代谢组学FAQ汇总

• • PLS-DA/OPLS-DA二维图的q2是负数，是为什么？

  Q2值是PLS-DA和OPLS-DA模型中描述模型预测能力的关键统计量。负的Q2值可能意味着模型的预测能力差或存在过度拟合。本文探讨了导致负Q2值的潜在原因，并提供了相应的解决建议。

• • 测胆盐培养基中胆汁酸的含量，菌液怎么前处理？

  本文描述了从胆盐培养基中收集菌液样本并进行前处理的标准步骤，以便后续的胆汁酸含量测定。前处理步骤包括离心分离、滤过处理、有机溶剂萃取、浓缩和pH调整。

• • 请问多糖甲基化的具体方法吗，比如加多少样以及在什么样的温度下？

  描述了多糖甲基化的过程，包括样品准备、溶解、甲基化、加热、终止反应、提取和净化步骤

• • 非靶代谢组学TOP分析仪，想确定数据中的降噪水平，怎么设置

  确定非靶代谢组学TOP分析仪数据的降噪水平的策略和建议，重点在于使用信噪比、软件工具以及数据验证来确保数据质量。

• • 筛选出差异菌与差异代谢物并校正后进行关联分析应该录入那些数据？

  在进行微生物组和代谢组的研究时，关联分析是一个关键的步骤，它有助于揭示菌群与代谢产物之间的潜在关系。为了得到准确的关联结果，首先需要对原始数据进行筛选，选出差异显著的菌和代谢物。

• • 多糖纯化和检测的方法

  多糖纯化包括凝胶层析、离心过滤、离子交换层析、亲和层析等，以分离和纯化多糖。多糖的检测方法包括酶法、光谱法、质谱法、核磁共振、甲基化分析、红外光谱等，用于获取多糖的结构、性质和相互作用信息。

• • 用deae柱过完多糖之后透析，怎么选择透析袋截留分子量？测多糖分子量大小怎么操作？

  透析袋的选择主要取决于你想要保留的分子的大小。透析袋的规格通常由它的截留分子量 (Molecular Weight Cut Off, MWCO) 决定，这个数值表示只有小于这个分子量的物质才能通过透析袋的膜。因此，你需要选择一个MWCO比你想要保留的分子的分子量稍小的透析袋。例如，如果你想要

• • 灵芝多糖用DMSO融化有步骤吗？

  灵芝多糖是从灵芝中提取得到的一种多糖类化合物，通常是以固体形式存在的，它在一些生物活性研究和药物开发中具有重要作用。对于灵芝多糖的溶解，常用的溶解剂之一是二甲基亚砜（DMSO）。以下是将灵芝多糖用DMSO融化的步骤： 1.准备样品：将灵芝多糖制备成粉末状。可以通过冷冻干燥等方法将灵芝多糖溶

• • 用多糖做cck8要先灭菌吗？自己冻干的多糖如何灭菌，能过滤膜或者高压吗？

  先来说第一个问题，关于灭菌的必要性，我们需要明确的是在进行细胞实验时，是需要严格灭菌的，以防止可能存在的细菌或其他微生物的污染。CCK-8实验也不例外。 过滤灭菌和高压灭菌都是常用的多糖灭菌方法，它们各自也有不同之处： • 过滤灭菌：适用于溶液型的多糖。如果多糖溶液的粘度不是特别高，并且

• • 请教一下怎么分析非靶代谢组学结果

  分析非靶代谢组学(non-targeted metabolomics)结果是一个复杂的过程，涉及一系列生物信息学步骤： 1. 数据预处理 • 数据清洗：删除噪声和无关的信息。 • 峰值检测和对齐：检测代谢物的峰值，并在不同样品之间对其进行对齐。 • 归一化和标准化：消除由于实验条件或仪器