25%甘油用于保存粪便并参与发酵,浓度会影响菌体吗?
- 粪便样本保存后在发酵前用PBS或无菌盐水充分洗涤,去除甘油残留;
- 或改用低温短期保存(如 -80°C 直冻)避免甘油干预;
1、甘油作为粪便保存剂的使用浓度
甘油常用于细菌或粪便样本低温保存,其典型浓度为 10%–30%(v/v),但这部分甘油通常在解冻后应去除以避免其对后续实验体系造成影响(如代谢偏倚)。
2、体外发酵系统中甘油的最终浓度
若使用含25%甘油的样本(体积占总培养体系10%),则最终甘油浓度为 2.5%(v/v),此浓度在厌氧发酵体系中不可忽略,可能具有如下影响:
(1)微生物选择性增殖:某些产短链脂肪酸(如丙酸、丁酸)的菌种可直接利用甘油作为碳源,可能导致群落结构偏倚;
(2)代谢通量偏移:甘油代谢可改变底物消耗速率与终产物分布,影响SCFAs等关键指标的可比性;
(3)发酵基质浓度失衡:甘油作为外源小分子会稀释或干扰其他底物的相对比例,增加体系变异。
3、推荐建议
(1)若希望保持群落结构与代谢特征的“原生态”,建议:
(2)若甘油不可避免地进入体系,建议设立甘油浓度对照组(如0%、1%、2.5%),评估其对微生物多样性及代谢产物的影响;
(3)对代谢组或宏基因组结果解释时,需明确考虑甘油对特定通路(如glycerolipid metabolism、SCFA production)的影响。
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