多组学分析FAQ汇总

• • 蛋白质组学和代谢组学怎么整合分析？

  蛋白质组学和代谢组学是两种独立且强大的生物学技术，可以从分子水平深入了解生物体的生物化学过程；整合这两个技术可以提供更全面的生物体理解。蛋白质组学和代谢组学整合分析通常包含数据获取、数据预处理、数据数据整合与分析、生物信息学与网络分析、生物学解释与验证、可视化等步骤。

• • 请问尿液标本能检查细菌吗?可以检查18s/16s/rRNA还有宏基因吗?

  尿液标本可以被用来检查细菌，通常通过尿液培养和尿液显微镜检查可以检测到细菌。这种方式可以帮助医生确定病人是否有尿道感染，并可以帮助确定感染的细菌种类。对于18s/16s/rRNA的检查，也可以通过尿液样本进行。尿液宏基因组研究也是可行的。

• • 这个转录组与全基因组测序有什么区别？

  转录组测序与全基因组测序的区别：一是研究对象：转录组测序研究RNA，关注基因表达；全基因组测序研究DNA，关注基因序列。二是信息类型：转录组测序提供基因表达水平和转录变异信息；全基因组测序提供完整的基因组序列和变异信息。三是应用领域：转录组测序用于研究基因表达调控、转录本多样性；全基因组测序

• • 转录组测序，请问液氮速冻后能以-20代替-80存放吗？

  液氮速冻后，不能以-20°C代替-80°C长期存放。如果需要暂时使用-20°C进行存放，需要注意以下几点：时间长度：短期存放（如几天到一周）问题一般不大，但不建议长时间存放在-20°C。RNA在-20°C的降解速率比在-80°C更快，尤其是如果样本反复冻融，会导致RNA质量显著下降。储存条件

• • 请问对于野外采样测转录组实验，野外采样有何要求？比如我是否需要带橡胶手套采样，并且采的样需不需要经过处理再放入液氮罐？

  对于野外采样测转录组实验，野外采样有如下要求：   1. 采样工具： 采样时需要使用无菌的工具，避免对样品造成污染。若是对植物进行采样，建议使用不锈钢剪刀；对动物进行采样，需使用尖头镊子或手术刀。所有的工具都需要事先用酒精擦拭消毒。   2. 个人防护： 为了防止人为的污染，采样人员需要穿着

• • 转录组测序的步骤和原理都有哪些呀

  一、转录组测序步骤1.RNA提取：使用专门的试剂盒（如TRIzol或Qiagen RNAeasy）从样品中提取总RNA（包括mRNA和其他非编码RNA）。2.RNA质量和数量评估 质量控制：使用生物分析仪（如Agilent Bioanalyzer）或凝胶电泳评估RNA的完整性。定量：使用Na

• • 想问一下药物作用细菌做转录组测序，大概处理多久比较合适？

  对于药物作用于细菌后进行转录组测序，处理时间通常取决于药物的作用机制和细菌的生长周期。以下是几个关键因素： 药物作用快慢：快速作用的药物（如某些抗生素）可能在几分钟到几小时内就能显著改变细菌的基因表达。对于这类药物，短时间处理（例如1-2小时）可能就足够了。 细菌的生长速率：快速生长的细菌

• • 三代全长16s，DADA2怎么和QIIME2结合分析呢？能展示一下详细的分析流程吗？

  要结合使用 DADA2 和 QIIME2 分析三代全长16S rRNA序列数据，可以遵循以下步骤：   1.安装和设置： 确保已安装最新版本的 QIIME2。可以在其官网上找到安装指南。 DADA2 已作为 QIIME2 插件包含在内，无需单独安装。   2.数据导入： 使用 qiime

• • 三代全长16s应该用什么软件分析？有推荐吗？

  通过三代测序技术得到16S rRNA全长序列后，可以使用以下这些软件进行数据分析：   1.QIIME 2 广泛用于微生物组数据分析，支持从质量控制到操作分类单元（OTU）分析和多样性评估的全流程。   2.Mothur 同样适用于16S rRNA序列数据的分析，提供了一套完整的工具来处

• • 真核无参转录组测序：unigene和.cds有什么区别？

  Unigene和CDS在真核无参转录组测序中分别代表了不同的概念和数据类型。1.“Unigene”: Unigene是一个用于基因注释的数据库，通过整合多个来源的EST和mRNA序列来构建，并按照基因进行聚类和分类。该数据库主要用于提供基因序列和相关注释信息的整合和分类，有助于研究人员更深入