代谢组学FAQ汇总

• • 请问一下菌液上清代谢组学前处理需要过SPE柱萃取吗？

  不一定。SPE柱萃取是一种常用的样品预处理方法，可以用来富集和净化样品中的目标化合物，同时去除干扰物质，但它不是代谢组学前处理的必需步骤。 是否需要使用SPE柱萃取应该根据以下因素来决定： 1.样品性质： 样品的性质决定了是否需要使用SPE柱。如果你的样品已经相对纯净，并且不含大量的干扰

• • 请问怎么判断提取多糖中不含杂质呢，结构解析是不是必须多糖成分很纯

  要判断提取的多糖中是否含有杂质，可以通过以下几种方法来实现： 1.紫外-可见光谱（UV-Vis Spectroscopy）： 多糖通常在紫外-可见光谱中不吸收光，但某些杂质如蛋白质和核酸会在特定波长下吸收。因此，通过紫外-可见光谱可以初步判断样品中是否含有这类杂质。 2.高效液相色谱（H

• • 血清代谢组学检测的具体流程可以简单说说嘛

  血清代谢组学检测是一种用于分析血清样本中的代谢物的方法，通常用于生物标志物的发现、疾病诊断和研究。其具体流程大致可以分为以下几个步骤： 1.样本采集与准备： 首先从个体中采集血液样本，然后通过离心等方法分离出血清。血清样本需要在特定条件下储存，以保持代谢物的稳定性。 2.样本处理： 样本

• • 血清代谢组学检测指标，方法可以发一下嘛

  血清代谢组学是一种研究生物体内代谢产物的技术，用于分析血清中的小分子代谢物。这种方法可以提供有关生物体内部生化活动和疾病状态的信息。以下是血清代谢组学检测的主要指标和方法： 一、检测指标 1.小分子代谢物： 包括氨基酸、脂肪酸、糖类、核苷酸、维生素等。 2.能量代谢物： 如葡萄糖、乳酸

• • 请问我的结果与黄酮呈负相关与多酚含量呈正相关，这正常吗

  您提到的结果中，某些变量与黄酮呈负相关，而与多酚含量呈正相关。这种情况是否正常取决于具体的研究背景和实验条件： 1.黄酮与结果的负相关性： 黄酮是一类天然存在于植物中的化合物，它们在植物的生长、抗病和代谢等方面扮演重要角色。如果某个变量（如某种生理指标、环境因子等）与黄酮含量呈负相关，这可

• • 通过非靶找到目标代谢物后怎么做信号通路

  在非靶向代谢组学研究中找到目标代谢物后，你可以参考以下思路进行信号通路分析： 1.数据确认和预处理： 确认代谢物的身份，包括其化学结构和生物学功能。对代谢组数据进行必要的预处理，例如归一化、标准化和统计分析，以确保数据的质量和可靠性。 2.文献调研： 研究目标代谢物在已知的生物学文献中的

• • 请问脂质代谢组学研究细胞样品收集中冻细胞的时候是只冻细胞吗，还要加培养基或者冻存液吗

  在脂质代谢组学研究中，收集细胞样品进行冻存时，通常不只是冻结细胞本身，而是需要在特定的冻存液中进行冻存： 1.冻存液的作用： 冻存液通常包含一种叫做二甲基亚砜（DMSO）的化合物，以及其它成分，如血清等。这些成分有助于降低冰晶形成的风险，从而保护细胞的结构和功能。 2.冻存步骤： 在冻存

• • 临床血清可以放到液氮里存放么？存放到液氮里几个月，再送检非靶向代谢组学，会影响结果么？

  将临床血清样本存放在液氮中通常是一种常见的冷冻保存方法，可以有效保护样本中的生物分子，减少降解和分解的可能性。然而，存放时间和样本的质量管理仍然是关键因素，可能会影响非靶向代谢组学分析的结果。 液氮的极低温度可以延缓样本的降解，但并不能完全停止分子的变化。对于非靶向代谢组学研究，通常会关注

• • 临床样本的血清代谢组学取样本，最低多少例？有什么参考依据吗？

  对于临床样本的血清代谢组学研究，样本数量的确定取决于多种因素，包括研究目的、研究设计、统计功效分析、样本异质性、以及经费和资源的可用性。目前没有统一的最低样本量标准，但以下几点是确定样本数量时需要考虑的关键因素： 1.研究目的和设计： 初步探索性研究可能需要较少的样本量，而旨在验证特定假设

• • 一般是用PLS-DA还是OPLS-DA来分析模型的预测能力，我见过文献两个都有写，不懂应该用哪个。

  在选择PLS-DA（偏最小二乘判别分析）和OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析）来分析模型的预测能力时，考虑因素包括数据的特性和研究的具体需求。这两种方法都是用于多变量统计分析，尤其在代谢组学和化学计量学领域中广泛应用，但它们有一些关键的区别： 1.PLS-DA: 一种监督性学习方法，