代谢组学FAQ汇总
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因为代谢物处在表达的最下游,不同个体间的差异和动态波动较大,所以需要生物学重复来增强数据的可靠性和说服力。相关服务:代谢组学
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样本检测前,对仪器进行调试与矫正,以保证仪器稳定工作;检测时利用内标和QC进行质控,内标可以用来观察保留时间是否偏移,并对数据做规一化处理。QC用来反映仪器在样本检测中的稳定性。相关服务:代谢组学数据质量分析
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可以从QC、内标保留时间以及物质检出率等方面进行判断,QC 稳定、样品聚类,内标保留时间偏差小,物质的检出率高等都可以说明实验没问题。相关服务:代谢组学数据质量分析
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因为预实验没有对数据进行任何处理,而正式实验时会利用QC筛选物质,QC样本中检出率30%(GC-MS)或者20%(LC-MS)的也都会被剔除掉。所以正式实验检出物质数量比预实验少很多。相关服务:代谢组学
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Fig-样本的总离子流图;name-peak匹配的名称;uniquemass-特征离子的相对分子质量;rt-出峰时间 ;similarity-跟数据库中的匹配度;area-峰面积;cas、KEGG和PubChem-三个数据库该物质的相关信息;Retention Index-仪器检测得到的该p
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1、在数据表里会删除Peaks检测到的重复物质,只保留 similarity高的检出物;2、有些物质虽然能被检出,但数据库中没有相应的数据以致无法定性,用analyte表示。相关服务:代谢组学
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H-代表N端自由氨基,-OH代表未经修饰的C端羧基。H-Hyp-OH代表-L-顺-羟基脯氨酸;H-NLE-OH是-L-去亮氨酸;焦谷氨酰缩写为PYR。天然多肽由L-氨基酸组成。D-对映体和外消旋体分别用-D-和-DL-表示。相关服务:多肽合成
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除甘氨酸外,所有的α-氨基酸都是不对称分子。它们可以以两种形式获得,称为对映体。对映体的生物活性差别很大。D-对映异构体 (D: dexter) 代表 L-对映异构体 (L: laevus) 的镜像。 D-和L-对映异构体的物理性质没有区别。大多数L-氨基酸使光线逆时针旋转。相关服务:多肽合
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• 多肽合成—生物素(或 FITC)的 C 端标记是否可行?
可以。生物素(或 FITC)的 C 末端标记是通过在肽的 C 末端添加赖氨酸残基来完成的,并且生物素(或 FITC)通过酰胺键连接到赖氨酸侧链。赖氨酸的正电荷被去除。相关服务:多肽合成
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MAPS 或多抗原肽是一种支链肽,其中线性肽链通过多聚赖氨酸核心在其 C 端连接,从而增加整个分子的大小。这样做是为了消除肽与 KLH 的偶联。然而,MAP上肽的构象似乎不太灵活,通过 MAP 获得的抗体通常比通过常规 KLH 偶联获得的抗体识别靶蛋白的频率更低。此外,制作 MAPS 时不会
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