代谢组学FAQ汇总

• • 与其他组学相比，代谢组学有什么优势？

  1、其他组学层面的微小变化在代谢物水平得到放大，2、代谢物的种类远远少于基因和蛋白，3、不需要建立复杂的数据库。相关服务:代谢组学

• • 非靶标和靶标定量怎么选择？

  如果没有感兴趣蛋白或目标蛋白，可以进行非靶标定量，检测某一特定条件下所有的代谢产物以寻找目标差异代谢物；如果有关注的目标代谢物建议选择靶标定量有针对性的对目标代谢物进行特异性检测。相关服务:代谢组学

• • 为什么非靶标代谢组学没有鉴定到关注的目标代谢物？

  因为目前的平台或技术还不具备检测样本中所有代谢物的能力，可能是目标代谢物丰度较低，也可能是已经被检测到，但是在目前的数据库中不能进行定性。相关服务:非靶向代谢组分析

• • 非靶标代谢组学需要数据库吗？常用的数据库有哪些?

  需要，常用的非靶代谢数据库有NIST、Fiehn、HMDB、KEGG、METLIN、MassBank、DrugBank、Lipidmaps等。相关服务:非靶向代谢组分析

• • HMDB和METLIN代谢组数据库有什么区别？

  HMDB数据库不支持批量搜索、代谢通量搜索和代谢化合物浓度搜索等，仅限于单个代谢产物搜索，搜索效率较低；METLIN数据库具有大量的MS/MS图谱，可以获得代谢物的分子质量和化学结构等信息。相关服务:代谢组学

• • GC-MS和LC-MS检测有何区别？

  二者在检测物的性质上存在差别，气相色谱-质谱联用GC-MS适用于分析容易气化的低极性、低沸点的易挥发的代谢物，主要为初级代谢产物；液相色谱-质谱联用LC-MS不受样品挥发性和热稳定性的影响，样品前处理非常简单，过滤后直接进样，可有效分析植物中丰富的次生代谢产物，常用于氨基酸、糖类、醇类、有机

• • GC-MS和LC-MS的离子化方式有什么不同？

  GC-MS使用的是电子碰撞(EI)；而LC-MS使用的是电喷雾(ESI)或低频常压化学电离(APCI)。相关服务:代谢组学

• • 开展代谢组学研究如何设计实验？

  所有的设计都是为了实现实验目的，因此第一步要明确实验目的：要简单的进行定性定量检测？还是筛选差异物、关注特定物质的表达差异、还是查询代谢通路以及做多组学的关联分析等？其次进行样本采集：要检测什么物质？样本怎么采集、采集多少、用什么方法采集？最后根据实验目的选择合适的实验平台和后续分析方案，如

• • 代谢物如何提取?

  膜脂或脂肪酸等溶解度较低的代谢物通常在氯仿和水中提取，溶解度较高的代谢物如碳水化合物等一般在甲醇和水进行提取。相关服务:代谢组学

• • 代谢组学为什么需要这么多生物学重复？

  因为代谢物处在表达的最下游，不同个体间的差异和动态波动较大，所以需要生物学重复来增强数据的可靠性和说服力。相关服务:代谢组学