代谢组学FAQ汇总

以下是使用SIMCA进行PLS-DA的基本操作流程： 1.数据导入：打开SIMCA软件。选择“新建项目”或“打开已有项目”。导入待分析的数据，可以是Excel文件、文本文件等。 2.数据预处理：检查数据中是否有缺失值，如果有，进行填充或排除。进行数据标准化或归一化，这样可

如果您遇到PLS-DA/OPLS-DA二维图时出不来的情况，可以考虑以下几个原因： 1.数据预处理：确保您的数据已经进行了适当的归一化、均值中心化或缩放等预处理步骤。 2.模型参数：确保为PLS-DA或OPLS-DA选择了正确的参数设置。例如，组件数量或模型复杂度可能需要调整。 3

非靶向代谢组学研究通常涉及从生物样品中检测大量的代谢物，而其中许多代谢物可能来自于生物体内（内源性）或生物体外（外源性）。当试图确定代谢物的来源时，可以参考以下方法和建议： 1.对照实验：在设计实验时，可以考虑设置对照组，例如，不含特定外源性化合物的对照组，以帮助鉴别是否有代谢物来自于这

非靶向代谢组学（Untargeted Metabolomics）是一种全面、不偏见地探测样品中所有可检测的代谢物的方法。这种方法不仅仅局限于内源性代谢物，还可以探测外源性代谢物，例如药物、食品添加剂、环境毒素等。如果在代谢物较少的情况下鉴定出非内源性代谢物，是否将其放入文章取决于研究的目

PSL-DA/OPLS-DA二维图通常是通过专业的统计和数据分析软件生成的。常用的软件工具主要包括： 1.R 语言： R 语言是一个强大的统计计算和图形化软件，通过使用“mixOmics”包或“ropls”包等，它可以执行PLS-DA和OPLS-DA分析，并生成二维图。 2.Metabo

FDR是多重假设检验中的一个概念，用于控制错误发现的比率。在进行大量的假设测试时（例如，检查数千个基因是否与某种疾病相关），我们可能会得到许多统计上显著的结果，但其中一些可能只是偶然的。为了控制这种假阳性，我们使用FDR。它的值在0到1之间，FDR越低，表示通路富集的信度越高。所以，FD

提取细胞多糖是一个涉及多个步骤的复杂过程，这些多糖是细胞壁的重要组成部分，特别是在植物和某些微生物中。以下是一般的细胞多糖的提取步骤，但请注意，根据特定的细胞类型和所需的多糖类型，这些步骤可能需要适当调整： 1.细胞收集与准备：从所选择的组织或培养物中收集细胞。确保在收集和处理样品的过程

对于是否可以使用14kDa的透析袋处理氧化后的多糖高碘酸钠，这主要取决于氧化后产物的分子大小、所需分离的物质类型以及您试图移除或保留的特定组分。14kDa的透析袋意味着它只能阻止大于14kDa的分子，而任何小于这一分子量的物质都可以穿过透析膜。如果氧化后的多糖高碘酸钠的主要组分大于14k

脂质代谢组学是研究细胞内所有脂质分子种类及其变化的科学。这一领域集中于脂质的生物合成、代谢以及它们在生理和病理过程中的作用。提取脂质是研究中一个关键步骤，以下是提取脂质的详细步骤： 1.样本准备：收集你的生物样本，如血液、尿液、细胞或组织。确保样本在收集和处理过程中避免降解，可能需要在低

在使用QTOF（四极杆-飞行时间）质谱进行定性定量分析时，如果使用C18酸性条件未能检测到目标糖分子的峰，可能是由于糖分子的特性和实验条件不匹配。糖类分子通常具有极性和疏水性较差的特点，这意味着它们在C18（疏水性）柱上的保留会很差，尤其是在酸性条件下，糖类往往不易离子化，因此难以被质谱检测

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