蛋白分析FAQ汇总

• • 二代测序文库的接头一般都有几个不同功能序列组成？

  二代测序的文库接头由多个功能性序列组成，包括引物结合位点、多样性序列、文库标识（Barcode或Index）和平台特异序列。这些序列对于有效测序和后续数据处理至关重要。

• • 二代单端测序为何会出现3'端接头序列？

  在二代单端测序技术中，为了确保正确的测序启动和方向，通常会在目标DNA片段的两端连接短的DNA接头。这些接头为测序合成提供起始点，并在测序过程中作为固定到测序仪上的平台的锚点。因此，测序读取可能会延伸到3'端的接头，导致接头序列出现在测序结果中。这些接头序列在后续的数据分析中通常会被识别并删

• • 你好，请问纯化完后怎么去sumo标签

  详细描述了从纯化SUMO融合蛋白到使用SENP酶去除SUMO标签的整个过程，并提供了去除标签后的验证方法。

• • 请问coip样品后续想要质谱分析应该用什么洗脱液进行beads的洗脱

  为了进行CoIP后的质谱分析，本文介绍了几种常用的从beads上洗脱蛋白的方法，并提供了注意事项以确保洗脱效果和质谱分析的质量。

• • 可以分享一下蛋白鉴定的数据结果及分析方法吗？如果鉴定出几十种蛋白，该以哪个值为参考得出最优结果呢？

  介绍了蛋白质鉴定的常见数据结果，包括肽段质谱、碎片质谱、蛋白ID及覆盖率和置信度分数。同时，对如何分析这些数据，如数据库匹配、假阳性率估计和定量分析方法等进行了阐述。最后，介绍了如何选择最优结果的参考值。

• • CD检测溶液可以是有机溶剂？0.01M磷酸盐缓冲液制剂用流动相提取色谱峰正常，但用上述缓冲分裂，相关吸收波长下制剂组峰分叉为什么

  探讨了在CD检测中使用磷酸盐缓冲液时，液相色谱峰出现分裂现象的情况。讨论了溶液的要求、使用有机溶剂的注意事项，以及色谱峰分裂的可能原因，如溶液的pH、离子强度和有机成分的影响。

• • 质谱分析蛋白和蛋白之间或者预测怎么做

  1.样品准备：首先需要提取或制备包含目标蛋白质的样品。在研究蛋白质相互作用时，常用的策略是通过基因工程技术使目标蛋白质融合到一个"标签"上，然后在细胞内表达。

• • 从苦荞中提取的蛋白质用碱性蛋白酶酶解后，怎么获得酶解后的多肽，调ph到等电点、加三氯乙酸沉淀、直接离心哪种方法更好？

  评估从苦荞中获得酶解多肽的三种常用方法，分别为调整pH至等电点、加三氯乙酸（TCA）沉淀和直接离心。通过对比不同方法的优缺点，探讨其适用性和效果，以指导实验室在蛋白质处理中的选择。

• • native page跑蛋白，用什么仪器可以不染色直接看荧光蛋白？native page常用的marker有哪些

  介绍了在Native PAGE中如何利用荧光成像系统来直接观察荧光蛋白，而无需进行染色。同时，介绍了Native PAGE常用的标记物，如牛血清白蛋白、蓝色Native标记物、胞色素C、乳酸脱氢酶等，这些标记物用于验证电泳系统性能、确定电泳条件以及分子量标定。

• • Lc-ms出来的图谱，数据也会出来吗，还是说图要经过软件，转化为数据呀？

  阐述了液相色谱-质谱联用（LC-MS）技术中生成的图谱是原始数据的可视化表现，包含质荷比（m/z）和信号强度。然而，要获得更多信息，如分子结构、定量分析等，需要借助专门的数据处理软件。这些软件能够识别峰、解析数据、定量分析，并提供数据可视化和统计分析。