蛋白分析FAQ汇总
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• 蛋白质谱Top-down 和 bottom-up的分析方法本质上有什么不同啊?
质谱技术是蛋白质组学(proteomics)研究中的关键技术。在蛋白质质谱领域,主要有两种分析策略:Top-down(自上而下)和Bottom-up(自下而上)。这两种方法在处理和分析蛋白质样品时有本质上的不同。 1、Top-down策略(自上而下):在Top-down
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确定蛋白质发生翻译后修饰(Post-Translational Modification, PTM)的位点通常需要采用多种实验方法和生物信息学方法相结合。以下是一些常用的方法: 1.质谱分析(Mass Spectrometry, MS):质谱分析是鉴定翻译后修饰位点的最
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• 当ph大于蛋白质的等电点的时候,蛋白质不应该带负电吗?这个时候用质谱负模式为什么检测不到?
是的,当pH大于蛋白质的等电点(pI)时,蛋白质会带负电。这是因为在这种条件下,蛋白质中带正电的氨基酸残基(如赖氨酸、精氨酸和组氨酸)的质子会丢失,而带负电的氨基酸残基(如天冬氨酸和谷氨酸)的负电荷保持不变。结果是,整个蛋白质带有负电荷。 然而,在质谱分析中,负模式很少
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抗HLA-DR抗体和抗MHC-II类分子抗体是针对不同物种中的主要组织兼容性复合物(MHC)II类分子的抗体。这两种抗体在作用和功能上有相似之处,主要的区别在于它们识别的目标物种和分子: 1.HLA-DR是人类的MHC-II类分子,其中HLA(Human Leukocy
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当然,除了质谱方法,还有其他技术可用于分析外泌体的蛋白质组。以下是几种常用的方法: 1.蛋白质印迹(Western blot):通过使用特异性抗体,Western blot 可以检测外泌体中目标蛋白质的存在和相对丰度。尽管它无法提供全面的蛋白质组信息,但对于验证某个特定
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质谱仪测量蛋白质时,并不是直接根据荷质比(m/z)来判断氨基酸。实际上,质谱仪测量的是蛋白质或肽段(蛋白质降解产物)的荷质比。通过肽段的质谱信息,可以推断出原始蛋白质的氨基酸序列。以下是质谱分析中推断蛋白质氨基酸序列的基本步骤: 1.收集肽段的一级质谱和二级质谱数据。
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• 磷酸化蛋白组研究用磷酸化抗体芯片还是TiO2富集结合质谱技术好?
磷酸化蛋白组研究中,磷酸化抗体芯片和TiO2富集结合质谱技术各有优缺点,取决于研究目标和实验条件,它们可以互相补充或独立使用。 1.磷酸化抗体芯片: 优点: 可以在蛋白质组水平上筛选磷酸化位点,适用于高通量筛选。 适合已知磷酸化位点的蛋白质研究,通过特异性
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TMT(Tandem Mass Tag)等压标记是一种质谱学技术,用于在蛋白质组学研究中定量分析蛋白质的相对丰度。TMT标记方法利用了特殊的同位素标签试剂,它们具有相同的质量,但在碎裂时产生不同的碎片离子。通过这种方法,可以同时比较多个样本中蛋白质的丰度变化。 TMT等
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1.共免疫沉淀(Co-IP): 共免疫沉淀是一种用于研究蛋白质之间相互作用的实验方法。实验过程如下: 制备细胞提取物,含有待测蛋白质。 向细胞提取物中加入特异性抗体,靶向其中一个待测蛋白质。 将抗体与蛋白质孵育,使其结合。 加入蛋白A/G磁珠,与抗体结
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高分辨质谱(High-Resolution Mass Spectrometry, HRMS)是一种能够精确测量分子相对质量的技术,它在分子量鉴定中非常有用。去卷积分析(反卷积分析)是一种用于提高质谱图中信号的分辨率和信噪比的质谱数据处理方法,这种方法 HRMS中应用广泛,可以
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