代谢组学FAQ汇总

• • 我有一个样品，想做质谱。应该怎么办？

  简而言之，我的回答是：您期待什么样的化合物？是混合物吗？您知道样品的一些化学和物理特性吗？或者您是如何获取这个样本的？如果您的样品含有有机的、不耐热的，那么我们应该尝试 EI 和/或 CI。相关服务:代谢组学

• • 统计分析结果如何理解？

  单元变量统计分析:P-value,FDR,Fold-Change,Q-value等； 多元变量统计分析:PCA(用于观察样本的总体分布情况),OPLS-DA 用于组与组的对比。结合 OPLS-DA模型给出VIP值(>1)和单元变量统计分析的P-value 值(<0.05)进行差异代谢物的筛选

• • 为什么同一物质在正负离子模式下检测出的分子量不同？

  这是由于不同模式下检测到的物质的加合物（经过离子源的时带有一定电荷、具有一定质量的离子基团螯合到分析物上形成加合物）不同，也就是在不同模式下所带的基团不同，这是加合物的质荷比信息，并不是分析物的真正质荷比。相关服务:代谢组学

• • 如何对差异代谢物做进一步的筛选？

  对差异代谢物进行进一步的筛选可以得到显著差异代谢物，通常是借助fold change，P-value以及OPLS-DA的VIP值进行筛选：P值1，对 P值做排序，P值越小，差异代谢物越有意义；在P值1的范围内，对 FC 值做排序，大于2的FC，越大越有意义；小于0.5的 FC，越小越有意义。

• • 代谢组是什么？

  代谢组是指生物体内源性代谢物质的动态整体，包括核酸、蛋白质、脂类生物大分子以及其他小分子代谢物，目前主要是检测1000Da以下的物质。相关服务:代谢组学

• • 为什么赤霉素不与其他激素一同检测？

  因为正常生理条件下赤霉素的含量极低，其提取方法也比较复杂，检测价格一般也更高。故通常不和生长素一起检测。相关服务:植物激素

• • 色谱分析中使用的内标和外标有什么区别？

  内标会加入到待分析的样本中，与样本一同进行色谱分析；外标与内标相对，外标不加入待分析样品，而是与未知式样进行平行处理和检测。相关服务:代谢组学

• • 同一批次的代谢组学样本可否能进行分批检测？

  同一批次的样本最好不要进行分批检测，因为不同时间仪器状态不同，尽量避免外界影响造成的批次效应。相关服务:代谢组学

• • 什么是基峰图（BPC）和总离子流图（TIC）？

  基峰图BPC（Base Peak Chromatogram）是取每个时间点质谱图中最强离子的强度值连续描绘得到的图谱；总离子流图TIC（Total Ion Chromatography）是在质谱设定的质量范围内所有离子强度的总和对时间或扫描次数所作的谱图。相关服务:代谢组学生物信息学分析

• • 什么是VIP？

  VIP(VariableImportance inProjection)即变量重要性投影,通过OPLS-DA分析,每个代谢物可以得出一个VIP值，VIP值越大,代表该物质对于区分两组所具有的贡献越大。相关服务:PLS-DA/OPLS-DA二维图