蛋白分析FAQ汇总

• • 从植物种子中纯化了蛋白酶，具有转化特定反应活性。但数据库里并没有该酶的比对信息，该怎么鉴定这个蛋白

  文章描述了一种综合策略来鉴定从植物种子中纯化出的未知蛋白酶。此策略结合了生物化学、分子生物学和生物信息学技术，旨在确切识别和功能性描述这种蛋白酶。

• • 测的是IOD值吗？用imagej分析灰度值？然后用目的蛋白灰度值除以所有蛋白灰度值得到的百分比就是纯度吗？

  IOD（Integrated Optical Density）值，即积分光密度，是对特定区域内的光密度的积分值，一般用于分析图像中的色彩或灰度分布。在 SDS-PAGE 蛋白质纯度分析中，可以用来测量特定蛋白质条带的强度，而这个强度通常与蛋白质的含量成正比。在SDS-PAGE分析中，我们通常

• • 你好，看您发了关于磷酸化和普通蛋白WB做法的不同，能麻烦您发一份磷酸化wb步骤吗？

  磷酸化Western Blot（WB）的步骤主要包括以下几个部分：样品制备，SDS-PAGE，转膜，封闭，抗体孵育以及检测。在磷酸化WB中，通常还需要进行一些特殊步骤以防止蛋白质去磷酸化。1.样品制备：提取含有目标蛋白的细胞或组织样本。为了防止蛋白质去磷酸化，通常需要添加磷酸酶抑制剂。2.S

• • 质谱测序中什么软件可以做de novo sequencing？

  质谱测序（Mass Spectrometry Sequencing）是一种用于鉴定蛋白质序列的方法，其中De Novo测序（De Novo Sequencing）是指通过质谱数据来重建未知蛋白质的氨基酸序列，而不依赖于已知数据库中的蛋白质序列信息。在质谱测序中，De Novo测序对于未知蛋白

• • 请问细胞体内交联和先裂解再交联有什么区别呢？

  交联(cross-linking)法通过化学反应将两个或两个以上的分子链接在一起，这种技术常常被用于固定细胞内的分子在某一时刻的相对位置，帮助研究者更好地理解细胞内的生物过程，也是蛋白质相互作用研究中的重要技术。交联试剂可以在蛋白质相互作用时将它们共价交联在一起，捕获蛋白质-

• • 你好请教些问题 亚硝基化修饰位点打不出来是什么原因呢？

  亚硝基化修饰位点打质谱打不出来，可能是由于以下几个原因： 样品制备问题： 如果你在进行样品的制备过程中出现了错误，或者样品的保存和处理不当，可能会导致亚硝基化修饰蛋白的丢失或降解。 方法选择问题： 亚硝基化修饰的位点鉴定需要专门的数据库和软件支持，如果没有

• • 蛋白质序列分析有X怎么办？

  蛋白质序列分析中如果出现X，通常表示无法确定该位置的氨基酸残基。X是蛋白质序列中的一种缺失标记，可能是由于实验或测序中的技术问题导致的。在一些情况下，X也可能表示未知的或异常的氨基酸。当蛋白质序列中出现X时，需要注意以下几点：1.确定缺失位置：首先，需要确定X所在的具体位置。这可以通过测序数

• • 气相色谱法根据峰面积和保留时间怎么求样品质量浓度?

  气相色谱法（Gas Chromatography，GC）是一种常用的分析方法，它可以根据样品中不同成分的保留时间和峰面积来分析样品的质量浓度。具体操作步骤如下：1.建立标准曲线：首先，需要测定不同浓度的标准溶液的气相色谱图谱，分别记录各组分的保留时间（Retention Time, tR）和

• • 如何纯化微管蛋白？

  微管蛋白（Microtubule proteins）是细胞骨架的主要组成部分，包括α-和β-微管蛋白亚基。纯化微管蛋白涉及多个步骤，以下是一种常用的纯化方法：1.细胞收集：首先，选择适合的细胞系，并将细胞收集在离心管中。通过离心将细胞沉淀下来，去除培养基。2.细胞破碎：将细胞悬浮在微管稳定缓

• • 做蛋白质测序时，切下来的SDS蛋白条带含有不止一条蛋白条带怎么办？

  当切下来的SDS蛋白条带含有不止一条蛋白条带时，这些条带可能代表着多个蛋白质或不同的蛋白质异构体（例如不同的翻译产物或翻译后修饰形式）。在这种情况下，需要进一步分离和纯化这些蛋白质，以便单独鉴定每个蛋白质的氨基酸序列。通常，可以使用以下方法来处理含有多个蛋白条带的SDS胶：1.SDS-PAG