代谢组学FAQ汇总

• • 非靶向代谢组学必须要做二级鉴定吗？为什么有的文献直接用质核比进行差异代谢物的鉴定呢？

  非靶向代谢组学通常确实需要进行二级鉴定，因为一级质谱数据（如质核比）通常只能提供有关离子的质荷比和可能的分子式信息，但不能准确地确定化合物的结构。二级鉴定通过二级质谱图谱分析，可以得到关于代谢物结构的更多信息，有助于确保化合物鉴定的准确性。 但是，在某些情况下，研究人员可能会直接使用质核比

• • 多糖结构鉴定的方法有吗

  多糖由糖单元通过糖苷键连接而成，它们的结构复杂多样，包括单糖组成、连接方式、分支情况以及分子量等。鉴定多糖的结构是一个挑战性的过程，通常需要结合多种分析技术。以下是一些常用的鉴定方法： 1.质谱分析（Mass Spectrometry, MS）: 质谱分析可以用于确定多糖的分子量、组成和结

• • 想问一下山药多糖彻底除淀粉的方法

  为了彻底除去山药中的淀粉，确保只提取到山药多糖，您可以尝试以下方法： 1.酶法降解: 使用淀粉酶（如α-淀粉酶）可以特异性地降解淀粉，而不影响其他多糖。在适当的温度和pH条件下孵育样品，让淀粉酶作用一段时间，之后可以通过离心和过滤来去除降解产物。 2.醇沉淀法: 多糖和淀粉在醇中的溶解度

• • 在KEGG里怎么看富集高的通路呀

  KEGG通路分析的要目的是鉴定哪些生物学通路在你的实验条件下显著富集，并因此可能在你所研究的生物过程中发挥重要作用。我们可以采取以下方法从KEGG分析结果中识别高度富集的通路： 一、P值和校正P值（如FDR）： 1.KEGG分析的结果通常会提供一个P值，表示每个通路富集的显著性水平。更低

• • 请教一下得到差异代谢物的通路之后怎么往下做啊？比如用WB验证涉及到的通路靶点，该怎么知道通路涉及的靶点呢

  在代谢组学研究中，确定了差异代谢物的通路后，通常需要进一步的实验来验证这些发现，并了解这些代谢物如何通过特定的生物通路影响生物体的生理状态： 一、确定关键酶和蛋白： 在每个代谢通路中，都有一些关键的酶或蛋白因子负责调控该通路。这些关键蛋白质或酶通常是通路中的关键步骤的催化剂，或者是已知的调

• • 多糖提取分子量过大是什么原因啊

  多糖的提取和分离是一个非常复杂的过程，其分子量大小可能受到多种因素的影响。当观察到多糖提取物分子量过大时，可能与以下几个因素有关： 1.原料来源： 不同种类的植物、生物或微生物产生的多糖其分子量分布可能大不相同。因此，原材料的生物学来源可能是导致提取多糖分子量差异的原因之一。 2.提取过

• • 脂质代谢轮廓和胆汁酸代谢轮廓可以用靶向吗？

  当然，脂质代谢轮廓和胆汁酸代谢轮廓可以通过靶向方法进行研究和分析。"靶向"指的是针对特定的分子或代谢途径进行的分析，这是通过使用特定的标志物或分析方法来识别和量化特定的代谢产物。 1.脂质代谢轮廓： 脂质代谢是指脂质的合成和分解的生物化学过程。在研究中，科学家们常常使用质谱法、液相色谱和气

• • 单变量统计分析数据不符合正态分布怎么办

  当进行单变量统计分析时，数据的正态分布通常是进行参数检验的前提。如果数据不符合正态分布，我们可以采取多种方法来处理这种情况： 1.转换数据： 使用适当的转换（如对数转换、平方根转换或Box-Cox转换）使数据尽可能接近正态分布。在转换数据之后，可以重新检验其正态性，然后应用参数检验。 2

• • 多糖提取过程中醇沉之后不溶于水，这是正常现象吗？

  醇沉是通过增加醇（如乙醇）的浓度来沉淀多糖的过程。在许多情况下，此方法可以有效地从样品中分离多糖。 多糖的溶解性依赖于其化学结构和外部环境（如温度、pH值、离子强度等）。有些多糖在水中是易溶的，而有些则不是。在进行醇沉后，多糖可能会形成较紧密的结构，这可能会降低其在水中的溶解性。但通常，多

• • 做蛋白KEGG通路注释及富集分析是挑自己需要的通路列出还是根据P值大小列出？

  基于统计学上的显著性（P值）大小列出通路是最常见的选择方法。富集分析通常会返回一个P值或校正后的P值（例如FDR，False Discovery Rate），表示给定的通路是否比随机期望更为显著地与你的蛋白集合相关联。根据这些值对通路进行排序，并选择那些具有统计显著性的通路是常见的做法。