代谢组学FAQ汇总

• • 为什么正式实验检出的代谢物与预实验相差很多？

  因为预实验没有对数据进行任何处理，而正式实验时会利用QC筛选物质，QC样本中检出率30%(GC-MS)或者20%（LC-MS）的也都会被剔除掉。所以正式实验检出物质数量比预实验少很多。相关服务:代谢组学

• • GC数据表的表头分别表示什么？

  Fig-样本的总离子流图;name-peak匹配的名称;uniquemass-特征离子的相对分子质量;rt-出峰时间 ;similarity-跟数据库中的匹配度;area-峰面积;cas、KEGG和PubChem-三个数据库该物质的相关信息;Retention Index-仪器检测得到的该p

• • 为什么定性鉴定到的代谢物数量少？

  1、在数据表里会删除Peaks检测到的重复物质，只保留 similarity高的检出物；2、有些物质虽然能被检出，但数据库中没有相应的数据以致无法定性，用analyte表示。相关服务:代谢组学

• • 多肽合成—合成肽中的氨基酸怎么表示？

  H-代表N端自由氨基，-OH代表未经修饰的C端羧基。H-Hyp-OH代表-L-顺-羟基脯氨酸；H-NLE-OH是-L-去亮氨酸；焦谷氨酰缩写为PYR。天然多肽由L-氨基酸组成。D-对映体和外消旋体分别用-D-和-DL-表示。相关服务:多肽合成

• • 多肽合成—L-和D-对映体是什么意思？

  除甘氨酸外，所有的α-氨基酸都是不对称分子。它们可以以两种形式获得，称为对映体。对映体的生物活性差别很大。D-对映异构体 (D: dexter) 代表 L-对映异构体 (L: laevus) 的镜像。 D-和L-对映异构体的物理性质没有区别。大多数L-氨基酸使光线逆时针旋转。相关服务:多肽合

• • 多肽合成—生物素（或 FITC）的 C 端标记是否可行？

  可以。生物素（或 FITC）的 C 末端标记是通过在肽的 C 末端添加赖氨酸残基来完成的，并且生物素（或 FITC）通过酰胺键连接到赖氨酸侧链。赖氨酸的正电荷被去除。相关服务:多肽合成

• • 多肽合成—什么是MAP？

  MAPS 或多抗原肽是一种支链肽，其中线性肽链通过多聚赖氨酸核心在其 C 端连接，从而增加整个分子的大小。这样做是为了消除肽与 KLH 的偶联。然而，MAP上肽的构象似乎不太灵活，通过 MAP 获得的抗体通常比通过常规 KLH 偶联获得的抗体识别靶蛋白的频率更低。此外，制作 MAPS 时不会

• • 多肽合成—为什么我的 KLH 偶联肽溶液出现浑浊？

  KLH 或 Keyhole Limpet Hemocyanin 是一种大型聚集蛋白 (MW = 4×10 5-1×10 7)。 由于其大小和结构，其在水中的溶解度有限，导致外观浑浊。 不影响免疫原性，混浊液可用于免疫分析。相关服务:多肽合成

• • 多肽合成—粗肽和脱盐肽的纯度是多少？ 如何纯化肽？ 杂质是什么？

  对于15aa以下正常序列的短肽，粗品级的HPLC浓度一般为40-60%；脱盐级的HPLC浓度一般为50-70%。肽越长，粗品或脱盐的纯度越低。肽通常通过 HPLC 使用水和乙腈梯度进行纯化。大多数杂质是片段或缺失肽、不完全去保护的肽以及残留的盐和水。相关服务:多肽合成

• • 多肽合成—研究级定制肽的批次间一致性如何？

  研究级定制肽的质量控制有限（仅限 MS 和 HPLC 分析）。 因此，在所需的肽含量、盐含量、水含量、杂质、溶解度等方面，批次之间的差异是预期的。但这种批次之间的差异不会对大多数实验造成问题。但是，如果您从事敏感的生物测定，并且希望最大限度地减少批次间的差异，您应该要求额外的质量控制和分析（