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在蛋白质组学研究中，精准定量是揭示生物学差异的关键。随着多样本、多时间点设计的实验日益普遍，传统的标签自由（label-free）方法在定量一致性与通量方面逐渐暴露出局限。而TMT（Tandem Mass Tag）标记定量蛋白质组学技术，凭借其高通量、低变异性、多重样本并行分析等优势，已成为
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在现代药物研发过程中，靶点发现始终是核心挑战之一。尤其是在肿瘤、感染性疾病和自身免疫疾病等复杂病理环境中，精准识别并验证可成药靶点，是决定药物开发成败的关键因素。近年来，免疫多肽组学（Immunopeptidomics）作为质谱驱动的前沿技术，正在成为药物靶点筛选与验证的重要工具。 一、什
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抗体是现代生物医药研发的核心分子之一，其结构复杂、功能多样，对其精确表征在药物开发、机制研究及质量控制中尤为关键。过去，抗体的分析主要依赖酶联免疫吸附实验（ELISA）、毛细管电泳（CE）、Western Blot等传统方法，虽然操作简便，但在分子异构体区分、定量精度和通量能力上存在明显局限
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蛋白磷酸化作为最常见的翻译后修饰之一，在信号转导、细胞周期、凋亡等生物过程中发挥核心作用。由于磷酸肽在复杂蛋白组中通常丰度极低（<1%），直接进行LC-MS/MS分析难以实现全面覆盖。因此，在质谱分析前进行有效的磷酸肽富集成为揭示磷酸化修饰网络的关键步骤。 一、IMAC（Immobiliz
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• timsTOF Pro 在 4D DIA 蛋白组学中的应用优势
随着生物医学、药物研发和精准医疗的不断发展，蛋白组学技术正逐渐从基础研究走向临床转化。而数据无依赖采集（DIA, Data-Independent Acquisition）则因其高通量、高重现性、低缺失率等特性，在大规模蛋白质定量分析中崭露头角。但传统DIA方法仍面临“共碎片干扰严重、识别通
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膜蛋白（Membrane proteins）约占细胞蛋白质组的30%，却承担了超过60%的药物靶点功能。无论是G蛋白偶联受体（GPCRs）、离子通道，还是受体酪氨酸激酶，它们几乎都归属于膜蛋白家族。然而，在蛋白组学研究中，膜蛋白却一直是最难“攻克”的堡垒之一。 这类蛋白往往： 含有高度疏
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酰基化组学（Acylation Proteomics）作为表观遗传学和蛋白质翻译后修饰（PTM）研究的重要组成部分，随着质谱技术的快速发展，酰基化组学研究得以实现对蛋白质上多种酰基修饰的系统性分析，包括乙酰化（Acetylation）、丙酰化（Propionylation）、丁酰化（Buty
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蛋白磷酸化是最关键的翻译后修饰之一，广泛参与细胞信号转导、代谢调控、细胞周期等生物过程。随着质谱技术的发展，磷酸化蛋白质组学已成为研究信号通路动态调控机制的重要手段。然而，磷酸化修饰本身的低丰度、不稳定性以及富集效率差等问题，仍然为实验带来诸多挑战。 一、磷酸化蛋白样本准备中的常见问题 1
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Shotgun蛋白质鉴定主要通过底物消化（如胰蛋白酶）将复杂的蛋白质样本裂解为肽段，然后利用液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）进行分析，再通过数据库搜索来推测原始蛋白的组成。这种方法得名于其“霰弹枪式”的分析策略——不是逐个靶向蛋白，而是“盲打”所有可能存在的蛋白质。该技术摒弃了传统的逐个
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• 如何进行Shotgun蛋白组学样本前处理与酶切策略优化？
在Shotgun蛋白组学中，虽然质谱仪性能至关重要，但前端样本处理与蛋白酶解策略往往才是决定实验质量的第一道关卡。尤其是在面对复杂、生物学异质性强的样本类型（如组织、体液、临床样本）时，样本前处理策略是否得当，直接影响蛋白提取效率、肽段覆盖度及最终蛋白鉴定数量。 一、样本前处理 1、样本裂
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