OPLS-DA置换检验中R2有0.93,而且斜率是负的,能用吗?

    在OPLS-DA中,R2值衡量模型对数据变异性的解释程度。一个R2值为0.93意味着模型能够解释数据93%的变异性。这通常被认为是一个很高的值,暗示模型拥有很好的解释能力。


    在做置换检验(permutation test)时,通常会生成一个模型参数(如R2或Q2)与随机置换次数的关系图。在这种情况下,如果斜率是负的,它可能指的是随着置换次数的增加,模型性能(如R2值)下降。


    如果是这种情况,负斜率通常是一个好的迹象,表明模型不太可能是由随机噪声导致的。在置换检验中,一个好的模型应该在没有置换(即使用真实标签)时显示高性能(高R2或Q2值),并且在数据被随机置换后性能显著下降。如果您的模型在置换检验中呈现这样的特征,并且R2值为0.93,那么这通常表示您的模型是可靠的。


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