TMT 10-plex、11-plex、18-plex 技术解析及应用场景
随着蛋白质组学研究进入高通量和大队列时代，TMT（Tandem Mass Tag）多重标记定量技术因能在一次 LC-MS/MS 分析中同时处理多个样本，显著减少批次偏差和实验时间，被广泛用于疾病标志物筛选、药物靶点验证及多组学整合研究。当前主流的 TMT 产品线包括 10-plex、11-plex 和 18-plex，它们分别满足不同样本规模和研究需求。本文将解析这三类 TMT 技术的原理、区别及典型应用场景，并介绍如何根据项目特点选择合适方案。
一、TMT 多重标记定量的核心原理
1、TMT 标签的结构
TMT 标签由三部分构成：
（1）质量报告基团（Reporter ion）：在 MS/MS 碎裂时释放特征离子，用于不同样本的定量；
（2）质量平衡基团（Balancer）：保证不同标签在 MS1 扫描中质量一致；
（3）反应基团（Reactive group）：与肽段的 N 端或赖氨酸残基共价结合，实现标记。
2、定量过程
（1）将不同样本分别用不同的 TMT 标签标记；
（2）等量混合样本后进行 LC-MS/MS 分析；
（3）在 MS/MS 层面通过报告离子强度对各样本进行相对定量。
二、TMT 10-plex、11-plex 与 18-plex 的技术特点
1、TMT 10-plex
（1）可同时处理 10 个样本，适合中小规模项目（如常规生物学重复、基础研究）；
（2）报告离子质量分辨率需求较高（适配 Orbitrap 系统）；
（3）成本较低，广泛应用于学术研究。
2、TMT 11-plex
（1）在 10-plex 基础上新增一个通道，用作参考样本（Bridge Sample），便于跨批次标准化；
（2）常用于需要多批次拼接的大型队列项目；
（3）提高了数据一致性和跨批次可比性。
3、TMT 18-plex
（1）最新一代 TMT 技术，可在一次实验中处理多达 18 个样本，大幅提升通量；
（2）对质谱分辨率和 MS/MS 精确度要求更高（适配高端 Orbitrap 或 timsTOF Pro 平台）；
（3）非常适合大规模临床队列、药物筛选和多组学联合研究，可显著降低批次效应与实验成本。
三、三种 TMT 技术的选择策略
1、样本规模
（1）≤10 个样本：TMT 10-plex 即可满足；
（2）10–20 个样本：推荐 TMT 11-plex，并利用参考样本平衡批次；
（3）≥18 个样本或需要一次覆盖大队列：选择 TMT 18-plex，最大限度减少批次差异。
2、研究类型
（1）基础研究（信号通路、PTM 研究）：10-plex 或 11-plex 足够；
（2）临床队列或药物研究：18-plex 优势明显，可整合更多患者样本；
（3）多组学整合：18-plex 更能支持转录组、代谢组联合分析。
3、预算与设备
（1）10-plex 成本最低，适合资金有限的课题组；
（2）18-plex 需高端质谱平台（如 Orbitrap Exploris 480），但单样本成本反而更低。
四、TMT 技术的典型应用场景
1、疾病标志物发现
对比疾病组与对照组蛋白质谱，筛选候选标志物，加速早期诊断研究。
2、药物靶点验证与作用机制解析
追踪药物处理前后蛋白质动态变化，构建药物调控网络。
3、多组学联合研究
与转录组、代谢组结合，建立疾病调控模型，从系统层面理解生物机制。
4、临床转化研究
18-plex 技术可处理大队列临床样本，显著减少批次差异，适合多中心协作研究。
TMT 10-plex、11-plex 与 18-plex 技术各具优势，适用于不同规模和类型的蛋白质组学研究。选择合适的技术方案，并依托高质量的实验平台和专业的数据分析支持，是确保研究顺利推进的关键。如果您计划开展多通道 TMT 蛋白质组学研究，欢迎联系百泰派克生物科技，获取定制化的技术方案与合作咨询。
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