代谢组学FAQ汇总
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• 细胞送代谢组学,在最后一步弃上清时,误在7000g离心3min,请问该样本还可送代谢吗?
如果在细胞代谢组学样本处理时,误用了7000g离心3分钟,可能会导致细胞破裂、代谢物释放或样本污染,从而影响分析结果。具体影响取决于细胞破裂程度和样本污染情况。如果细胞未完全破裂且上清液中无明显污染,仍可进行代谢组学分析;否则,可能需要重新处理样本。建议检查样本质量或考虑重复实验以确保数据准
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判断植物激素是否具有活性通常通过多种实验方法,本文介绍了一些常见的方法,包括:生理反应测试(观察植物生长变化)、基因表达分析(检测激素响应基因)、激素受体结合实验(验证激素与受体结合)、分子生物学实验(检测信号转导活性)、色谱分析法(测定激素浓度)以及转基因植物模型(观察基因功能变化)。这些
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• 请问经过液氮速冻后放在-80度两周的大肠杆菌样本还能送测转录和代谢组学吗?
经过液氮速冻并在-80℃储存两周的大肠杆菌样本通常可用于转录组和代谢组学分析。需注意:1)样本完整性,确保未解冻;2)检测RNA质量(如RIN值);3)关注代谢物的稳定性。建议在分析前咨询技术支持,以确保最佳处理条件。
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• 我测了非靶向代谢组学但是没有设置对照组,我只是想了解里面的物质组成,请问该怎么分析呢?
在非靶向代谢组学分析中,通常你会得到大量的物质(代谢物)数据,在没有对照组的情况下,非靶向代谢组学分析仍然可以提供关于样本内物质组成的详细信息。以下是一些分析步骤,帮助你从数据中提取有用信息:
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代谢组学是一种研究生物系统中所有代谢物或小分子的科学,它是系统生物学中的一个重要分支,并在疾病诊断、药物发现和生物过程理解等领域具有重要应用。代谢组学分析的正常流程一般包括从样品采集到数据分析和结果解释的多个步骤。本文介绍了一种常见的代谢组学分析流程。
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脂肪酸的溶解性主要取决于其结构和极性。一般来说,短链脂肪酸(如乙酸、丙酸)在水中的溶解度较高,而长链脂肪酸(如硬脂酸、油酸)则更倾向于溶解在非极性溶剂中,如玉米油或其他植物油。玉米油中的脂肪酸具有较高的亲脂性,适合溶解不饱和脂肪酸。
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• 请问非靶向代谢组学筛选出的差异代谢物后续可以做哪些深入分析呢?做了通路富集之后可以从代谢通路逆推找到关键酶或者基因吗?
在非靶向代谢组学中,筛选出的差异代谢物可以通过验证、富集分析、逆推关键酶与基因以及多组学整合等方法进行深入研究。代谢通路富集后可以通过生物信息学工具逆推相关的关键酶,并结合转录组和蛋白质组等数据进一步确认候选基因与酶的作用;最终通过功能实验验证这些基因或酶在代谢调控中的具体作用。
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液相色谱可以用于分离多肽,但单独使用液相色谱通常无法有效测定多肽在血清中的代谢情况。原因在于血清中的多肽含量通常较低,且其代谢物与其他复杂的生物分子(如蛋白质、脂类等)混杂在一起,液相色谱的检测灵敏度不足以有效区分这些分子。 为了实现更准确的测定,液相色谱一般需要联用质谱(LC-MS),通
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• 请问根际微生物、根际分泌物和根际非靶向代谢可以出现在同一片文章吗?如果可以的话,那么它们的先后顺序是怎样的?
根际微生物、根际分泌物和根际非靶向代谢可以出现在同一篇文章中,这三者在植物生态系统中都起着重要的作用。它们的先后顺序可以根据文章的主题和目的来确定,但在一般情况下,可能会先从宏观的根际微生物开始讨论,接着是根际分泌物,最后是根际非靶向代谢。
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在靶向代谢组学研究中,内标(Internal Standard, IS)的添加是一个关键步骤,合理的内标添加量能够提高定量分析的准确性和重现性,实际的数量需要根据实验设计和需求来确定。一般来说,内标的数量应该足够使其在整个实验过程中都可以被准确地测量出来,但又不能过多以至于干扰对目标代谢物的
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