代谢组学FAQ汇总

• • 现在的牦牛乳低聚糖的表征技术用的是什么方法呢？

  牛乳低聚糖，尤其是牦牛乳低聚糖，目前主要通过结合色谱与质谱技术进行结构鉴定与定量分析，具体方法包括以下几类：1、样品提取与纯化 通过蛋白沉淀、脂肪去除后，使用固相萃取（SPE）等方法分离乳糖、低聚糖及其他成分，为后续分析清洗背景干扰。2、液相色谱–电喷雾–串联质谱（LC‑ESI‑MS/MS）

• • 肠道菌群特有的代谢物有哪些?

  肠道菌群特有的代谢物主要是指由肠道微生物合成、宿主本身不能直接合成，或宿主代谢路径中显著依赖微生物参与的代谢产物。可归纳为以下几大类，具有代表性的如下：一、短链脂肪酸（Short-Chain Fatty Acids, SCFAs）主要包括：1、乙酸（Acetate）2、丙酸（Propiona

• • 气相色谱只有样品的保留时间和峰面积可以求什么数据啊？因为没有不同浓度的峰面积没办法建立标准曲线。

  在仅有样品的保留时间和峰面积、缺乏标准品浓度梯度数据的条件下，无法进行绝对定量分析，即不能准确计算各组分的质量或浓度。但在实验设计合理、峰识别清晰的前提下，仍可从这些数据中获得以下几类有意义的分析结果：   一、组分鉴定（定性） 1、保留时间（Retention Time, RT） 是气相色

• • 请问代谢组测序可以测二羟环氧苯并芘吗？

  是的，代谢组测序可以用于检测二羟环氧苯并芘，但由于其在生物样品中的浓度较低且结构复杂，通常需要采用高灵敏度的定量分析技术，如LC-MS/MS，并结合靶向代谢组学方法和内标校正，以确保检测的准确性和可靠性。   百泰派克生物科技--生物制品表征，多组学生物质谱检测优质服务商   相关服务： 代

• • PLS-DA/OPLS-DA二维图的Q2 ，还有R2y 在哪里看啊？

  在使用PLS-DA（偏最小二乘判别分析）或 OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析）分析后，Q² 和 R²Y 是两个非常关键的模型评估指标，它们通常用于判断模型的拟合程度和预测能力。   一、在进行PLS-DA或OPLS-DA分析后，Q² 和 R²Y 是评估模型性能的两个核心指标 1、R²Y

• • 请问肠道内容物在-20保存会影响非靶代谢和靶向代谢结果吗？

  在肠道内容物的代谢组学研究中，样本保存温度对非靶向代谢和靶向代谢的结果有显著影响。以下是关于-20°C保存条件对代谢组学分析影响的详细解答：   一、保存温度对代谢物稳定性的影响 1、-80°C：是代谢组学样本保存的标准温度，极低温可以最大程度地减少代谢物的降解和转化，保证代谢组学数据的准确

• • 用质谱技术做样本非靶向检测，前处理过程中取上清液脂质层如何取得均离心管底部无气泡或气泡大小均一?

  在进行质谱技术的样本非靶向检测时，为确保前处理过程中上清液脂质层的均匀获取，且避免在离心管底部出现气泡或气泡大小不一，可以采取以下步骤： 适当降低取样速度：在取样时，应尽量保持稳定的速度，避免因速度过快导致气泡的产生。此外，取样针应尽量浅插入离心管，避免触碰到离心管底部。 使用适当的取样工

• • 请问如果在差异代谢物中筛选的话，假如我有目标代谢物或者目标方向的差异代谢，我如何在我筛过的几百种离选目标代谢物？

  筛选目标代谢物的步骤如下：   一、明确筛选目标 首先，你要明确你到底在找哪类代谢物。这些代谢物可能是和某种疾病、某个身体过程有关的，或者是之前研究中提到过的重要物质。   二、按功能分类 你可以根据代谢物的功能或它们在哪个身体通路里起作用来进行筛选。比如，有些代谢物是身体制造能量时产生的，

• • 请问我的差异代谢物筛选后，kegg进行分类时，出现的其他例如人类疾病,癌症等需不需要只留代谢的kegg？

  在进行差异代谢物筛选后，使用 KEGG 进行分类时，建议根据研究的具体目标来决定是否只保留代谢相关的 KEGG 通路。如果你的研究重点是代谢物的功能和代谢途径，保留与代谢相关的 KEGG 通路会更合适；但如果你的研究也关注代谢物在疾病（如癌症）中的角色，保留人类疾病相关的通路可能会提供额外的

• • 靶向脂质组学细胞样本只做单一质谱分析，萃取剂和细胞的关系。细胞样本加多少萃取剂？

  在靶向脂质组学分析中，细胞样本的萃取剂用量取决于多个因素，包括： 1、细胞数量（细胞总量或蛋白总量） 2、所用的萃取剂体系（如 Bligh & Dyer、Folch、MTBE 等方法） 3、质谱的灵敏度与样品需求 4、是否添加内标标准品   常见萃取剂体积与细胞数量关系 1、以细胞数为基础