代谢组学FAQ汇总

• • 在KEGG里怎么看富集高的通路呀

  KEGG通路分析的要目的是鉴定哪些生物学通路在你的实验条件下显著富集，并因此可能在你所研究的生物过程中发挥重要作用。我们可以采取以下方法从KEGG分析结果中识别高度富集的通路： 一、P值和校正P值（如FDR）： 1.KEGG分析的结果通常会提供一个P值，表示每个通路富集的显著性水平。更低

• • 请教一下得到差异代谢物的通路之后怎么往下做啊？比如用WB验证涉及到的通路靶点，该怎么知道通路涉及的靶点呢

  在代谢组学研究中，确定了差异代谢物的通路后，通常需要进一步的实验来验证这些发现，并了解这些代谢物如何通过特定的生物通路影响生物体的生理状态： 一、确定关键酶和蛋白： 在每个代谢通路中，都有一些关键的酶或蛋白因子负责调控该通路。这些关键蛋白质或酶通常是通路中的关键步骤的催化剂，或者是已知的调

• • 多糖提取分子量过大是什么原因啊

  多糖的提取和分离是一个非常复杂的过程，其分子量大小可能受到多种因素的影响。当观察到多糖提取物分子量过大时，可能与以下几个因素有关： 1.原料来源： 不同种类的植物、生物或微生物产生的多糖其分子量分布可能大不相同。因此，原材料的生物学来源可能是导致提取多糖分子量差异的原因之一。 2.提取过

• • 脂质代谢轮廓和胆汁酸代谢轮廓可以用靶向吗？

  当然，脂质代谢轮廓和胆汁酸代谢轮廓可以通过靶向方法进行研究和分析。"靶向"指的是针对特定的分子或代谢途径进行的分析，这是通过使用特定的标志物或分析方法来识别和量化特定的代谢产物。 1.脂质代谢轮廓： 脂质代谢是指脂质的合成和分解的生物化学过程。在研究中，科学家们常常使用质谱法、液相色谱和气

• • 单变量统计分析数据不符合正态分布怎么办

  当进行单变量统计分析时，数据的正态分布通常是进行参数检验的前提。如果数据不符合正态分布，我们可以采取多种方法来处理这种情况： 1.转换数据： 使用适当的转换（如对数转换、平方根转换或Box-Cox转换）使数据尽可能接近正态分布。在转换数据之后，可以重新检验其正态性，然后应用参数检验。 2

• • 多糖提取过程中醇沉之后不溶于水，这是正常现象吗？

  醇沉是通过增加醇（如乙醇）的浓度来沉淀多糖的过程。在许多情况下，此方法可以有效地从样品中分离多糖。 多糖的溶解性依赖于其化学结构和外部环境（如温度、pH值、离子强度等）。有些多糖在水中是易溶的，而有些则不是。在进行醇沉后，多糖可能会形成较紧密的结构，这可能会降低其在水中的溶解性。但通常，多

• • 做蛋白KEGG通路注释及富集分析是挑自己需要的通路列出还是根据P值大小列出？

  基于统计学上的显著性（P值）大小列出通路是最常见的选择方法。富集分析通常会返回一个P值或校正后的P值（例如FDR，False Discovery Rate），表示给定的通路是否比随机期望更为显著地与你的蛋白集合相关联。根据这些值对通路进行排序，并选择那些具有统计显著性的通路是常见的做法。

• • 目前的主要代谢组技术有哪些？各有什么特点？

  代谢组学是研究生物体内所有代谢物的集合及其动态变化的学科。在代谢组学研究中，各种技术方法被用于检测和定量生物样品中的代谢物。以下是目前的几种主要代谢组技术及其特点： 一、核磁共振 (NMR) 质谱技术 特点： 1.非破坏性检测，可用于活细胞和组织。 2.良好的定性能力，能鉴定化合物的结构

• • 植物代谢组学样品处理？

  在涉及到植物代谢组学样品处理时，有几个关键步骤需要考虑。以下是关于样品收集、样品处理的详细解答： 1.样品收集： 选择合适的植物组织：根据研究目的选择合适的植物组织，如叶片、茎、根等。确保样品的一致性和可重复性。 样品采集时间：根据植物的生长周期和代谢活性的变化，选择合适的采集时间点。例

• • 代谢组学数据预处理用XCMS怎么进行归一化和峰对齐呢的，真心求助大家？

  使用XCMS进行代谢组学数据预处理时，归一化和峰对齐是非常重要的步骤。归一化是为了消除样本间的技术变异，使得不同样本之间的代谢物峰强度可以进行比较和分析。峰对齐是为了解决不同样本之间代谢物峰的漂移和偏移问题，使得相同代谢物在不同样本中的峰位置一致。其大致步骤如下： 1.首先，使用XCMS对