代谢组学FAQ汇总
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GC-MS使用的是电子碰撞(EI)；而LC-MS使用的是电喷雾(ESI)或低频常压化学电离(APCI)。相关服务:代谢组学
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所有的设计都是为了实现实验目的，因此第一步要明确实验目的：要简单的进行定性定量检测？还是筛选差异物、关注特定物质的表达差异、还是查询代谢通路以及做多组学的关联分析等？其次进行样本采集：要检测什么物质？样本怎么采集、采集多少、用什么方法采集？最后根据实验目的选择合适的实验平台和后续分析方案，如
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膜脂或脂肪酸等溶解度较低的代谢物通常在氯仿和水中提取，溶解度较高的代谢物如碳水化合物等一般在甲醇和水进行提取。相关服务:代谢组学
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因为代谢物处在表达的最下游，不同个体间的差异和动态波动较大，所以需要生物学重复来增强数据的可靠性和说服力。相关服务:代谢组学
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样本检测前，对仪器进行调试与矫正，以保证仪器稳定工作；检测时利用内标和QC进行质控，内标可以用来观察保留时间是否偏移，并对数据做规一化处理。QC用来反映仪器在样本检测中的稳定性。相关服务:代谢组学数据质量分析
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可以从QC、内标保留时间以及物质检出率等方面进行判断，QC 稳定、样品聚类，内标保留时间偏差小，物质的检出率高等都可以说明实验没问题。相关服务:代谢组学数据质量分析
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因为预实验没有对数据进行任何处理，而正式实验时会利用QC筛选物质，QC样本中检出率30%(GC-MS)或者20%（LC-MS）的也都会被剔除掉。所以正式实验检出物质数量比预实验少很多。相关服务:代谢组学
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Fig-样本的总离子流图;name-peak匹配的名称;uniquemass-特征离子的相对分子质量;rt-出峰时间 ;similarity-跟数据库中的匹配度;area-峰面积;cas、KEGG和PubChem-三个数据库该物质的相关信息;Retention Index-仪器检测得到的该p
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1、在数据表里会删除Peaks检测到的重复物质，只保留 similarity高的检出物；2、有些物质虽然能被检出，但数据库中没有相应的数据以致无法定性，用analyte表示。相关服务:代谢组学
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H-代表N端自由氨基，-OH代表未经修饰的C端羧基。H-Hyp-OH代表-L-顺-羟基脯氨酸；H-NLE-OH是-L-去亮氨酸；焦谷氨酰缩写为PYR。天然多肽由L-氨基酸组成。D-对映体和外消旋体分别用-D-和-DL-表示。相关服务:多肽合成
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