代谢组学FAQ汇总

• • 去氧糖连在一起的多糖提取，如何极大性的提取多糖呢

  提取去氧糖连在一起的多糖是一个涉及生物化学和化学工程的复杂过程。为了极大化多糖的提取，可以采取以下几种策略： 1.原料选择和预处理： 选择富含目标多糖的生物材料，如某些植物或微生物。 使用物理方法（如研磨、超声波处理）破坏原料细胞壁，增加去氧糖多糖的可及性。 采用酶预处理，特别是使用能分

• • 请问白芨多糖真空干燥后很难溶于水的改善方法？

  真空干燥后多糖难以溶于水的问题可能是由于其分子结构或干燥过程中形成的物理性质所致。可以尝试以下方法来改善其溶解性： 1.物理改性： 在溶解前，将多糖粉末进行细致研磨，以增加其表面积，有助于提高溶解速度。 使用超声波处理，超声波可以促进水分子与多糖之间的相互作用，提高溶解速度。 2.化

• • 请问离子组学筛选出来的差异离子一般用什么统计图展现呀

  在离子组学研究中，筛选出差异显著的离子后，常用以下几种统计图来展现结果： 1.火山图（Volcano Plot）： 这种图展示了离子的显著性（通常是p-value）与效应大小（比如，对照组与实验组的比值）之间的关系。火山图能够一目了然地显示出那些差异显著且效应大小较大的离子。 2.箱线图

• • 做非靶向代谢，能得到组间上调/下调了百分之多少吗，还是只能得到上调/下调？

  在非靶向代谢组学研究中，研究者不仅能够识别出哪些代谢物水平发生了变化，还能定量这些变化的程度。这些数据通常通过比较不同样本（如疾病状态与健康状态，或者不同处理组之间）的代谢物丰度得到——通过对照品（内标或外标）的使用来进行定量分析，进而估计代谢物含量的相对上调或下调百分比。 百泰派克生物科

• • 胆汁酸QPCR用哪些引物

  胆汁酸相关的qPCR（定量聚合酶链反应）实验主要用于研究胆汁酸合成、代谢相关基因的表达。胆汁酸合成涉及多个酶的参与，包括胆固醇7α-羟化酶（CYP7A1），胆固醇27-羟化酶（CYP27A1），12α-羟化酶（CYP8B1）等。不同的基因对应的qPCR引物也不同。以下是这些基因的部分常用引物

• • 多糖甲基化gc-mc检测之后怎么解析比对

  多糖甲基化的GC-MS（气相色谱-质谱）检测是一个用于鉴定和定量甲基化多糖样本中的单体成分的方法。其基本流程可以概括为样品的甲基化、气相色谱分离和质谱检测。 一、解析和比对步骤： 1.数据获取: 从GC-MS仪器中获得原始的色谱和质谱数据。 2.峰值检测: 利用软件工具，如NIST、M

• • 请问文章中列出的通路是挑自己需要的通路列出的还是要根据p值大小啥的列吗？前面都是疾病相关的

  在文章中列出的通路选择方式是一个关键决策点，决定了结果的解释和文章的关注点。 一、通路选择的准则： 文章中列出的通路有以下几种选择方式： 1.基于生物学意义的选择： 即根据疾病或生物过程的已知背景信息来选择相关通路。例如，在癌症研究中，可能会特别关注与细胞周期、凋亡等已知与癌症密切相关的

• • 有simca做pls-da的操作流程嘛

  以下是使用SIMCA进行PLS-DA的基本操作流程： 1.数据导入： 打开SIMCA软件。 选择“新建项目”或“打开已有项目”。 导入待分析的数据，可以是Excel文件、文本文件等。 2.数据预处理： 检查数据中是否有缺失值，如果有，进行填充或排除。 进行数据标准化或归一化，这样可

• • PLS-DA/OPLS-DA二维图的数据总是不出，怎么回事呢

  如果您遇到PLS-DA/OPLS-DA二维图时出不来的情况，可以考虑以下几个原因： 1.数据预处理： 确保您的数据已经进行了适当的归一化、均值中心化或缩放等预处理步骤。 2.模型参数： 确保为PLS-DA或OPLS-DA选择了正确的参数设置。例如，组件数量或模型复杂度可能需要调整。 3

• • 非靶向代谢组学有些代谢物不知道内源还是外源该怎么办？

  非靶向代谢组学研究通常涉及从生物样品中检测大量的代谢物，而其中许多代谢物可能来自于生物体内（内源性）或生物体外（外源性）。当试图确定代谢物的来源时，可以参考以下方法和建议： 1.对照实验： 在设计实验时，可以考虑设置对照组，例如，不含特定外源性化合物的对照组，以帮助鉴别是否有代谢物来自于这