代谢组学FAQ汇总

• • GC/MS 一天可以运行多少个样本？

  每个样品的运行时间通常为 15-60 分钟，具体取决于样品的性质和使用的 GC 方法。色谱柱温可以保持恒定（等温）或编程（“斜坡”）以预定速率升高，通常是线性的。在程序化方法中，进样之间必须有大约 5 分钟冷却时间。自动进样器可容纳 100 个样品。在计算样品数量时，某些情况下必须包括校准样

• • 什么是样品制备？

  如水、土壤、尿液、血浆等样品在分析之前必须经过“净化”程序，以便提取和浓缩更易挥发的低分子量成分。提取可通过有机溶剂或固相萃取 (SPE) 进行。如果认为有必要，可以选择特殊试剂对提取物进行衍生化。例如，热不稳定和极性羧酸基团可以用BF3 /甲醇甲基化或用市售化合物进行三甲基硅烷化。相关服务

• • GC/MS 需要多少样品？

  GCMS 自动进样器能够进样 0.1-10 μL，因此至少需要 10 μL 的样品。典型的进样量为 1 μL，最少需要 20-50 μL 的样品。通常，根据特定色谱柱的容量，应注入不超过 1 微克的溶解物。过载会导致分离性能下降，并可能导致仪器严重污染。浓缩样品可以在进样前稀释或进行“分流”

• • 我有一个样品，想做质谱。应该怎么办？

  简而言之，我的回答是：您期待什么样的化合物？是混合物吗？您知道样品的一些化学和物理特性吗？或者您是如何获取这个样本的？如果您的样品含有有机的、不耐热的，那么我们应该尝试 EI 和/或 CI。相关服务:代谢组学

• • 统计分析结果如何理解？

  单元变量统计分析:P-value,FDR,Fold-Change,Q-value等； 多元变量统计分析:PCA(用于观察样本的总体分布情况),OPLS-DA 用于组与组的对比。结合 OPLS-DA模型给出VIP值(>1)和单元变量统计分析的P-value 值(<0.05)进行差异代谢物的筛选

• • 为什么同一物质在正负离子模式下检测出的分子量不同？

  这是由于不同模式下检测到的物质的加合物（经过离子源的时带有一定电荷、具有一定质量的离子基团螯合到分析物上形成加合物）不同，也就是在不同模式下所带的基团不同，这是加合物的质荷比信息，并不是分析物的真正质荷比。相关服务:代谢组学

• • 如何对差异代谢物做进一步的筛选？

  对差异代谢物进行进一步的筛选可以得到显著差异代谢物，通常是借助fold change，P-value以及OPLS-DA的VIP值进行筛选：P值1，对 P值做排序，P值越小，差异代谢物越有意义；在P值1的范围内，对 FC 值做排序，大于2的FC，越大越有意义；小于0.5的 FC，越小越有意义。

• • 代谢组是什么？

  代谢组是指生物体内源性代谢物质的动态整体，包括核酸、蛋白质、脂类生物大分子以及其他小分子代谢物，目前主要是检测1000Da以下的物质。相关服务:代谢组学

• • 为什么赤霉素不与其他激素一同检测？

  因为正常生理条件下赤霉素的含量极低，其提取方法也比较复杂，检测价格一般也更高。故通常不和生长素一起检测。相关服务:植物激素

• • 色谱分析中使用的内标和外标有什么区别？

  内标会加入到待分析的样本中，与样本一同进行色谱分析；外标与内标相对，外标不加入待分析样品，而是与未知式样进行平行处理和检测。相关服务:代谢组学