代谢组学FAQ汇总
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对于是否可以使用14kDa的透析袋处理氧化后的多糖高碘酸钠,这主要取决于氧化后产物的分子大小、所需分离的物质类型以及您试图移除或保留的特定组分。14kDa的透析袋意味着它只能阻止大于14kDa的分子,而任何小于这一分子量的物质都可以穿过透析膜。 如果氧化后的多糖高碘酸钠的主要组分大于14k
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脂质代谢组学是研究细胞内所有脂质分子种类及其变化的科学。这一领域集中于脂质的生物合成、代谢以及它们在生理和病理过程中的作用。提取脂质是研究中一个关键步骤,以下是提取脂质的详细步骤: 1.样本准备: 收集你的生物样本,如血液、尿液、细胞或组织。确保样本在收集和处理过程中避免降解,可能需要在低
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• 有个糖,分子量一万左右,想用Qtof做定性定量实验,之前用C18酸体系,没找到峰
在使用QTOF(四极杆-飞行时间)质谱进行定性定量分析时,如果使用C18酸性条件未能检测到目标糖分子的峰,可能是由于糖分子的特性和实验条件不匹配。糖类分子通常具有极性和疏水性较差的特点,这意味着它们在C18(疏水性)柱上的保留会很差,尤其是在酸性条件下,糖类往往不易离子化,因此难以被质谱检测
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• 非靶向代谢组学必须要做二级鉴定吗?为什么有的文献直接用质核比进行差异代谢物的鉴定呢?
非靶向代谢组学通常确实需要进行二级鉴定,因为一级质谱数据(如质核比)通常只能提供有关离子的质荷比和可能的分子式信息,但不能准确地确定化合物的结构。二级鉴定通过二级质谱图谱分析,可以得到关于代谢物结构的更多信息,有助于确保化合物鉴定的准确性。 但是,在某些情况下,研究人员可能会直接使用质核比
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多糖由糖单元通过糖苷键连接而成,它们的结构复杂多样,包括单糖组成、连接方式、分支情况以及分子量等。鉴定多糖的结构是一个挑战性的过程,通常需要结合多种分析技术。以下是一些常用的鉴定方法: 1.质谱分析(Mass Spectrometry, MS): 质谱分析可以用于确定多糖的分子量、组成和结
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为了彻底除去山药中的淀粉,确保只提取到山药多糖,您可以尝试以下方法: 1.酶法降解: 使用淀粉酶(如α-淀粉酶)可以特异性地降解淀粉,而不影响其他多糖。在适当的温度和pH条件下孵育样品,让淀粉酶作用一段时间,之后可以通过离心和过滤来去除降解产物。 2.醇沉淀法: 多糖和淀粉在醇中的溶解度
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KEGG通路分析的要目的是鉴定哪些生物学通路在你的实验条件下显著富集,并因此可能在你所研究的生物过程中发挥重要作用。我们可以采取以下方法从KEGG分析结果中识别高度富集的通路: 一、P值和校正P值(如FDR): 1.KEGG分析的结果通常会提供一个P值,表示每个通路富集的显著性水平。更低
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• 请教一下得到差异代谢物的通路之后怎么往下做啊?比如用WB验证涉及到的通路靶点,该怎么知道通路涉及的靶点呢
在代谢组学研究中,确定了差异代谢物的通路后,通常需要进一步的实验来验证这些发现,并了解这些代谢物如何通过特定的生物通路影响生物体的生理状态: 一、确定关键酶和蛋白: 在每个代谢通路中,都有一些关键的酶或蛋白因子负责调控该通路。这些关键蛋白质或酶通常是通路中的关键步骤的催化剂,或者是已知的调
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多糖的提取和分离是一个非常复杂的过程,其分子量大小可能受到多种因素的影响。当观察到多糖提取物分子量过大时,可能与以下几个因素有关: 1.原料来源: 不同种类的植物、生物或微生物产生的多糖其分子量分布可能大不相同。因此,原材料的生物学来源可能是导致提取多糖分子量差异的原因之一。 2.提取过
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当然,脂质代谢轮廓和胆汁酸代谢轮廓可以通过靶向方法进行研究和分析。"靶向"指的是针对特定的分子或代谢途径进行的分析,这是通过使用特定的标志物或分析方法来识别和量化特定的代谢产物。 1.脂质代谢轮廓: 脂质代谢是指脂质的合成和分解的生物化学过程。在研究中,科学家们常常使用质谱法、液相色谱和气
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