代谢组学FAQ汇总

• • 代谢组是什么？

  代谢组是指生物体内源性代谢物质的动态整体，包括核酸、蛋白质、脂类生物大分子以及其他小分子代谢物，目前主要是检测1000Da以下的物质。相关服务:代谢组学

• • 为什么赤霉素不与其他激素一同检测？

  因为正常生理条件下赤霉素的含量极低，其提取方法也比较复杂，检测价格一般也更高。故通常不和生长素一起检测。相关服务:植物激素

• • 色谱分析中使用的内标和外标有什么区别？

  内标会加入到待分析的样本中，与样本一同进行色谱分析；外标与内标相对，外标不加入待分析样品，而是与未知式样进行平行处理和检测。相关服务:代谢组学

• • 同一批次的代谢组学样本可否能进行分批检测？

  同一批次的样本最好不要进行分批检测，因为不同时间仪器状态不同，尽量避免外界影响造成的批次效应。相关服务:代谢组学

• • 什么是基峰图（BPC）和总离子流图（TIC）？

  基峰图BPC（Base Peak Chromatogram）是取每个时间点质谱图中最强离子的强度值连续描绘得到的图谱；总离子流图TIC（Total Ion Chromatography）是在质谱设定的质量范围内所有离子强度的总和对时间或扫描次数所作的谱图。相关服务:代谢组学生物信息学分析

• • 什么是VIP？

  VIP(VariableImportance inProjection)即变量重要性投影,通过OPLS-DA分析,每个代谢物可以得出一个VIP值，VIP值越大,代表该物质对于区分两组所具有的贡献越大。相关服务:PLS-DA/OPLS-DA二维图

• • 非靶向代谢组学的PLS-DA和OPLS-DA分析的不同点是什么？

  OPLS-DA（Orthogonal Partial Least Squares-Discriminant Analysis）正交偏最小二乘判别在PLS-DA（Partial Least Squares-Discriminant Analysis）偏最小二乘判别的基础上进行了正交变换的矫正，

• • 代谢组学能检测到的物质含量的下限是多少？

  由于物质本身的化学性质和不同检测平台的灵敏度不同，因此 ，可能浓度相同的同一物质，一种平台能检测出来，而另一种平台检测不到；或者含量相同的不同物质用同样灵敏度的仪器，一个能检测出来，而另一个检测不出来。相关服务:代谢组学

• • 质谱时如何选择正负模式？

  根据化合物的性质来决定，碱性化合物易带正电荷，适合选择正离子模式，可以观察到不同的分子离子；酸性化合物易带负电，选择负离子模式能观察到更多的分子离子。相关服务:代谢组学

• • 如何筛选差异代谢物？

  一般同时利用单变量统计和多元变量统计模型的阈值进行差异代谢物的筛选，常用的单变量统计T检验的阈值是P1。相关服务:差异代谢产物聚类分析