生信分析FAQ汇总

• • 在高效液相测分子量实验中，难溶性多糖例如琼脂，难以溶解到水或者盐流动相中，因此无法过膜，这怎么解决呢？

  在高效液相色谱（HPLC）中，如果需要测定难溶性多糖（例如琼脂）的分子量，但这些多糖难以溶解在水或常规盐流动相中，确实会遇到溶解性和过膜的问题。解决这个问题的方法可以考虑以下几种策略：   一、选择适当的溶剂系统 1、使用温度升高：琼脂等难溶性多糖在高温下溶解性较好，可以通过将样品溶解在温热

• • 细胞使用交联剂之后裂解的时候是否可以使用超声破碎细胞呢？

  细胞在使用交联剂后进行裂解时，超声破碎是可以作为一种裂解方法，但需要谨慎使用，因为交联剂的存在可能对超声破碎的效果产生一定影响。   使用建议： 1、超声强度： 在使用交联剂后进行超声破碎时，最好选择较低的超声强度并且要进行时间优化，高强度的超声波可能会导致交联剂的分解或造成非特异性损伤。

• • 请问怎么根据多肽氨基酸的序列计算氨基酸组成特征、二肽组成特征以及伪氨基酸组成特征？

  一、氨基酸组成（Amino Acid Composition, AAC） 1、原理 统计序列中20种标准氨基酸的相对频率。   2、计算公式   图1   二、二肽组成（Dipeptide Composition, DPC） 1、原理 统计所有400种可能的二肽（AA, AC, ...,

• • 我需要设计一个蛋白的N端的质粒，请问应该怎么查N端序列呀？

  要查找蛋白的N端序列，通常可以按以下步骤进行：查找蛋白的全序列，确定N端序列，信号肽预测（如果需要），参考文献或实验数据。   一、查找蛋白的全序列 1、在数据库中查找你感兴趣的蛋白质的全长序列，常用的蛋白质数据库包括 UniProt、NCBI Protein 和 PDB 等。 2、你可以通

• • 请问粪便做体外发酵可以放负八十保存吗?

  粪便可以–80°C保存用于体外发酵，但推荐添加保护剂并尽快使用；若对菌群活性要求高，仍应优先使用新鲜样本。保存和解冻时尽量维持厌氧条件，以减少菌群损失。

• • 一段基因如何同时转录翻译出多个蛋白质？

  一段基因同时转录和翻译出多个不同的蛋白质，主要依赖于基因表达调控机制，包括可变剪切、mRNA编辑、核糖体移码、内部核糖体进入位点（IRES）、多顺反子mRNA等。以下是几种可能的机制：

• • 采集好血样以后可以平放吗？必须竖起来放吗？

  在采集血样后是否需要平放或竖起来放取决于血样的类型以及后续分析的需求。

• • miRNA在生物医学上有什么实际的应用吗?

  miRNA在生物医学中的应用主要包括：作为生物标志物，用于疾病的早期诊断和预后评估；作为药物开发的靶点，推动新药设计，尤其在抗癌领域已取得进展；通过调控miRNA表达，可用于治疗心脏病和神经退行性疾病；此外，miRNA还推动了基因疗法的发展，实现更精准的个性化治疗。

• • 我只有raw原始数据，用什么软件处理才能知道蛋白序列呢？

  从RAW原始数据（例如通过质谱仪获取的文件）解析出蛋白序列，通常需要借助专业的质谱数据分析软件和数据库搜索工具。以下是常用软件推荐：   一、常用软件工具 1、用于原始数据处理的工具 （1）Thermo Fisher Xcalibur/Proteome Discoverer 专为Ther

• • HPLC测定样品浓度和百分含量的误差如何分析？

  在高效液相色谱法（HPLC）中，测定样品浓度和百分含量的误差分析是确保实验结果可靠性的重要步骤。以下是详细的误差分析步骤和方法：   一、理论误差分析 1、仪器误差 （1）流速波动：HPLC泵的流速不稳定会直接影响保留时间和峰面积，进而影响浓度测定。 （2）检测器灵敏度变化：检测器（如紫外检