代谢组学FAQ汇总
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• 小鼠粪便液氮速冻后存于 -80°C 两月,想用于制备粪菌液灌胃,其菌群活性是否仍足以保证移植效果?
一、液氮速冻后转 -80°C 保存对菌群活性的影响 1、常规保存策略 在粪菌移植(FMT)中,为保持菌群活性,常用策略是:立即在厌氧条件下混合甘油(10–20%)作为保护剂;快速冷冻(液氮或干冰-乙醇浴);长期储存于 -80°C。2、当前的操作特点 未提及是否加入保护剂(如甘油) → 若未加
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• 粪便样本用于肠道菌群16S rRNA高通量测序,采集后可以直接置于–80°C冰箱保存吗?是否可以不经过液氮速冻?
粪便样本用于16S rRNA高通量测序的目的在于最大程度保持肠道菌群的原始组成结构,避免因采集、运输和保存过程中的细菌代谢活动或DNA降解而引入偏差。针对该问题的简要分析如下:一、–80°C保存是否可行 可以,–80°C直接保存是可接受的标准方法之一。多数肠道微生物组研究在采样后,将样本立即
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可以,但并不总是最优选择。 是否可以直接冻存取决于您的检测目标和对数据精确度的要求。以下是详细的专业分析和建议:一、直接 -80°C 冻存(检测时再离心)的利弊 优点:1. 操作简便、省时:特别适用于现场采集或样本量巨大的情况。2. 避免中间步骤的损失或污染:减少一次离心步骤,理论上减少了因
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• 请问做靶向代谢组学检测糖酵解通路和磷酸戊糖途径时,需要加什么抑制剂吗?
在进行靶向代谢组学检测糖酵解(Glycolysis)和磷酸戊糖途径(Pentose Phosphate Pathway, PPP)相关代谢物时,为了尽可能真实、稳定地反映细胞内代谢状态,快速终止细胞代谢活动是关键步骤。因此,是否添加抑制剂,取决于以下几点:一、是否需要加抑制剂?是的,通常建议
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• 请问六孔板中单孔细胞的产量是否能满足代谢组学分析对≥10⁷个细胞的需求?在送样时通常如何解决细胞量不足的问题?
通常情况下,六孔板单孔很难稳定达到代谢组学常见的”≥10⁷ 个细胞“这个量级 一、六孔板单孔细胞数量的估算 常见贴壁细胞(如HEK293、HepG2、A549等)在生长良好的条件下,单孔通常可达1×10⁶ ~ 3×10⁶个细胞;高密度培养(接近汇合)或生长周期延长时,可提升至~5×10⁶;然
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• 200 万个细胞是否满足非靶向代谢组学分析的样本量需求?
通常情况下200 万个细胞不满足非靶向代谢组学分析的样本量需求。目前,行业对非靶向代谢组学的细胞样本量有比较一致的参考标准。许多高校与科研院所实验平台,以及多个商业技术服务平台非靶向代谢组学分析的建议细胞数量都在5×106 – 1×107这个范围内,200万个细胞(2×106)低于主流实验室
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用于粪菌移植(FMT, Fecal Microbiota Transplantation)的粪便并不一定非得是新鲜的,可以冻存,且冻存处理已成为临床和研究中常用的标准做法之一。以下是具体分析:一、是否必须使用新鲜粪便?不必须。新鲜粪便(通常指采集后6小时内使用)在某些临床场景中会被优先选择,
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• 粪便样品用于体外厌氧发酵实验并需寄送,请问应如何保存以避免菌群失活?
粪便样品用于体外厌氧发酵实验时,其保存运输策略需优先考虑维持活性厌氧菌群的结构与功能完整性。建议按如下方式处理与保存:一、样品采集与初步处理 采集时间控制在发酵前24小时内为佳,尽量减少常温暴露时间;在采集后立即置于厌氧条件中(如厌氧采样袋或充氮/充氩的密闭容器);可添加预冷的厌氧保护液(如
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关于非靶向代谢组学样本采集过程中“样品是否适合混合在一起”的问题,答案是:“需要”和“不需要”混样的情况都存在,这主要取决于您的具体研究目的和实验设计阶段:....
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• S1P在MeOH中初溶后析出,乙醇中不澄清,DMSO中完全不溶的原因是什么呢?
S1P在MeOH中初溶后数日析出,且在EtOH中不澄清、DMSO中完全不溶,说明其溶解状态存在如下几个关键问题,需结合其化学结构、极性特征与溶剂相容性综合判断:一、问题本质解析 1、S1P带有极性磷酸基与长链疏水尾部,兼具亲水性和疏水性,易自组装形成胶束或多聚体,对溶剂系统依赖性极强,不能视
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