代谢组学FAQ汇总
-
PSL-DA/OPLS-DA二维图通常是通过专业的统计和数据分析软件生成的。常用的软件工具主要包括： 1.R 语言： R 语言是一个强大的统计计算和图形化软件，通过使用“mixOmics”包或“ropls”包等，它可以执行PLS-DA和OPLS-DA分析，并生成二维图。 2.Metabo
-
• KEGG通路分析中P值校正后的FDR是表示富集程度高还是p值小，我只知道圆点大表示蛋白质数量多，不太懂FDR的意思
FDR是多重假设检验中的一个概念，用于控制错误发现的比率。在进行大量的假设测试时（例如，检查数千个基因是否与某种疾病相关），我们可能会得到许多统计上显著的结果，但其中一些可能只是偶然的。为了控制这种假阳性，我们使用FDR。它的值在0到1之间，FDR越低，表示通路富集的信度越高。 所以，FD
-
提取细胞多糖是一个涉及多个步骤的复杂过程，这些多糖是细胞壁的重要组成部分，特别是在植物和某些微生物中。以下是一般的细胞多糖的提取步骤，但请注意，根据特定的细胞类型和所需的多糖类型，这些步骤可能需要适当调整： 1.细胞收集与准备： 从所选择的组织或培养物中收集细胞。确保在收集和处理样品的过程
-
对于是否可以使用14kDa的透析袋处理氧化后的多糖高碘酸钠，这主要取决于氧化后产物的分子大小、所需分离的物质类型以及您试图移除或保留的特定组分。14kDa的透析袋意味着它只能阻止大于14kDa的分子，而任何小于这一分子量的物质都可以穿过透析膜。 如果氧化后的多糖高碘酸钠的主要组分大于14k
-
脂质代谢组学是研究细胞内所有脂质分子种类及其变化的科学。这一领域集中于脂质的生物合成、代谢以及它们在生理和病理过程中的作用。提取脂质是研究中一个关键步骤，以下是提取脂质的详细步骤： 1.样本准备： 收集你的生物样本，如血液、尿液、细胞或组织。确保样本在收集和处理过程中避免降解，可能需要在低
-
• 有个糖，分子量一万左右，想用Qtof做定性定量实验，之前用C18酸体系，没找到峰
在使用QTOF（四极杆-飞行时间）质谱进行定性定量分析时，如果使用C18酸性条件未能检测到目标糖分子的峰，可能是由于糖分子的特性和实验条件不匹配。糖类分子通常具有极性和疏水性较差的特点，这意味着它们在C18（疏水性）柱上的保留会很差，尤其是在酸性条件下，糖类往往不易离子化，因此难以被质谱检测
-
• 非靶向代谢组学必须要做二级鉴定吗？为什么有的文献直接用质核比进行差异代谢物的鉴定呢？
非靶向代谢组学通常确实需要进行二级鉴定，因为一级质谱数据（如质核比）通常只能提供有关离子的质荷比和可能的分子式信息，但不能准确地确定化合物的结构。二级鉴定通过二级质谱图谱分析，可以得到关于代谢物结构的更多信息，有助于确保化合物鉴定的准确性。 但是，在某些情况下，研究人员可能会直接使用质核比
-
多糖由糖单元通过糖苷键连接而成，它们的结构复杂多样，包括单糖组成、连接方式、分支情况以及分子量等。鉴定多糖的结构是一个挑战性的过程，通常需要结合多种分析技术。以下是一些常用的鉴定方法： 1.质谱分析（Mass Spectrometry, MS）: 质谱分析可以用于确定多糖的分子量、组成和结
-
为了彻底除去山药中的淀粉，确保只提取到山药多糖，您可以尝试以下方法： 1.酶法降解: 使用淀粉酶（如α-淀粉酶）可以特异性地降解淀粉，而不影响其他多糖。在适当的温度和pH条件下孵育样品，让淀粉酶作用一段时间，之后可以通过离心和过滤来去除降解产物。 2.醇沉淀法: 多糖和淀粉在醇中的溶解度
-
KEGG通路分析的要目的是鉴定哪些生物学通路在你的实验条件下显著富集，并因此可能在你所研究的生物过程中发挥重要作用。我们可以采取以下方法从KEGG分析结果中识别高度富集的通路： 一、P值和校正P值（如FDR）： 1.KEGG分析的结果通常会提供一个P值，表示每个通路富集的显著性水平。更低
How to order?
