代谢组学FAQ汇总

• • 请问三甲胺，氧化三甲胺类物质选血清还是血浆做代谢比较好呀

  在进行三甲胺和氧化三甲胺的代谢研究时，需要考虑其在体内的形态以及测量目的。血浆可以反映体内的总体浓度，而血清则更偏向于反映其自由状态的浓度。通常情况下，多数的代谢物分析在临床上都选用血浆。

• • 粪便样品代谢物中具有紫外吸收的物质多吗？

  粪便样品中含有大量具有紫外吸收性质的代谢物。这些物质来源于未被吸收的食物残渣、微生物代谢以及其他身体代谢过程。通过紫外吸收光谱，我们可以分析和鉴定这些物质，为进一步的生物化学和生理学研究提供有价值的信息。

• • 请问多糖分子怎么计算，不太懂葡聚糖标准品的标准曲线怎么做

  描述了如何利用凝胶渗透色谱（GPC/SEC）来计算多糖的分子量，并介绍了如何使用已知分子量的葡聚糖标准品来制作标准曲线，从而为实验室中的多糖分析提供了技术指导 。

• • PLS-DA/OPLS-DA二维图的q2是负数，是为什么？

  Q2值是PLS-DA和OPLS-DA模型中描述模型预测能力的关键统计量。负的Q2值可能意味着模型的预测能力差或存在过度拟合。本文探讨了导致负Q2值的潜在原因，并提供了相应的解决建议。

• • 测胆盐培养基中胆汁酸的含量，菌液怎么前处理？

  本文描述了从胆盐培养基中收集菌液样本并进行前处理的标准步骤，以便后续的胆汁酸含量测定。前处理步骤包括离心分离、滤过处理、有机溶剂萃取、浓缩和pH调整。

• • 请问多糖甲基化的具体方法吗，比如加多少样以及在什么样的温度下？

  描述了多糖甲基化的过程，包括样品准备、溶解、甲基化、加热、终止反应、提取和净化步骤

• • 非靶代谢组学TOP分析仪，想确定数据中的降噪水平，怎么设置

  确定非靶代谢组学TOP分析仪数据的降噪水平的策略和建议，重点在于使用信噪比、软件工具以及数据验证来确保数据质量。

• • 筛选出差异菌与差异代谢物并校正后进行关联分析应该录入那些数据？

  在进行微生物组和代谢组的研究时，关联分析是一个关键的步骤，它有助于揭示菌群与代谢产物之间的潜在关系。为了得到准确的关联结果，首先需要对原始数据进行筛选，选出差异显著的菌和代谢物。

• • 多糖纯化和检测的方法

  多糖纯化包括凝胶层析、离心过滤、离子交换层析、亲和层析等，以分离和纯化多糖。多糖的检测方法包括酶法、光谱法、质谱法、核磁共振、甲基化分析、红外光谱等，用于获取多糖的结构、性质和相互作用信息。

• • 用deae柱过完多糖之后透析，怎么选择透析袋截留分子量？测多糖分子量大小怎么操作？

  透析袋的选择主要取决于你想要保留的分子的大小。透析袋的规格通常由它的截留分子量 (Molecular Weight Cut Off, MWCO) 决定，这个数值表示只有小于这个分子量的物质才能通过透析袋的膜。因此，你需要选择一个MWCO比你想要保留的分子的分子量稍小的透析袋。例如，如果你想要