代谢组学FAQ汇总
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脂质组学领域包括对脂质组的复杂分析,即给定细胞、组织、生物或生态系统内的完整脂质谱。脂质组学还研究脂质或脂质组与其他分子(例如蛋白质、代谢物、聚糖或其他脂质)的相互作用。相关服务:脂质代谢组学
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脂质组学测量中使用了各种分析技术,主要包括以下技术: 质谱 (MS):一种分析技术,可电离化学物质并根据离子的质荷比对离子进行分类。脂质组MS测量可以在有或没有色谱分离的情况下进行。 Shotgun-MS: 鸟枪法(Shotgun) 脂质组学是将脂质样品直接注入质谱仪,在引入之前不进行分离。
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在脂质组学中,存在大量等压分子种类(分子式和重量相同但空间构型不同的化合物)。一些物种也是等元素的,因为它们具有相同的元素组成但是不同的化学物种。 由于物种之间的高度相似性,存在高度的光谱重叠,这不能简单地通过高分辨率技术来解决。开发合适的新技术既困难又耗时,将新技术引入实验室本身就是一个挑
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脂质失衡与肥胖、动脉粥样硬化、阿尔茨海默氏症等疾病有关,但脂质组学也可用于研究癌症、神经精神疾病、心血管疾病、肾脏疾病和呼吸系统疾病。在这些情况下识别代谢生物标志物对于鉴定、管理和治疗每种疾病很重要。相关服务:脂质代谢组学
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1、其他组学层面的微小变化在代谢物水平得到放大,2、代谢物的种类远远少于基因和蛋白,3、不需要建立复杂的数据库。相关服务:代谢组学
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如果没有感兴趣蛋白或目标蛋白,可以进行非靶标定量,检测某一特定条件下所有的代谢产物以寻找目标差异代谢物;如果有关注的目标代谢物建议选择靶标定量有针对性的对目标代谢物进行特异性检测。相关服务:代谢组学
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因为目前的平台或技术还不具备检测样本中所有代谢物的能力,可能是目标代谢物丰度较低,也可能是已经被检测到,但是在目前的数据库中不能进行定性。相关服务:非靶向代谢组分析
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需要,常用的非靶代谢数据库有NIST、Fiehn、HMDB、KEGG、METLIN、MassBank、DrugBank、Lipidmaps等。相关服务:非靶向代谢组分析
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HMDB数据库不支持批量搜索、代谢通量搜索和代谢化合物浓度搜索等,仅限于单个代谢产物搜索,搜索效率较低;METLIN数据库具有大量的MS/MS图谱,可以获得代谢物的分子质量和化学结构等信息。相关服务:代谢组学
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二者在检测物的性质上存在差别,气相色谱-质谱联用GC-MS适用于分析容易气化的低极性、低沸点的易挥发的代谢物,主要为初级代谢产物;液相色谱-质谱联用LC-MS不受样品挥发性和热稳定性的影响,样品前处理非常简单,过滤后直接进样,可有效分析植物中丰富的次生代谢产物,常用于氨基酸、糖类、醇类、有机
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