代谢组学FAQ汇总

• • 请问我的差异代谢物筛选后，kegg进行分类时，出现的其他例如人类疾病,癌症等需不需要只留代谢的kegg？

  在进行差异代谢物筛选后，使用 KEGG 进行分类时，建议根据研究的具体目标来决定是否只保留代谢相关的 KEGG 通路。如果你的研究重点是代谢物的功能和代谢途径，保留与代谢相关的 KEGG 通路会更合适；但如果你的研究也关注代谢物在疾病（如癌症）中的角色，保留人类疾病相关的通路可能会提供额外的

• • 靶向脂质组学细胞样本只做单一质谱分析，萃取剂和细胞的关系。细胞样本加多少萃取剂？

  在靶向脂质组学分析中，细胞样本的萃取剂用量取决于多个因素，包括： 1、细胞数量（细胞总量或蛋白总量） 2、所用的萃取剂体系（如 Bligh & Dyer、Folch、MTBE 等方法） 3、质谱的灵敏度与样品需求 4、是否添加内标标准品   常见萃取剂体积与细胞数量关系 1、以细胞数为基础

• • 气相色谱质谱里的香气成分含量怎么算呀？

  GC-MS 中香气成分的含量计算可依据实验目的选择不同策略：归一化面积法适用于香气谱图的相对比较与风味轮廓分析，操作简便但不具绝对定量能力；若需获取准确浓度，须借助外标法或内标法，前者依赖标准品建立浓度-面积关系，后者则通过内标物校正信号波动、提高定量准确性。实际应用中，应结合样品类型、组分

• • 请问血清送检需要灭活处理吗？

  血清样本是否需要灭活处理需结合感染风险、检测项目特性及送检单位的生物安全要求综合判断。为确保数据质量与人员安全，建议在明确实验目的与平台要求的基础上，选择恰当的处理方式。如检测目标对灭活敏感，应优先考虑避免处理；如存在生物安全隐患则应依照标准流程进行灭活，建议在送样前与检测平台确认具体要求以

• • 25%甘油用于保存粪便并参与发酵，浓度会影响菌体吗？

  2.5%浓度的甘油在体外厌氧发酵体系中并非惰性成分，可能显著影响微生物群落结构和代谢产物分布。部分厌氧菌能以甘油为碳源，进而在代谢过程中产生短链脂肪酸等，导致群落选择性增殖和代谢通量偏移，从而干扰实验结果的可比性与稳定性。因此，如采用25%甘油保存粪便样本，建议在发酵前尽可能通过离心和PBS

• • 分离血清做代谢组学时要求样本在4度冰箱静止至少30分钟，我收集样本时血液标本被放在室温二三十分钟，又过了十几分钟才......

  分离血清做代谢组学时要求样本在4度冰箱静止至少30分钟，我收集样本时血液标本被放在室温二三十分钟，又过了十几分钟才将它放在4度冰箱里半小时，这会影响实验结果吗？在代谢组学检测中，血液样本的处理条件对结果的准确性至关重要。根据你描述的情况（室温放置约30-40分钟再移至4℃冰箱半小时），可能对

• • 将LC-MS技术分析得到的数据与已知的质谱库进行匹配，从Excel表格中获得的化合物数据导入分析软件时，这个软件具体是什么？

  在代谢组学研究中，利用LC-MS技术获得的数据通常会与已知的质谱库进行匹配，这种匹配过程通常涉及到化合物识别和注释。为此，常用的分析软件包括以下几种，它们可以处理从Excel表格导入的数据并进行进一步分析：

• • 粪便送代谢组学，取样建议如何？

  在进行粪便代谢组学研究时，取样的质量直接影响代谢组学分析的结果，因此在粪便取样时需要遵循一定的规范，以确保样品的代表性和稳定性。以下是一些建议：   1、取样时间与频率 尽量在同一时间段进行取样，尤其是在临床研究或长期跟踪研究中。 对于横断面研究，尽量选择相似的时间段进行样本采集。 频率：如

• • 我一组做了三个平行,萃取也是三个平行,那建议从这三个平行复溶液分别取样测代谢组,还是混合后再取样?

  在你的实验设计中，每组做了 3 个平行样（即3个独立生物重复）和3个平行萃取，这实际上为你提供了很好的重复性数据。建议分别取样，即保留每个生物重复。

• • 非靶向代谢组测序最好是送混样还是单样啊?

  非靶向代谢组学（untargeted metabolomics）测序时，送混样（pooled samples）还是单样（individual samples）需要根据研究目的来确定。   研究目的 推荐送样方式 探索差异代谢物、生物标志物 单样 方法预实验、概览代谢谱 混样