怎么通过代谢组学数据确认各行的代谢物具体是什么?
当通过代谢组学数据来确认各行的代谢物具体是什么时,涉及以下几个关键步骤:
1.与数据库匹配:
使用得到的m/z值(质荷比)和可能的分子式,与代谢物数据库进行对比,这些数据库包括HMDB(Human Metabolome Database)、Metlin、MassBank等。
2.使用保留时间信息:
(1)如果使用LC-MS,那么保留时间可以为代谢物鉴定提供额外的信息。有些数据库提供了标准化的代谢物的保留时间。
(2)对于GC-MS,保留时间和MS碎片图谱可以与标准库(如NIST)进行匹配。
3.MS/MS碎片信息:
(1)如果你的数据包括二级或多级质谱(MS/MS)数据,这些碎片图谱可以为代谢物鉴定提供关键信息。
(2)使用数据库如METLIN和MassBank,这些数据库提供了MS/MS碎片的匹配。
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