代谢组学FAQ汇总

• • 大鼠粪便冻存6个月用于制备混悬液，应直接-80°C冻存，还是加入甘油和PBS后再冻存？若加保护剂，混悬液如何准确称取粪便质量？

  关于大鼠粪便长期（约6个月）冷冻保存以用于后续制备粪便混悬液的策略，需根据实验目的（如是否用于微生物移植、宏基因组测序或代谢组学等）决定保存方式。以下结合常规实践及样本质量控制要求，分点分析：一、冷冻保存策略比较 1、直接-80°C冷冻（不添加保护剂）适用情境：如用于代谢组学、部分基因组提取

• • 如果目前仅获得挥发性化合物的峰面积数据，想分析其种类及含量变化趋势，应如何对数据进行处理与分析呢？

  该类数据分析的核心是：特征峰整理与质量控制、数据标准化、统计比较以及模式识别。 如果已完成化合物鉴定，还可以进一步开展挥发物组成分析；如果仅有峰面积数据而无可靠定性结果，则更准确地说，应分析“特征峰”或“挥发性信号”的变化，而不是直接分析化合物种类。 一、数据预处理 1、峰筛选与对齐

• • 想要检测多糖中是否有酚类物质用什么方法呢？

  多糖样品中酚类物质的检测需结合样品复杂度与研究目的，通常按照“初筛—确认—定量”的技术路径开展。不同方法在特异性、灵敏度及适用场景上存在差异，应合理组合使用。 一、初筛：判断是否存在酚类成分 1、Folin-Ciocalteu 法（总酚测定） 基于酚羟基的还原性反应，通过分光光度法检测总酚

• • 小鼠粪便液氮速冻后存于 -80°C 两月，想用于制备粪菌液灌胃，其菌群活性是否仍足以保证移植效果？

  一、液氮速冻后转 -80°C 保存对菌群活性的影响 1、常规保存策略 在粪菌移植（FMT）中，为保持菌群活性，常用策略是：立即在厌氧条件下混合甘油（10–20%）作为保护剂；快速冷冻（液氮或干冰-乙醇浴）；长期储存于 -80°C。2、当前的操作特点 未提及是否加入保护剂（如甘油） → 若未加

• • 粪便样本用于肠道菌群16S rRNA高通量测序，采集后可以直接置于–80°C冰箱保存吗？是否可以不经过液氮速冻？

  粪便样本用于16S rRNA高通量测序的目的在于最大程度保持肠道菌群的原始组成结构，避免因采集、运输和保存过程中的细菌代谢活动或DNA降解而引入偏差。针对该问题的简要分析如下：一、–80°C保存是否可行 可以，–80°C直接保存是可接受的标准方法之一。多数肠道微生物组研究在采样后，将样本立即

• • 收集的尿液可以直接-80℃冻存，检测的时候再离心吗？

  可以，但并不总是最优选择。 是否可以直接冻存取决于您的检测目标和对数据精确度的要求。以下是详细的专业分析和建议：一、直接 -80°C 冻存（检测时再离心）的利弊 优点：1. 操作简便、省时：特别适用于现场采集或样本量巨大的情况。2. 避免中间步骤的损失或污染：减少一次离心步骤，理论上减少了因

• • 请问做靶向代谢组学检测糖酵解通路和磷酸戊糖途径时，需要加什么抑制剂吗？

  在进行靶向代谢组学检测糖酵解（Glycolysis）和磷酸戊糖途径（Pentose Phosphate Pathway, PPP）相关代谢物时，为了尽可能真实、稳定地反映细胞内代谢状态，快速终止细胞代谢活动是关键步骤。因此，是否添加抑制剂，取决于以下几点：一、是否需要加抑制剂？是的，通常建议

• • 请问六孔板中单孔细胞的产量是否能满足代谢组学分析对≥10⁷个细胞的需求？在送样时通常如何解决细胞量不足的问题？

  通常情况下，六孔板单孔很难稳定达到代谢组学常见的”≥10⁷ 个细胞“这个量级 一、六孔板单孔细胞数量的估算 常见贴壁细胞（如HEK293、HepG2、A549等）在生长良好的条件下，单孔通常可达1×10⁶ ~ 3×10⁶个细胞；高密度培养（接近汇合）或生长周期延长时，可提升至~5×10⁶；然

• • 200 万个细胞是否满足非靶向代谢组学分析的样本量需求？

  通常情况下200 万个细胞不满足非靶向代谢组学分析的样本量需求。目前，行业对非靶向代谢组学的细胞样本量有比较一致的参考标准。许多高校与科研院所实验平台，以及多个商业技术服务平台非靶向代谢组学分析的建议细胞数量都在5×106 – 1×107这个范围内，200万个细胞（2×106）低于主流实验室

• • 用于粪菌移植的粪便是一定得新鲜的吗？是否可以冻存呢？

  用于粪菌移植（FMT, Fecal Microbiota Transplantation）的粪便并不一定非得是新鲜的，可以冻存，且冻存处理已成为临床和研究中常用的标准做法之一。以下是具体分析：一、是否必须使用新鲜粪便？不必须。新鲜粪便（通常指采集后6小时内使用）在某些临床场景中会被优先选择，