集后立即使用液氮速冻叶片,并置于-80°C保存,以最大程度稳定黄酮、多糖和三萜等次生代谢产物的含量。具体说明如下:1. 液氮速冻的必要性(1)黄酮、三萜属于小分子代谢物,多糖则为高分子产物,三者均容易受酶活性、光照、温度等影响而降解或转化。(2)叶片在采集后仍存在代谢活动,若不立
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气相色谱中“相对含量”的计算通常用于定性或半定量分析,其本质是以某一信号强度(通常为峰面积)作为化合物含量的近似指标。相对含量常见的计算方式如下: 一、常规相对含量公式(未校正) 图1 二、使用响应因子的相对含量公式(校正) 图2 百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学
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