代谢组学FAQ汇总
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当代谢组学结果出来后,我们可以采取一系列的进一步验证措施来确保结果的可靠性和准确性: 1. 重复实验: 重复实验是验证结果的基本步骤。通过重复实验,我们可以检查结果的可重复性和稳定性。至少应该进行三次独立实验来验证结果。 2. 标准品验证: 代谢组学研究中常用的是质谱技术,因此可以使用已
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• 代谢组学究竟是一门什么样的研究方向,与传统蛋白质组学有什么区别,如何看待代谢组学的前景?
代谢组学是一门研究生物体在特定生理或病理状态下的代谢物谱的学科。代谢物是参与代谢途径中的小分子,包括各种氨基酸、核酸、糖类和脂肪酸等。它们是细胞活动的直接产物,因此能够为我们提供关于细胞生理和功能状态的详细信息。通过分析生物体内代谢产物的种类和量,代谢组学旨在揭示代谢网络的整体状态,从而更深
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气相色谱(GC)分析脂肪酸时,通常首选的是用于长链非极性或弱极性化合物分析的柱子。以下是几种常用于脂肪酸分析的气相色谱柱: 1.分子筛柱: 如SP-2560,特点是具有高的极性和相对长的柱长度(通常为100m),适合于长链脂肪酸的分离。 2.氰丙基硅胶柱: 如CP-Sil 88或HP-8
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当你手上已经有了代谢组学的分析结果,那么如何获取有效信息及其解释就成为关键。你可以从以下这几个方面着手: 1.显著差异的代谢物: 通常,你会得到一个代谢物列表,这些代谢物在不同的实验组或条件之间有显著差异。注意查看每个代谢物的p值、校正后的p值(如FDR)和变化的倍数
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代谢组学是一项研究生物体内代谢物总体及其动态变化的学科。由于代谢物的种类繁多、结构复杂,代谢组学面临着一系列的挑战和难点:代谢物的复杂性、样品处理的复杂性、代谢物的动态变化、代谢物鉴定的困难、数据的处理和解释、样本的获取和处理、数据的标准化和比对。 但如果要突出一个作为“最大”的挑战,那么
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代谢组学(英语:metabolomics)是对细胞、生物流体、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物,metabolites)的大规模研究。这些小分子及其在生物系统中的相互作用统称为代谢组。能够对生物样本中的代谢物进行全面分析的一项新兴技术,被定义为代谢组学技术。 代谢组学是在后基因组学时
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• 求问代谢组学大神,代谢组学分析会筛选到目标物种之外的代谢物吗?
是的,代谢组学分析可能会筛选到目标物种之外的代谢物。这些非目标物种的代谢物可能来源于以下几种情况: 1.环境污染: 样品在采集、存储、处理或分析过程中可能被环境中的化学物质污染。 2.实验试剂和材料: 实验中使用的试剂、溶剂或其他材料可能包含化合物,这些化合物在代谢组学分析中可能被检测出
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代谢组学分析中所需的最小样本数量并没有固定的标准值,但通过综合考虑研究目标、样本的异质性、采用的技术平台和统计方法,以及研究的预期效应大小等因素,并进行适当的实验设计和预实验,可以更准确地确定代谢组学分析所需的样本数量。 1.研究设计: 为了获得具有统计学意义的结果,建议在预实验或初步研究
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• PLS-DS/OPLS-DA二维图分析时,q2等于1咋办?
在化学计量学和生物信息学中,PLS-DA(偏最小二乘判别分析)和OPLS-DA(正交投影到潜在结构的判别分析)是常用的分类和预测方法。在这些分析中,Q²值通常用于评估模型的预测能力。Q²值的范围通常在-1到1之间,其中1表示模型具有完美的预测能力,0表示模型的预测能力不比随机预测好,而负值则
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多糖的纯化通常是一个复杂的过程,涉及多步操作。如果你在使用纤维柱后发现多糖样品不纯,可以考虑使用葡聚糖凝胶柱进行进一步的纯化。下面是使用葡聚糖凝胶柱进行纯化的基本步骤: 1.选择合适的葡聚糖凝胶: 根据你要分离的多糖的大小选择合适的葡聚糖凝胶。例如,Sepharose CL-2B、Seph
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