代谢组学FAQ汇总

• • 多糖提取步骤中需要流水透析吗

  是的，在多糖提取的步骤中，通常需要进行流水透析。透析的目的是去除提取过程中产生的低分子量杂质，如盐类、小分子的有机物和低分子量的蛋白质，同时也帮助净化和浓缩多糖样品。这一步骤对于提高多糖的纯度和质量非常重要。透析膜的选择应基于其分子量截留限（MWCO）来确保有效分离。 百泰派克生物科技&m

• • 利用脂质代谢组学研究数据进行可视化分析的具体步骤

  这里介绍几种常见的可视化分析方法的操作流程： 一、主成分分析（PCA）图的制作 1.数据准备 从您的统计分析中获取标准化后的数据集，确保数据格式适合PCA分析。 2.使用Python进行作图 导入必要的库，例如pandas读取数据，scikit-learn进行PCA分析，matplo

• • 碱提取木聚糖的料液比，氢氧化钠浓度，提取时间设置多少合适

  碱提取木聚糖过程涉及到的料液比（即固体与液体的比例）、氢氧化钠（NaOH）的浓度以及提取时间参数的最佳设定取决于木材的类型、木聚糖的预期纯度和产量，以及整个工艺的经济效益。 1.料液比： 通常在1:10至1:30的范围内。较低的a料液比有利于提高提取效率，但会增加成本。 2.氢氧化钠浓度

• • 代谢组学用色谱柱分离出的物质怎么检测其结构进行pca分析

  对于通过色谱柱分离得到的代谢物进行结构检测和主成分分析（PCA）通常包括以下几个关键步骤： 1.代谢物的结构鉴定： 质谱（MS）：将代谢物通过质谱仪进行分析，以获得其质量/电荷比的信息，这有助于推断分子质量和可能的结构。 核磁共振（NMR）光谱：对代谢物进行NMR光谱分析，获得其氢原子和

• • Metaboanalyst做oplsda图怎么看

  OPLS-DA图通常包含得分图（score plot）和负荷图（loading plot），得分图显示样本在模型主成分上的投影，通常用于展示不同组（如疾病组和对照组）之间的分离。负荷图显示各个变量（如代谢物）对模型分离能力的贡献。 1.解读得分图 样本聚类：观察不同组别的样本是否形成独立

• • 请问,线性判别分析LDA和偏最小二乘判别分析PLSDA有什么区别?

  线性判别分析（LDA）和偏最小二乘判别分析（PLS-DA）是两种常用的多变量分析方法，用于模式识别和分类问题。它们之间有一些关键的区别： 一、基本原理: 1.LDA: 这种方法的目的是找到一个线性组合的特征，这样不同类别的数据在这个新的维度上尽可能分开。它通过最大化类间差异和最小化类内差

• • opls-da模型的VIP值是什么意思?

  OP-PLS-DA（Orthogonal Partial Least Squares Discriminant Analysis）是一种多变量统计分析方法，用于模式识别和分类。在OPLS-DA模型中，VIP（Variable Importance in the Projection）值是一种

• • 使用SIMCA-P做pls分析

  SIMCA-P作为一款专业的统计软件，提供了一个用户友好的界面和强大的分析工具。使用SIMCA-P进行偏最小二乘分析主要涉及以下步骤： 1. 数据准备 数据格式：确保数据以SIMCA-P软件能够识别的格式导入，通常是CSV或Excel格式。 数据组织：数据应该组织为样本（行）和变量（列），

• • 用PLS和OPLS分析代谢组数据

  一、PLS（偏最小二乘法） PLS是一种多变量分析方法，广泛用于化学和生物信息学领域。它可以同时处理多个预测变量和多个响应变量，寻找这些变量之间的关系。在代谢组学中，PLS常用于分析样本（如生物样本）的多种代谢物浓度与生物学性状（如疾病状态）之间的关系。 1.优势: PLS能有效处理变量

• • 做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理

  一、血液样本采集 1.采集时间： 最好在相同的时间点（如早晨空腹）采集血液样本，以减少生物节律的影响。 2.采集方法： 通常采用静脉抽血，使用无菌采血管，可以选择含有或不含有抗凝剂的管子，视后续处理和分析需求而定。 3.样本量： 通常需要1-2 mL血液。 二、血液样本处理： 1.