非靶向代谢组测序最好是送混样还是单样啊?

非靶向代谢组学（untargeted metabolomics）测序时，送混样（pooled samples）还是单样（individual samples）需要根据研究目的来确定。

 

研究目的	推荐送样方式
探索差异代谢物、生物标志物	单样
方法预实验、概览代谢谱	混样
建立统计模型（PCA、OPLS-DA）	单样
控制成本、初步探索	可先混样，后续有需要再补送单样

 

1、送单样（Individual Samples）

（1）优点：

• 能进行统计分析（如差异代谢物筛选、PCA、OPLS-DA 等）
• 可以评估样本间的变异性（biological variation）
• 适合发表科研论文、发现生物标志物等

（2）缺点：

• 成本高（每个样本都要测序）

（3）适用场景：

• 明确想要比较组间差异（如病例 vs 对照）
• 想找显著差异代谢物（biomarkers）
• 有一定经费支持

 

2、送混样（Pooled Samples）

（1）优点：

• 成本低
• 可以初步了解代谢轮廓（metabolic profile）
• 可以作为质控样（QC）用于检测仪器稳定性

（2）缺点：

• 无法统计学分析，失去个体差异信息
• 不适合差异代谢物分析或建模

（3）适用场景：

• 前期摸底（exploratory stage）
• 样本量太多且经费有限
• QC用途或技术预实验
 

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