Metaboanalyst做oplsda图怎么看

OPLS-DA图通常包含得分图（score plot）和负荷图（loading plot），得分图显示样本在模型主成分上的投影，通常用于展示不同组（如疾病组和对照组）之间的分离。负荷图显示各个变量（如代谢物）对模型分离能力的贡献。




1.解读得分图

• 样本聚类：观察不同组别的样本是否形成独立的聚类。良好的模型应显示出清晰的组间分离。
• 模型质量指标：关注模型的R2（解释的变异比例）和Q2（预测能力）值。R2接近1表示模型拟合度高，Q2接近1表示良好的预测能力。



2.解读负荷图

• 关键变量识别：在负荷图中，远离原点的变量对组间分离贡献更大。这些变量可能是区分不同样本组的关键代谢物。
• 方向性：变量在负荷图上的位置反映了它们与分离方向的关联。例如，在疾病与对照组比较中，位于疾病组方向的代谢物可能在疾病状态下上调。



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