代谢组学FAQ汇总

• • 利用常用的阈值（VIP＞1和P＜0.05）筛选到差异代谢物，该怎么办？

  这种情况可以考虑提高阈值，比如VIP＞1.5，或P＜0.01。或者试试对检测到的物质进行GO/KEGG通路富集分析。相关服务:PLS-DA/OPLS-DA二维图

• • PCA和OPLS-DA模型中，偏离95%置信区间的样本数据需要剔除吗

  如果是生物学重复里出现一两个偏离置信区间的样本，可以不删除，因为生物学重复本来就是为了减少误差。相关服务:PLS-DA/OPLS-DA二维图

• • PLS-DA模型交叉验证得到的Q2<0.5,该模型还能用吗？

  没有要求说Q2值小于0.5模型就不可用，只是一般认为Q2值越接近1模型预测性就越好，若Q2值小于0.5，说明可信度不高，预测的结果没那么准确。相关服务:PLS-DA/OPLS-DA二维图

• • 如何验证差异代谢物的功能？

  对找到的差异代谢物进行前期的代谢通路分析，明确其属于哪条调控通路，并对该通路上的其他分子进行功能验证。此外，还可以利用转录组和蛋白组等其他组学研究进行相互补充。相关服务:KEGG差异代谢产物通路分析

• • 代谢组学可以检测哪些样品？

  代谢组学就是对细胞、生物流体、组织或生物体内的小分子代谢物（MW<1000DA）进行大规模研究，可检测的样本有很多，比如尿液、外泌体、脑脊液、血浆、血清、唾液、淋巴液、羊水、卵泡液、膝盖滑液、眼泪、精液细胞/组织/植物/真菌/微生物/粪便及肠道内容物提取物等。相关服务:靶向代谢组学

• • 如何分析代谢组学数据？

  对于代谢组学数据可以进行PCA/PLS-DA/OPLS-DA分析、差异化合物筛选及鉴定、多组分关联分析、代谢通路分析以及多组学数据关联分析等。相关服务:代谢组学生物信息学分析

• • 选择什么生物样本类型开展临床代谢组学实验？

  选择何种类型的样本开展实验，取决于课题的研究目的和检测目标。若是想发现和验证临床诊断的生物标志物，可以选择血液、唾液、尿液以及粪便等生物样品；其次根据检测目标选取不同类型的生物样本，比如检测菌群相关代谢物，优先选择粪便或肠道内容物样本、口腔粘膜等样品。相关服务:代谢组学

• • 代谢组学选用血清还是血浆？

  血清和血浆都可用于代谢组学研究，二者含有的代谢物种类差异不大，只是不同的代谢物在两种样本中浓度差异较大，因此在同一研究中应选择同类型的血液样本。相关服务:血清代谢组学

• • 脂质组学数据分析需要做多少组平行实验？

  与蛋白质组和基因组相比，脂质组（通常是脂质代谢组）更容易发生变异。温度、时间、pH值、缓冲液成分等实验条件的微小变化均会导致脂质体的某些化合物发生较大变化。因此，平行实验组之间的实验条件应尽可能匹配。尽管采取了所有预防措施，但样品之间的差异可能也会很大。此外，LC-MS方法固有的技术变化可产

• • 您的定量是绝对的吗？您对定量有多大信心？

  除非用户特别要求，我们所有的定量方法都是相对于所使用的内部标准进行的。我们使用一套内部标准，使化学结构和HPLC保留时间尽可能与目标分析物相匹配。该方法确保了从样品中提取的分析物与其定量的标准密切匹配。因为我们对所有样品（以及不同批次的样品）的相同的目标分析物使用相同的内部标准，所以相对定量