生信分析FAQ汇总

• • 高效液相色谱仪进样品基线不稳，为什么会出现这种情况？

  HPLC进样时基线不稳定可能由多个因素引起，常见原因包括样品污染、流动相不均、进样系统泄漏、温度波动、泵系统不稳定和检测器故障。解决方法包括过滤或离心处理样品、确保流动相质量和脱气、检查进样系统和密封件、确保温控系统稳定、定期保养泵以及校准检测器。综合检查这些因素可帮助找出并解决基线不稳定的

• • 请问 maldi-tof ms 的操作步骤是怎么的？

  MALDI-TOF MS (基质辅助激光解吸/飞行时间质谱法) 是一种常用于生物样品物质分析的方法，通常包括以下几个关键的操作步骤：样品制备、样品引入仪器、激光解吸电离、离子加速与飞行、质谱检测、数据分析。

• • 请问载荷图biplot怎么分析？

  在生物学研究中，载荷图（Biplot）是一种图形化统计分析方法，常用于主成分分析（PCA）和多元方差分析（MANOVA）中。这种方法能够同时在二维平面上表示样本和变量，能清晰地展示样本之间和变量之间的关系。以下是载荷图分析的详细步骤：

• • 检测多糖分子量的分布情况时，动态光散射（DLS）分析的时候需要用到标准品么？

  在进行DLS分析时，虽然标准品不是必须的，但在实验校准和数据对比方面，它们有助于提高分析的准确性和可靠性。

• • 生物药二硫键/游离半胱氨酸检测对细胞量的要求是什么？

  在生物药中检测二硫键和游离半胱氨酸的过程中，细胞量的要求取决于多个因素，包括分析方法的灵敏度、目标蛋白的表达水平、以及所需的检测精度。

• • KEGG差异物质分析做完之后怎么从我关注的通路中找关键代谢物呢？

  在KEGG差异物质分析之后，找到关注通路中的关键代谢物是非常重要的步骤，尤其在理解生物系统的功能和发现潜在的生物标志物时。以下是一个参考思路，逐步帮助你找到关键代谢物。

• • 请问什么网站可以比对抗体可变区重、轻链序列呀？

  要比对抗体可变区的重链和轻链序列，可以使用一些专业的生物信息学工具和数据库。这些平台不仅能帮助你进行序列比对，还能提供抗体相关的结构和功能信息。这里介绍几个常用的网站和工具。

• • 鉴定完肽序列后怎么确定肽段是属于哪一种前体蛋白？或者说用什么软件可以分析？

  鉴定肽序列后，可以通过在已知蛋白质数据库中进行匹配搜索，并利用Mascot、Proteome Discoverer、MaxQuant、PEAKS和Sequest等生物信息学软件，结合适当的匹配和过滤参数，来确定肽段所属的前体蛋白，并通过多种工具和实验验证结果以确保鉴定的准确性和可靠性。

• • KEGG差异代谢产物通路分析如何去确定富集到这个通路上的基因就是需要通路呢？如何去判断这个基因上调或下调的变化对这条通路的影响？

  在KEGG差异代谢产物通路分析中，通过高通量测序筛选出差异表达的基因，并进行通路富集分析。结合文献和数据库资料以及实验验证，确认这些基因在通路中的作用。使用分析工具和动态模型评估基因表达变化对通路的影响，并通过实验数据进行验证。综合考虑上下游基因与代谢物的关系，结合多组学数据和具体的生物学背

• • 请问我的蛋白组kegg富集p值全大于0.1，请问我该怎么解决这个问题呢?

  在蛋白组KEGG富集分析中，若P值全大于0.1，可通过增加样本数量、提高数据质量、选择合适的背景数据库、尝试不同统计方法、调整显著性阈值，并结合多组学数据进行综合分析和可视化，来提高检测敏感性和结果显著性。