代谢组学FAQ汇总

在使用PLS-DA（偏最小二乘判别分析）或 OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析）分析后，Q² 和 R²Y 是两个非常关键的模型评估指标，它们通常用于判断模型的拟合程度和预测能力。一、在进行PLS-DA或OPLS-DA分析后，Q² 和 R²Y 是评估模型性能的两个核心指标 1、R²Y

在肠道内容物的代谢组学研究中，样本保存温度对非靶向代谢和靶向代谢的结果有显著影响。以下是关于-20°C保存条件对代谢组学分析影响的详细解答：一、保存温度对代谢物稳定性的影响 1、-80°C：是代谢组学样本保存的标准温度，极低温可以最大程度地减少代谢物的降解和转化，保证代谢组学数据的准确

在进行质谱技术的样本非靶向检测时，为确保前处理过程中上清液脂质层的均匀获取，且避免在离心管底部出现气泡或气泡大小不一，可以采取以下步骤：适当降低取样速度：在取样时，应尽量保持稳定的速度，避免因速度过快导致气泡的产生。此外，取样针应尽量浅插入离心管，避免触碰到离心管底部。使用适当的取样工

筛选目标代谢物的步骤如下：一、明确筛选目标首先，你要明确你到底在找哪类代谢物。这些代谢物可能是和某种疾病、某个身体过程有关的，或者是之前研究中提到过的重要物质。二、按功能分类你可以根据代谢物的功能或它们在哪个身体通路里起作用来进行筛选。比如，有些代谢物是身体制造能量时产生的，

在进行差异代谢物筛选后，使用 KEGG 进行分类时，建议根据研究的具体目标来决定是否只保留代谢相关的 KEGG 通路。如果你的研究重点是代谢物的功能和代谢途径，保留与代谢相关的 KEGG 通路会更合适；但如果你的研究也关注代谢物在疾病（如癌症）中的角色，保留人类疾病相关的通路可能会提供额外的

在靶向脂质组学分析中，细胞样本的萃取剂用量取决于多个因素，包括： 1、细胞数量（细胞总量或蛋白总量） 2、所用的萃取剂体系（如 Bligh & Dyer、Folch、MTBE 等方法） 3、质谱的灵敏度与样品需求 4、是否添加内标标准品常见萃取剂体积与细胞数量关系 1、以细胞数为基础

GC-MS 中香气成分的含量计算可依据实验目的选择不同策略：归一化面积法适用于香气谱图的相对比较与风味轮廓分析，操作简便但不具绝对定量能力；若需获取准确浓度，须借助外标法或内标法，前者依赖标准品建立浓度-面积关系，后者则通过内标物校正信号波动、提高定量准确性。实际应用中，应结合样品类型、组分

血清样本是否需要灭活处理需结合感染风险、检测项目特性及送检单位的生物安全要求综合判断。为确保数据质量与人员安全，建议在明确实验目的与平台要求的基础上，选择恰当的处理方式。如检测目标对灭活敏感，应优先考虑避免处理；如存在生物安全隐患则应依照标准流程进行灭活，建议在送样前与检测平台确认具体要求以

2.5%浓度的甘油在体外厌氧发酵体系中并非惰性成分，可能显著影响微生物群落结构和代谢产物分布。部分厌氧菌能以甘油为碳源，进而在代谢过程中产生短链脂肪酸等，导致群落选择性增殖和代谢通量偏移，从而干扰实验结果的可比性与稳定性。因此，如采用25%甘油保存粪便样本，建议在发酵前尽可能通过离心和PBS

分离血清做代谢组学时要求样本在4度冰箱静止至少30分钟，我收集样本时血液标本被放在室温二三十分钟，又过了十几分钟才将它放在4度冰箱里半小时，这会影响实验结果吗？在代谢组学检测中，血液样本的处理条件对结果的准确性至关重要。根据你描述的情况（室温放置约30-40分钟再移至4℃冰箱半小时），可能对

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