代谢组学FAQ汇总

• • 为什么非靶标代谢组学没有鉴定到关注的目标代谢物？

  因为目前的平台或技术还不具备检测样本中所有代谢物的能力，可能是目标代谢物丰度较低，也可能是已经被检测到，但是在目前的数据库中不能进行定性。相关服务:非靶向代谢组分析

• • 非靶标代谢组学需要数据库吗？常用的数据库有哪些?

  需要，常用的非靶代谢数据库有NIST、Fiehn、HMDB、KEGG、METLIN、MassBank、DrugBank、Lipidmaps等。相关服务:非靶向代谢组分析

• • HMDB和METLIN代谢组数据库有什么区别？

  HMDB数据库不支持批量搜索、代谢通量搜索和代谢化合物浓度搜索等，仅限于单个代谢产物搜索，搜索效率较低；METLIN数据库具有大量的MS/MS图谱，可以获得代谢物的分子质量和化学结构等信息。相关服务:代谢组学

• • GC-MS和LC-MS检测有何区别？

  二者在检测物的性质上存在差别，气相色谱-质谱联用GC-MS适用于分析容易气化的低极性、低沸点的易挥发的代谢物，主要为初级代谢产物；液相色谱-质谱联用LC-MS不受样品挥发性和热稳定性的影响，样品前处理非常简单，过滤后直接进样，可有效分析植物中丰富的次生代谢产物，常用于氨基酸、糖类、醇类、有机

• • GC-MS和LC-MS的离子化方式有什么不同？

  GC-MS使用的是电子碰撞(EI)；而LC-MS使用的是电喷雾(ESI)或低频常压化学电离(APCI)。相关服务:代谢组学

• • 开展代谢组学研究如何设计实验？

  所有的设计都是为了实现实验目的，因此第一步要明确实验目的：要简单的进行定性定量检测？还是筛选差异物、关注特定物质的表达差异、还是查询代谢通路以及做多组学的关联分析等？其次进行样本采集：要检测什么物质？样本怎么采集、采集多少、用什么方法采集？最后根据实验目的选择合适的实验平台和后续分析方案，如

• • 代谢物如何提取?

  膜脂或脂肪酸等溶解度较低的代谢物通常在氯仿和水中提取，溶解度较高的代谢物如碳水化合物等一般在甲醇和水进行提取。相关服务:代谢组学

• • 代谢组学为什么需要这么多生物学重复？

  因为代谢物处在表达的最下游，不同个体间的差异和动态波动较大，所以需要生物学重复来增强数据的可靠性和说服力。相关服务:代谢组学

• • 代谢组学分析有哪些质控手段？

  样本检测前，对仪器进行调试与矫正，以保证仪器稳定工作；检测时利用内标和QC进行质控，内标可以用来观察保留时间是否偏移，并对数据做规一化处理。QC用来反映仪器在样本检测中的稳定性。相关服务:代谢组学数据质量分析

• • 如何判断代谢组学实验没问题？

  可以从QC、内标保留时间以及物质检出率等方面进行判断，QC 稳定、样品聚类，内标保留时间偏差小，物质的检出率高等都可以说明实验没问题。相关服务:代谢组学数据质量分析