多组学分析FAQ汇总
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脂质组学和转录组学的联合分析是现代生物学中一项具有深远意义的整合研究策略,用于揭示脂质代谢与基因表达之间的复杂相互作用。这种整合不仅能加深我们对生物学系统中代谢与基因调控之间关系的理解,还能够为相关疾病机制的研究提供新的视角。
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代谢组学联合16S分析包括样本准备、样本处理、数据分析和联合分析等步骤。代谢组学使用LC-MS或GC-MS技术检测代谢物,而16S rRNA基因测序分析微生物群落结构。联合分析可探讨代谢物与微生物的关系。关于样本数量,每组3个样本可以提供初步数据,但为了保证结果的可靠性,建议每组至少5-6个
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蛋白质组学和代谢组学是两种独立且强大的生物学技术,可以从分子水平深入了解生物体的生物化学过程;整合这两个技术可以提供更全面的生物体理解。蛋白质组学和代谢组学整合分析通常包含数据获取、数据预处理、数据数据整合与分析、生物信息学与网络分析、生物学解释与验证、可视化等步骤。
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• 请问尿液标本能检查细菌吗?可以检查18s/16s/rRNA还有宏基因吗?
尿液标本可以被用来检查细菌,通常通过尿液培养和尿液显微镜检查可以检测到细菌。这种方式可以帮助医生确定病人是否有尿道感染,并可以帮助确定感染的细菌种类。对于18s/16s/rRNA的检查,也可以通过尿液样本进行。尿液宏基因组研究也是可行的。
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转录组测序与全基因组测序的区别:一是研究对象:转录组测序研究RNA,关注基因表达;全基因组测序研究DNA,关注基因序列。二是信息类型:转录组测序提供基因表达水平和转录变异信息;全基因组测序提供完整的基因组序列和变异信息。三是应用领域:转录组测序用于研究基因表达调控、转录本多样性;全基因组测序
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液氮速冻后,不能以-20°C代替-80°C长期存放。如果需要暂时使用-20°C进行存放,需要注意以下几点:时间长度:短期存放(如几天到一周)问题一般不大,但不建议长时间存放在-20°C。RNA在-20°C的降解速率比在-80°C更快,尤其是如果样本反复冻融,会导致RNA质量显著下降。储存条件
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• 请问对于野外采样测转录组实验,野外采样有何要求?比如我是否需要带橡胶手套采样,并且采的样需不需要经过处理再放入液氮罐?
对于野外采样测转录组实验,野外采样有如下要求: 1. 采样工具: 采样时需要使用无菌的工具,避免对样品造成污染。若是对植物进行采样,建议使用不锈钢剪刀;对动物进行采样,需使用尖头镊子或手术刀。所有的工具都需要事先用酒精擦拭消毒。 2. 个人防护: 为了防止人为的污染,采样人员需要穿着
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一、转录组测序步骤1.RNA提取:使用专门的试剂盒(如TRIzol或Qiagen RNAeasy)从样品中提取总RNA(包括mRNA和其他非编码RNA)。2.RNA质量和数量评估 质量控制:使用生物分析仪(如Agilent Bioanalyzer)或凝胶电泳评估RNA的完整性。定量:使用Na
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• 想问一下药物作用细菌做转录组测序,大概处理多久比较合适?
对于药物作用于细菌后进行转录组测序,处理时间通常取决于药物的作用机制和细菌的生长周期。以下是几个关键因素: 药物作用快慢:快速作用的药物(如某些抗生素)可能在几分钟到几小时内就能显著改变细菌的基因表达。对于这类药物,短时间处理(例如1-2小时)可能就足够了。 细菌的生长速率:快速生长的细菌
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• 三代全长16s,DADA2怎么和QIIME2结合分析呢?能展示一下详细的分析流程吗?
要结合使用 DADA2 和 QIIME2 分析三代全长16S rRNA序列数据,可以遵循以下步骤: 1.安装和设置: 确保已安装最新版本的 QIIME2。可以在其官网上找到安装指南。 DADA2 已作为 QIIME2 插件包含在内,无需单独安装。 2.数据导入: 使用 qiime
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