代谢组学FAQ汇总
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1.原料准备: 选择合适的阿拉伯木含量高的原料,如豆科植物种子。 2.粉碎和筛分: 将原料粉碎至适宜的粒度,并通过筛分去除大颗粒。 3.预处理: 使用乙醇或其他有机溶剂去除原料中的脂类和其他可溶性杂质。 4.碱处理: 将处理后的原料与一定浓度的碱性溶液(通常是氢氧化钠或氢氧化钾)混合。
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外泌体质谱和外泌体脂质组学确实存在一定程度的重叠,但它们侧重于分析不同类型的分子。 一、外泌体质谱 1.侧重点: 质谱技术在外泌体研究中通常用于鉴定和量化蛋白质。这种方法能够提供关于外泌体中蛋白质组成的详细信息。 2.应用: 通过质谱分析,研究人员可以识别外泌体中的特定蛋白质,这些蛋白
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• 线性回归做代谢物和疾病状态之间的关系有没有具体的操作步骤,我查到的是疾病和代谢物浓度只能做二元逻辑回归,做不了线性回归
线性回归可以用来研究代谢物和疾病状态之间的关系,但它是否适用取决于数据的性质和研究的具体目标。 1.疾病状态为二元分类变量(如有病/无病): 在这种情况下,逻辑回归是更合适的选择。逻辑回归适用于因变量是分类的情况,特别是在处理二元分类(如是/否,有病/无病)时。这种方法可以帮助你评估代谢物
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凝胶层析是一种常用于分离和纯化高分子量生物大分子(如多糖、蛋白质等)的技术。下面是利用凝胶层析分析纯化阿拉伯木聚糖的具体步骤: 一、准备阿拉伯木聚糖样品 1. 将含有阿拉伯木聚糖的样品溶解在适当的缓冲溶液中,确保完全溶解. 2. 通过离心或过滤等方法去除溶液中的不溶杂质。 二、选择合
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• 做临床代谢组学,疾病组和对照组OPLSDA分不开,但P值和FC值都显示存在差异,请问怎么解决?可以采用线性回归做组间差异吗
在临床代谢组学研究中使用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)对疾病组和对照组进行分析,如果发现这两组无法明显区分,但P值和折叠变化(Fold Change, FC)值显示存在差异,这可能是由多种因素引起的。这里有几个建议和解决办法: 1. 重新评估OPLS-DA模型 模型参数调整:调
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• 一个样本的脂质组学结果和这个样本的质谱有什么区别吗,是不是质谱结果里包含着脂质组学
脂质组学结果通常是基于质谱技术获得的。质谱(Mass Spectrometry, MS)是一种强大的分析技术,可用于检测和量化样本中的分子,包括脂质。在脂质组学研究中,质谱是主要的分析工具,用于鉴定和量化样本中的脂质分子。 质谱与脂质组学的关系 1.脂质组学: 脂质组学是生物学的一个分支
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• 菌液上清代谢组学前处理需要LCMS吗?怀疑是培养基里的盐分和糖分影响峰型,如果要除盐除糖需要什么类型的柱子呢?
液相色谱-质谱(LC-MS)不属于前处理分析了,而是一种分析技术,主要用于分析和鉴定复杂生物样品中的代谢物。如果您怀疑培养基中的盐分和糖分影响了峰型,可以使用以下类型的色谱柱: 1.凝胶过滤色谱柱(Gel Filtration Chromatography): 使用具有特定孔径的柱子,如S
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阿拉伯木聚糖的纯化过程通常包括以下几个步骤: 1.去除杂质: 首先,使用离心或过滤的方法去除提取液中的悬浮颗粒和其他大分子杂质。 2.透析: 将提取液置于透析袋中,用于去除小分子杂质。透析袋的孔径应该小于阿拉伯木聚糖的分子大小,以保证阿拉伯木聚糖留在袋内,而盐分和其他小分子杂质可以透过袋
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粗多糖的成分分析通常不使用气相色谱(GC)方法,因为多糖是高分子化合物,不易挥发,不适合直接用于气相色谱。气相色谱主要用于分析小分子化合物,特别是易挥发的有机物。对于多糖类物质的分析,更常见的方法包括: 1.高效液相色谱(HPLC): 适用于多糖及其单糖组成的分析。通过特定的检测器,如蒸发
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1.含量测定: 使用质谱联用色谱(LC-MS):首先,通过液相色谱(LC)将样品中的多糖分离。然后,多糖进入质谱仪,在质谱仪中,多糖分子会被离子化并转化为离子。通过质谱仪测量多糖分子的质量/电荷比(m/z),可以估算多糖的含量。这通常需要与已知标准物质比对以确定含量。 2.结构分析: 使用
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