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蛋白质是生命活动的直接执行者，研究其表达谱的动态变化对揭示生物过程、疾病机制和药物作用路径具有关键意义。随着质谱技术的不断进步，蛋白质组学从“识别为主”的初级阶段，逐步迈入“定量为核心”的高精度时代。在此背景下，SWATH-MS（Sequential Window Acquisition o
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蛋白质翻译后修饰（Post-translational Modifications, PTMs）是在蛋白质翻译完成后发生的一系列酶促共价修饰，如磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等。这些修饰调节着蛋白质的活性、定位、相互作用与降解，是维持细胞稳态和响应环境刺激的重要分子机制。然而，PTM的复杂性
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蛋白质翻译后修饰（Post-translational modifications, PTMs）是调控细胞功能的核心机制，广泛参与信号转导、细胞周期、代谢重编程等生物过程。系统研究PTMs的变化，对于揭示疾病机制和发现生物标志物具有重要意义。随着质谱技术的快速发展，翻译后修饰蛋白质组学（PT
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在蛋白质组学快速发展的今天，质谱技术已成为揭示生命活动分子机制的核心工具之一。从早期的DDA（数据依赖采集）到近年来的DIA（数据独立采集），质谱方法不断进化，推动了蛋白组数据的深度、准确度与重现性。而在DIA技术体系中，SWATH-MS（Sequential Window Acquisit
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无标记定量蛋白质组学（Label-Free Quantitative Proteomics）作为研究生物系统中蛋白表达动态变化的重要工具，已广泛应用于疾病机制研究、药物靶点发现及生物标志物筛选。在无标记定量策略中，数据依赖采集（Data-Dependent Acquisition, DDA）
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无标记蛋白质组学（Label-Free Quantitative Proteomics）因其样本通量高、操作流程相对简洁、无需昂贵试剂而被广泛应用于疾病机制研究、生物标志物发现和药物作用靶点筛选。然而，随着大规模项目的不断推进，研究者也逐渐意识到——重现性差是制约无标记定量深入应用的核心瓶颈
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在现代农业科学不断迈向精准化、智能化的背景下，解析作物及相关生物体内的分子机制，已成为推动作物育种改良、病害防控与农产品品质提升的核心路径。近年来，SWATH（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra）蛋白组学
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• 使用OpenSWATH进行SWATH蛋白组学定量分析：完整流程解析
SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra）作为基于数据独立采集（DIA）的质谱技术，近年来在蛋白组学研究中获得广泛应用。它以出色的重现性、高通量和广覆盖性，成为大规模样本定量分析的重要技术选择
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在后基因组时代，研究人员越来越关注蛋白质层面的动态变化，以弥补基因组和转录组信息的不足。质谱（Mass Spectrometry, MS）作为现代蛋白质组学研究的核心工具，不断推动生物医学研究的深度与广度。而在众多质谱采集模式中，数据非依赖采集（Data-Independent Acquis
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无标记定量蛋白质组学（Label-Free Quantitative Proteomics, LFQ）技术，凭借其样本准备简便、适用范围广泛、无标签干扰等优势，正逐渐成为生命科学研究中重要的定量手段。尤其在系统生物学、疾病机制研究、生物标志物筛选及药物研发等领域，无标记定量策略正发挥着越来越
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