代谢组学FAQ汇总
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• 我想做 ESI,但我的样品不溶于任何东西。你们有什么建议?
首先,做ESI需要溶解度,即使溶解度很弱。样品的溶解性可能很差,但尽管如此,一些分子还是被困在了溶剂中。所以,可以试试。溶解度是相对的……样品需要被离心和过滤以去除所有未溶解的化合物,尤其是在溶解度较差的情况下。此外,还必须考虑溶剂与流动相的混溶性。我们不希望您的样品在流动相中“崩溃”。这会
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• 我从一些地方获悉,对于 ESI 只能使用甲醇/水混合物。但我的样品不溶于该混合物,而非常溶于二氯甲烷。我应该怎么办?
那不是真的。任何溶剂都可以成功地与 ESI 一起使用。您获得该信息的原因是,在 ESI 的早期,人们主要将其用于肽和蛋白质,对于这些类型的样品,建议使用甲醇/水/1% 乙酸的混合物于正离子模式ESI。样品必须是可溶的才能通过 ESI 分析,并且必须考虑溶剂与流动相的混溶性。相关服务:代谢组学
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ESI 涵盖了大范围的样本。从低分子量极性化合物到高分子量生物聚合物如蛋白质。相关服务:代谢组学
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• 我得到了 ESI 数据,但是有一个峰值比正确的 MW 高 23 个质量单位!!
很明显这说的是正离子模式,那可能是钠加合物。有时在高 39 个质量单位时也观察到钾加合物。事实上,在某些情况下,我们会在样品中加入一些钠以促进 MNa+ 的形成。相关服务:代谢组学
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首先,少量的钠无处不在,包括在您的玻璃样品瓶中。可以考虑使用塑料小瓶或衬垫。有时,即使使用去离子水或高级溶剂,我们仍可能会看到钠加合物。如果物质对钠的亲和力很高,那么如果有钠的话,就会起作用。相关服务:代谢组学
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可以。通常仅观察正离子部分,或者如果使用负离子模式,则仅会观察到反离子 (-)。例如,如果您有一个钠盐化合物,负离子模式 ESI 将产生 [M-Na]-相关服务:代谢组学
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代谢组被定义为在细胞、器官或有机体中发现的所有代谢物的集合,而代谢物是被合成、转化或排泄的小分子并被生物用作构建模块、信号或燃料。代谢组学旨在鉴定和量化所有这些代谢物。当靶向代谢物亚类时,前缀会发生变化,例如脂质组学(疏水化合物)或离子组学(离子)。“代谢组”一词最早由 Oliver 等人于
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代谢组学可用于判断食品的质量和营养价值,还可以鉴定潜在的生物活性分子。例如,可以发现防御病原体的分子,以及与抗旱、抗寒或营养缺乏相关的代谢物。然后,在数量遗传学中使用代谢组学可以将这些代谢特征与分子标记结合起来,最终更好地理解代谢和植物性能是如何整合的,为新的选择策略铺平道路。 最近的进展甚
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代谢组学通常被定义为非靶向的,这意味着要检测的分子很少或没有先验。理想情况下,应该检测给定代谢组的每个分子。然而,由于代谢物的巨大物理和化学多样性,目前还不可能同时检测到所有代谢物。因此,必须使用补充的提取和分析方法。 核磁共振 (NMR) 和质谱 (MS) 是当今最广泛用于进行非靶向代谢组
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结构分析用于代谢物注释并为 3D 结构提供信息。二维核磁共振能够确定未知化合物的结构。例如,结构分析对于在植物中高度多样化并涉及许多机制的所谓的次级代谢物的研究至关重要。 这种鉴定首先需要分离所研究的化合物,这是一个缓慢且昂贵的步骤。然而,液相色谱和核磁共振光谱之间的耦合可以克服这一限制。L
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