代谢组学FAQ汇总

  • • 血清代谢组学检测的具体流程可以简单说说嘛

    血清代谢组学检测是一种用于分析血清样本中的代谢物的方法,通常用于生物标志物的发现、疾病诊断和研究。其具体流程大致可以分为以下几个步骤: 1.样本采集与准备: 首先从个体中采集血液样本,然后通过离心等方法分离出血清。血清样本需要在特定条件下储存,以保持代谢物的稳定性。 2.样本处理: 样本

  • • 血清代谢组学检测指标,方法可以发一下嘛

    血清代谢组学是一种研究生物体内代谢产物的技术,用于分析血清中的小分子代谢物。这种方法可以提供有关生物体内部生化活动和疾病状态的信息。以下是血清代谢组学检测的主要指标和方法: 一、检测指标 1.小分子代谢物: 包括氨基酸、脂肪酸、糖类、核苷酸、维生素等。 2.能量代谢物: 如葡萄糖、乳酸

  • • 请问我的结果与黄酮呈负相关与多酚含量呈正相关,这正常吗

    您提到的结果中,某些变量与黄酮呈负相关,而与多酚含量呈正相关。这种情况是否正常取决于具体的研究背景和实验条件: 1.黄酮与结果的负相关性: 黄酮是一类天然存在于植物中的化合物,它们在植物的生长、抗病和代谢等方面扮演重要角色。如果某个变量(如某种生理指标、环境因子等)与黄酮含量呈负相关,这可

  • • 通过非靶找到目标代谢物后怎么做信号通路

    在非靶向代谢组学研究中找到目标代谢物后,你可以参考以下思路进行信号通路分析: 1.数据确认和预处理: 确认代谢物的身份,包括其化学结构和生物学功能。对代谢组数据进行必要的预处理,例如归一化、标准化和统计分析,以确保数据的质量和可靠性。 2.文献调研: 研究目标代谢物在已知的生物学文献中的

  • • 请问脂质代谢组学研究细胞样品收集中冻细胞的时候是只冻细胞吗,还要加培养基或者冻存液吗

    在脂质代谢组学研究中,收集细胞样品进行冻存时,通常不只是冻结细胞本身,而是需要在特定的冻存液中进行冻存: 1.冻存液的作用: 冻存液通常包含一种叫做二甲基亚砜(DMSO)的化合物,以及其它成分,如血清等。这些成分有助于降低冰晶形成的风险,从而保护细胞的结构和功能。 2.冻存步骤: 在冻存

  • • 临床血清可以放到液氮里存放么?存放到液氮里几个月,再送检非靶向代谢组学,会影响结果么?

    将临床血清样本存放在液氮中通常是一种常见的冷冻保存方法,可以有效保护样本中的生物分子,减少降解和分解的可能性。然而,存放时间和样本的质量管理仍然是关键因素,可能会影响非靶向代谢组学分析的结果。 液氮的极低温度可以延缓样本的降解,但并不能完全停止分子的变化。对于非靶向代谢组学研究,通常会关注

  • • 临床样本的血清代谢组学取样本,最低多少例?有什么参考依据吗?

    对于临床样本的血清代谢组学研究,样本数量的确定取决于多种因素,包括研究目的、研究设计、统计功效分析、样本异质性、以及经费和资源的可用性。目前没有统一的最低样本量标准,但以下几点是确定样本数量时需要考虑的关键因素: 1.研究目的和设计: 初步探索性研究可能需要较少的样本量,而旨在验证特定假设

  • • 一般是用PLS-DA还是OPLS-DA来分析模型的预测能力,我见过文献两个都有写,不懂应该用哪个。

    在选择PLS-DA(偏最小二乘判别分析)和OPLS-DA(正交偏最小二乘判别分析)来分析模型的预测能力时,考虑因素包括数据的特性和研究的具体需求。这两种方法都是用于多变量统计分析,尤其在代谢组学和化学计量学领域中广泛应用,但它们有一些关键的区别: 1.PLS-DA: 一种监督性学习方法,

  • • 如果是小样本量做出来的OPLS-DA中的Q2Y只有0.2左右,能用吗?

    Q2Y值是评估OPLS-DA模型预测性能的一个关键参数,代表交叉验证预测性的指标。 1.Q2Y值的解释: 在OPLS-DA中,Q2Y值通常用于评估模型的预测能力。一个高的Q2Y值(接近1)表示模型具有良好的预测性能,而低的Q2Y值则表明预测性能较差。通常,Q2Y值大于0.5被认为是可接受的

  • • OPLS-DA置换检验中R2有0.93,而且斜率是负的,能用吗?

    在OPLS-DA中,R2值衡量模型对数据变异性的解释程度。一个R2值为0.93意味着模型能够解释数据93%的变异性。这通常被认为是一个很高的值,暗示模型拥有很好的解释能力。 在做置换检验(permutation test)时,通常会生成一个模型参数(如R2或Q2)与随机置换次数的关系图。在

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