代谢组学FAQ汇总

• • 有脂质代谢组学研究的相关文章和数据处理方法吗

  一、相关的研究论文 1.《Plasma Lipidome and Prediction of Type 2 Diabetes in the Population-Based Malmö Diet and Cancer Cohort》： 这项研究探讨了血浆脂质组在预测2型糖尿病发病

• • 一般什么代谢途径会产生内源性化合物？

  内源性化合物主要是通过体内的代谢过程产生的，包括但不限于碳水化合物、脂类、蛋白质和核酸。这些过程可以概括为以下几个关键途径： 1.糖酵解途径： 这是在细胞质中进行的一系列反应，将葡萄糖转化为丙酮酸，并产生ATP和NADH。在这个过程中，可以产生多种内源性化合物，如丙酮酸和乳酸。 2.三羧

• • 二元逻辑回归分析研究代谢物和疾病状态间的关系，数据异常值和缺失值占数据百分之多少算数据质量合格？数据清洗最多剔除多少比例异常值？

  1.数据质量合格的判定 在进行二元逻辑回归分析研究代谢物与疾病状态之间的关系时，关于数据异常值和缺失值的处理没有固定的标准或百分比规定，因为数据中异常值和缺失值的“合格”比例取决于多种因素，包括研究的具体领域、数据的性质以及数据量的大小。但是，如果数据集中的异常值或缺

• • 碱式提取阿拉伯木聚糖的具体步骤可以发一下吗？

  1.原料准备： 选择合适的阿拉伯木含量高的原料，如豆科植物种子。 2.粉碎和筛分： 将原料粉碎至适宜的粒度，并通过筛分去除大颗粒。 3.预处理： 使用乙醇或其他有机溶剂去除原料中的脂类和其他可溶性杂质。 4.碱处理： 将处理后的原料与一定浓度的碱性溶液（通常是氢氧化钠或氢氧化钾）混合。

• • 外泌体的质谱和外泌体的脂质组学中是不是有重叠的地方

  外泌体质谱和外泌体脂质组学确实存在一定程度的重叠，但它们侧重于分析不同类型的分子。 一、外泌体质谱 1.侧重点： 质谱技术在外泌体研究中通常用于鉴定和量化蛋白质。这种方法能够提供关于外泌体中蛋白质组成的详细信息。 2.应用： 通过质谱分析，研究人员可以识别外泌体中的特定蛋白质，这些蛋白

• • 线性回归做代谢物和疾病状态之间的关系有没有具体的操作步骤，我查到的是疾病和代谢物浓度只能做二元逻辑回归，做不了线性回归

  线性回归可以用来研究代谢物和疾病状态之间的关系，但它是否适用取决于数据的性质和研究的具体目标。 1.疾病状态为二元分类变量（如有病/无病）： 在这种情况下，逻辑回归是更合适的选择。逻辑回归适用于因变量是分类的情况，特别是在处理二元分类（如是/否，有病/无病）时。这种方法可以帮助你评估代谢物

• • 用凝胶层析分析纯化阿拉伯木聚糖的具体方法过程，详细点

  凝胶层析是一种常用于分离和纯化高分子量生物大分子（如多糖、蛋白质等）的技术。下面是利用凝胶层析分析纯化阿拉伯木聚糖的具体步骤： 一、准备阿拉伯木聚糖样品 1. 将含有阿拉伯木聚糖的样品溶解在适当的缓冲溶液中，确保完全溶解. 2. 通过离心或过滤等方法去除溶液中的不溶杂质。 二、选择合

• • 做临床代谢组学，疾病组和对照组OPLSDA分不开，但P值和FC值都显示存在差异，请问怎么解决？可以采用线性回归做组间差异吗

  在临床代谢组学研究中使用正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）对疾病组和对照组进行分析，如果发现这两组无法明显区分，但P值和折叠变化（Fold Change, FC）值显示存在差异，这可能是由多种因素引起的。这里有几个建议和解决办法： 1. 重新评估OPLS-DA模型 模型参数调整：调

• • 一个样本的脂质组学结果和这个样本的质谱有什么区别吗，是不是质谱结果里包含着脂质组学

  脂质组学结果通常是基于质谱技术获得的。质谱（Mass Spectrometry, MS）是一种强大的分析技术，可用于检测和量化样本中的分子，包括脂质。在脂质组学研究中，质谱是主要的分析工具，用于鉴定和量化样本中的脂质分子。 质谱与脂质组学的关系 1.脂质组学： 脂质组学是生物学的一个分支

• • 菌液上清代谢组学前处理需要LCMS吗？怀疑是培养基里的盐分和糖分影响峰型，如果要除盐除糖需要什么类型的柱子呢？

  液相色谱-质谱（LC-MS）不属于前处理分析了，而是一种分析技术，主要用于分析和鉴定复杂生物样品中的代谢物。如果您怀疑培养基中的盐分和糖分影响了峰型，可以使用以下类型的色谱柱： 1.凝胶过滤色谱柱（Gel Filtration Chromatography）： 使用具有特定孔径的柱子，如S