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• • 为什么Co‑IP实验失败？常见问题及解决方案

  免疫共沉淀（Co-immunoprecipitation, 简称Co‑IP）是研究蛋白-蛋白相互作用的经典技术，因其操作相对简便、特异性强、可用于天然状态下的互作验证，广泛应用于信号通路解析、复合物构建与功能机制研究等领域。然而，尽管Co‑IP在文献中应用频繁，实验失败率却不容忽视。许多科研

• • 如何提高PPI实验结果的可靠性和可重复性？

  蛋白质之间的相互作用（Protein-Protein Interactions, PPI）在细胞信号传导、代谢调控和疾病机制中扮演关键角色。随着组学技术的发展，PPI研究已成为生命科学领域的热点。然而，受限于实验体系的复杂性与非特异性干扰，PPI实验结果常出现重复性差、假阳性高等问题。提升实

• • 如何构建和分析蛋白-蛋白相互作用网络？

  在细胞中，蛋白-蛋白相互作用（Protein-Protein Interaction, PPI）构成了生物过程的通讯枢纽。蛋白质往往不是孤立发挥功能，而是通过与其他蛋白的结合、聚集、调控，形成复杂的生物网络。所谓蛋白-蛋白相互作用网络，即是将这些分子关系以系统图谱方式表达：每个节点代表一个蛋

• • 什么是PPI预测？

  在细胞内部，蛋白质是功能执行的核心角色。然而，单个蛋白质往往难以独立完成复杂任务，大多数生物功能的实现依赖于蛋白质之间的相互作用（Protein-Protein Interactions, PPIs）。这些互作不仅参与信号转导、代谢调控、免疫应答等生命过程，更在疾病发生发展中扮演关键角色。然

• • 蛋白质相互作用（PPIs）检测方法

  在细胞中，蛋白质以动态复杂的网络方式相互作用，形成蛋白质相互作用网络（Protein-Protein Interactions, PPIs），共同调控信号转导、代谢、细胞周期乃至疾病发生发展。因此，准确解析蛋白质相互作用关系，是理解生命系统功能与病理机制的关键。 一、什么是蛋白质相互作用（

• • 基于TMT标记的磷酸化蛋白定量技术

  蛋白质磷酸化是真核细胞中最常见、最重要的翻译后修饰（Post-translational Modification, PTM）之一。它广泛参与细胞增殖、凋亡、代谢、应激响应等关键生物学过程，在癌症、自身免疫疾病、神经退行性疾病等重大疾病中扮演着核心角色。然而，磷酸化修饰具有 动态性强、丰度低

• • 磷酸化蛋白质组学中DIA与DDA技术有何不同？

  磷酸化是细胞信号转导与调控中最常见也是最关键的蛋白质翻译后修饰（PTM）之一。在蛋白质组学中，质谱（Mass Spectrometry, MS）是检测磷酸化位点的核心工具，而其中DDA和DIA是两种主流的数据采集方式。它们在磷酸肽的识别深度、定量精度、重现性等方面表现差异显著。 一、技术原

• • 不同样本类型如何影响外泌体纯化效率？（血清、血浆、尿液、唾液）

  外泌体（exosomes）作为细胞间通讯的重要介质，因其在肿瘤早筛、疾病诊断、药物递送等领域的潜力而受到广泛关注。它们广泛存在于血清、血浆、尿液、唾液等多种体液中，为液体活检提供了理想样本来源。然而，不同类型样本在外泌体的含量、背景干扰和提取难度方面存在显著差异，直接影响外泌体纯化效率和下游

• • DIA在磷酸化蛋白定量中的优势与局限有哪些？

  在蛋白质翻译后修饰（PTMs）研究中，磷酸化因其在信号转导、细胞周期调控等过程中的核心作用而备受关注。DIA（Data-Independent Acquisition）作为新一代质谱采集技术，凭借其高通量、高重现性等优势，正逐渐成为磷酸化蛋白定量的主流策略。然而，DIA在提升检测深度的同时，

• • 基于标记的磷酸化蛋白定量技术解析

  蛋白质磷酸化是一种关键的翻译后修饰（PTM），广泛参与细胞信号转导、周期调控、代谢平衡等多种生命过程。在疾病状态下，磷酸化位点的变化往往先于蛋白表达水平的变化，成为解析疾病机制、筛选药物靶点的重要线索。然而，磷酸化修饰具有动态性强、丰度低、易受干扰等特点，给组学层面的定量分析带来了巨大挑战。