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比较蛋白质组学研究技术、定量蛋白组学和普通蛋白定量的关系,说明样品制备、分离、质谱鉴定、Label Free、TMT/iTRAQ、SILAC、DIA 和靶向验证的适用场景。
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• PRM 和 DDA 有什么区别?蛋白质组学采集模式与应用选择
比较 PRM(平行反应监测)和 DDA(数据依赖采集)的原理、优缺点、适用场景和实验设计,说明何时做发现型鉴定,何时做靶向验证。
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• iTRAQ 是相对定量还是绝对定量?原理、流程与适用场景
回答 iTRAQ 是相对定量还是绝对定量,并说明同重标签、reporter ion、4-plex/8-plex、内标肽绝对定量、TMT/SILAC/Label-free 对比和实验设计要点。
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说明蛋白质分离与鉴定技术如何通过电泳、二维电泳、HPLC、层析等方法降低样品复杂度,再用 MALDI-TOF、LC-MS/MS 和数据库检索确认蛋白身份。
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说明肽质量指纹(PMF)如何通过实验肽质量集合与数据库理论肽质量比对推断蛋白身份,并比较 PMF、MALDI-TOF 和 LC-MS/MS 的适用场景。
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说明磷酸化定量蛋白组学如何通过 TiO2、IMAC 或抗体富集磷酸化肽段,并结合 LC-MS/MS、Label-free、TMT、DIA 或 PRM 分析位点丰度变化。
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• 蛋白质一级结构测定:氨基酸序列、二硫键与质谱验证怎么做?
说明蛋白质一级结构测定如何确认氨基酸序列、N/C 端、二硫键、肽图覆盖和异常肽段,并比较 LC-MS/MS 全序列验证、Edman 测序、肽图和二硫键定位的适用场景。
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从位点层面解释蛋白翻译后修饰分析:覆盖磷酸化、糖基化、泛素化、乙酰化、甲基化、二硫键等 PTMs,说明质谱流程、修饰肽富集、结果解读和项目设计要点。
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系统解析 4D 定量蛋白质组学的技术原理、离子淌度维度、样本流程、优势、限制、应用场景和方案选择。
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• 多肽液质(LC‑MS)分析做什么:色谱分离与高分辨图谱能回答哪些问题
概括多肽 LC‑MS/MS 分析中色谱分离与 MS¹/MSⁿ 可提供的证据类型及选型提示。
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