代谢组学FAQ汇总

• • 单变量统计分析数据不符合正态分布怎么办

  当进行单变量统计分析时，数据的正态分布通常是进行参数检验的前提。如果数据不符合正态分布，我们可以采取多种方法来处理这种情况： 1.转换数据： 使用适当的转换（如对数转换、平方根转换或Box-Cox转换）使数据尽可能接近正态分布。在转换数据之后，可以重新检验其正态性，然后应用参数检验。 2

• • 多糖提取过程中醇沉之后不溶于水，这是正常现象吗？

  醇沉是通过增加醇（如乙醇）的浓度来沉淀多糖的过程。在许多情况下，此方法可以有效地从样品中分离多糖。 多糖的溶解性依赖于其化学结构和外部环境（如温度、pH值、离子强度等）。有些多糖在水中是易溶的，而有些则不是。在进行醇沉后，多糖可能会形成较紧密的结构，这可能会降低其在水中的溶解性。但通常，多

• • 做蛋白KEGG通路注释及富集分析是挑自己需要的通路列出还是根据P值大小列出？

  基于统计学上的显著性（P值）大小列出通路是最常见的选择方法。富集分析通常会返回一个P值或校正后的P值（例如FDR，False Discovery Rate），表示给定的通路是否比随机期望更为显著地与你的蛋白集合相关联。根据这些值对通路进行排序，并选择那些具有统计显著性的通路是常见的做法。

• • 目前的主要代谢组技术有哪些？各有什么特点？

  代谢组学是研究生物体内所有代谢物的集合及其动态变化的学科。在代谢组学研究中，各种技术方法被用于检测和定量生物样品中的代谢物。以下是目前的几种主要代谢组技术及其特点： 一、核磁共振 (NMR) 质谱技术 特点： 1.非破坏性检测，可用于活细胞和组织。 2.良好的定性能力，能鉴定化合物的结构

• • 植物代谢组学样品处理？

  在涉及到植物代谢组学样品处理时，有几个关键步骤需要考虑。以下是关于样品收集、样品处理的详细解答： 1.样品收集： 选择合适的植物组织：根据研究目的选择合适的植物组织，如叶片、茎、根等。确保样品的一致性和可重复性。 样品采集时间：根据植物的生长周期和代谢活性的变化，选择合适的采集时间点。例

• • 代谢组学数据预处理用XCMS怎么进行归一化和峰对齐呢的，真心求助大家？

  使用XCMS进行代谢组学数据预处理时，归一化和峰对齐是非常重要的步骤。归一化是为了消除样本间的技术变异，使得不同样本之间的代谢物峰强度可以进行比较和分析。峰对齐是为了解决不同样本之间代谢物峰的漂移和偏移问题，使得相同代谢物在不同样本中的峰位置一致。其大致步骤如下： 1.首先，使用XCMS对

• • 空间代谢组为什么都会关注分辨率？

  空间代谢组学是一种研究代谢物在组织或细胞水平上的空间分布的方法。它通过将组织切片并使用质谱技术来分析代谢物的分布情况。分辨率是指能够在样本中区分出不同代谢物的能力。 分辨率的高低直接影响我们对代谢物分布的理解。如果分辨率较低，我们可能无法准确地区分不同代谢物之间的空间分布差异。这可能导致我

• • 怎样检测微生物用药物干预后是否有代谢产物？

  当进行微生物药物干预后，我们可以通过以下方法来检测是否有代谢产物产生： 1.代谢产物分析： 通过对微生物培养物中的代谢产物进行分析，可以确定是否有新的代谢产物产生。这可以通过使用质谱分析技术（如质谱联用技术）来实现。质谱分析可以提供代谢产物的分子质量和结构信息，从而确定是否有新的代谢产物产

• • 代谢组学数据解读？

  代谢组学数据解读是一个复杂的过程，需要进行数据预处理、特征选择、数据分析和解释以及生物学解释。这个过程需要结合统计学、生物学和生物信息学等多个领域的知识和技术。通过综合分析和解释代谢组学数据，可以揭示代谢物在生物学过程中的作用，为疾病诊断、药物研发和个体化医学提供重要的信息。 1.数据预处

• • 怎么通过代谢组学数据确认各行的代谢物具体是什么？

  当通过代谢组学数据来确认各行的代谢物具体是什么时，涉及以下几个关键步骤： 1.与数据库匹配： 使用得到的m/z值（质荷比）和可能的分子式，与代谢物数据库进行对比，这些数据库包括HMDB（Human Metabolome Database）、Metlin、MassBank等。 2.使用保留