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组蛋白 β-羟基丁酰化（Kbhb, lysine β-hydroxybutyrylation）是一种新型的翻译后修饰（PTM），是在赖氨酸残基（Lys）上连接 β-羟基丁酰基（β-hydroxybutyryl group）的一类短链脂肪酸酰化修饰。Kbhb 的发现揭示了代谢物与表观遗传调控之
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在组织样本保存中，福尔马林固定-石蜡包埋（FFPE）是一种广泛应用的标准方法，尤其在临床病理领域。然而，FFPE处理带来的蛋白质交联（crosslinking）现象，给后续的蛋白质组学分析带来了显著挑战。 一、什么是FFPE中的蛋白质交联？ FFPE样本的核心处理步骤包括： 1、使用10%
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组蛋白 β-羟基丁酰化（β-hydroxybutyrylation, Kbhb）是一种新型赖氨酸翻译后修饰，与代谢状态密切相关，已被证实参与调控染色质结构与基因表达。组蛋白 β-羟基丁酰化修饰的丰度极低，且常与乙酰化、甲基化等其他修饰共存，极易被掩盖。高效、专一的样品前处理流程，是实现高灵敏
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组蛋白磷酸化（Histone Phosphorylation）是表观遗传调控中的关键修饰方式之一。它通过改变染色质结构、招募调控蛋白或与其他组蛋白修饰协同作用，调节基因表达、DNA损伤修复和细胞周期进程等多种生物学过程。 一、组蛋白磷酸化的基本概念 组蛋白是一类带正电的碱性蛋白，DNA缠绕
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组蛋白磷酸化是一种关键的翻译后修饰，广泛参与染色质结构调控、基因表达调节和DNA损伤响应。它通过引入负电荷改变组蛋白与DNA的相互作用，并与其他修饰形成表观遗传“密码”，进而决定染色质的开放或压缩状态。特定位点如H3S10和γ-H2AX，在细胞周期和应激反应中具有重要功能，成为癌症等疾病研究
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福尔马林固定石蜡包埋（FFPE, Formalin-Fixed Paraffin-Embedded）是组织样本长期保存的金标准，广泛应用于病理学和临床研究。然而，这种处理方式也为蛋白质组学分析带来了显著挑战，尤其是在蛋白酶切效率方面。 一、福尔马林固定的化学本质及其对蛋白结构的影响 1、甲
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在真核细胞中，蛋白质分泌通路（secretory pathway）是一条高度有序的转运系统，涉及内质网（ER）、高尔基体、囊泡及细胞膜等多个细胞器。而内质网蛋白组（ER proteome），作为这条通路的“首发站”，不仅负责蛋白质合成、折叠和初步修饰，还通过复杂的质量控制与信号调节机制，直接
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内质网（Endoplasmic Reticulum, ER）是细胞内蛋白质生产与质检的核心场所：分泌蛋白与膜蛋白在这里折叠、糖基化并装配，同时 ER 还参与脂质合成与钙稳态调控。也正因为 ER 蛋白高度富集膜蛋白、糖蛋白与低丰度调控因子，内质网蛋白质组学比全细胞蛋白组更容易受到样本处理与检测
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内质网（Endoplasmic Reticulum, ER）是蛋白折叠、N-糖基化与分泌通路的核心场所，同时富含多跨膜蛋白与膜接触位点（MCS）相关复合体。要用质谱实现高质量的内质网蛋白组分析，关键不只是上机测，而是从前端开始把三件事做对：ER来源的可信富集、膜蛋白友好的样本制备、以及稳定可
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在基于 LC-MS/MS 的蛋白质组学研究中，数据采集策略直接决定了蛋白鉴定深度、定量准确性以及批次间重复性。目前应用最广泛的两种采集模式是 DDA（Data-Dependent Acquisition，数据依赖采集）与 DIA（Data-Independent Acquisition，数据
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