蛋白分析FAQ汇总
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• 一个蛋白一个化学药物小分子可以采用GST PULL down吗?
GST Pull-Down 实验主要用来鉴定蛋白-蛋白间的相互作用。这种方法的原理是通过转基因方式将目标蛋白质与谷胱甘肽 S-转移酶(Glutathione S-transferase, GST)基因融合,利用GST蛋白与谷胱甘肽(Glutathione)的高亲和性,将GST融合蛋白与小鼠抗
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蛋白的肽链测序是指确定蛋白质中氨基酸序列的过程。它是通过将蛋白质分解为小片段(肽段),然后对这些肽段进行测序来实现的。目前常用的方法是质谱法和DNA/RNA测序方法。1.质谱法测序:A.制备样品:将蛋白质进行消化,通常使用酶(如胰蛋白酶)将蛋白质分解为小肽段。B.质谱分析:使用质谱仪对肽段进
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要寻找显著差异的蛋白质,通常需要利用生物信息学方法进行差异表达蛋白质分析,常用的生信统计方法如t检验、方差分析、Wilcoxon等,这些方法将产生每个蛋白质的差异表达值(例如,fold change,log2(fold change)等)以及统计显著性指标(如p-value或校正后的p-va
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• 荧光定量PCR检测蛋白家族各成员时,有无必要先对扩增产物进行测序,以免李代桃僵?
荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种用于快速检测和定量DNA或RNA的技术,可以在反应中引入荧光标记物,实时监测PCR产物的增加情况。对于蛋白家族各成员的检测,荧光定量PCR可以用于定量分析它们的相对表达水平,但并不能提供关于具体蛋白序列的信息。因此,对
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我们可以提供二维凝胶电泳的主要流程供您参考: 1.样品准备:首先收集和准备需要进行电泳的蛋白质样品。 2.第一维:等电聚焦(IEF):在第一维电泳中,利用蛋白质在一定pH范围内的等电点(pI,即蛋白质不带电的pH值),使蛋白质在电场中沿pH梯度运动,从而实现分离。
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以下是一种常用的从生物样品中提取细胞质和细胞核的方法,具体的细节可能会因实验的特性和目标而有所不同 : a)样品制备:首先需要制备细胞悬液。这个过程通常包括将细胞从培养皿中剥离、洗涤和悬浮在适当的缓冲液中。 b)细胞离散化:使用酶解剂或机械方法将样品中的细胞离散开。对于动物组织,常
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蛋白质测序中判断氨基酸残基的位点通常依赖于蛋白质序列的N端和C端信息,以及实验测序的结果。常用的方法有以下几种:1.Edman降解法:Edman降解法是一种经典的蛋白质测序方法,通过逐步去除N端的氨基酸并鉴定,逐渐确定蛋白质的N端序列。通过不断重复Edman降解步骤,可以获得蛋白质的完整N端
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• 质谱仪测氨基酸序列打碎多肽链后到底是怎么测序的,不应该是除了端位,剩下的都无法判断吗?
质谱法是一种强大的工具,用于测量氨基酸序列。这种方法通常涉及到使用碰撞诱导解离(CID)或其他方法(如电子转移解离,ETD)将多肽链碎裂为较小的片段,然后通过测量这些片段的质量来推断原始蛋白质的氨基酸序列。质谱法的关键步骤包括:1.电离:首先,样品被电离,通常是通过电喷雾离子源(ESI)或者
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• 交联法蛋白相互作用分析有没有具体的实验方法?怎么选择交联剂?
一、交联法蛋白相互作用分析的大致步骤主要包括交联反应、蛋白质分离和检测。以体外交联实验为例:1. 交联反应:首先将待分析的蛋白质溶液与交联剂混合,使其在适当的条件下进行交联反应。交联剂可以是化学交联剂或光敏交联剂。化学交联剂常用的有二氧化硅(DSS)、二氧化硫(Sulfo-EGS)等,光交联
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• 细菌发酵液经硫酸铵沉淀,过分子筛分离得到的一种蛋白,由于发酵液本身颜色较深,请问对N端测序有没有影响?
对N端测序可能会受到细菌发酵液颜色深的影响。在蛋白质N端测序中,常使用Edman降解法进行测序,该方法是通过逐渐从N端氨基酸残基开始,逐个去除氨基酸并进行鉴定。然而,当发酵液本身颜色较深时,可能会影响到N端测序的准确性和可靠性。颜色深的发酵液可能含有一些色素或其他干扰物质,这些物质可能会影响
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