代谢组学FAQ汇总
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• 筛选出差异菌与差异代谢物并校正后进行关联分析应该录入那些数据？
在进行微生物组和代谢组的研究时，关联分析是一个关键的步骤，它有助于揭示菌群与代谢产物之间的潜在关系。为了得到准确的关联结果，首先需要对原始数据进行筛选，选出差异显著的菌和代谢物。
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多糖纯化包括凝胶层析、离心过滤、离子交换层析、亲和层析等，以分离和纯化多糖。多糖的检测方法包括酶法、光谱法、质谱法、核磁共振、甲基化分析、红外光谱等，用于获取多糖的结构、性质和相互作用信息。
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• 用deae柱过完多糖之后透析，怎么选择透析袋截留分子量？测多糖分子量大小怎么操作？
透析袋的选择主要取决于你想要保留的分子的大小。透析袋的规格通常由它的截留分子量 (Molecular Weight Cut Off, MWCO) 决定，这个数值表示只有小于这个分子量的物质才能通过透析袋的膜。因此，你需要选择一个MWCO比你想要保留的分子的分子量稍小的透析袋。例如，如果你想要
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灵芝多糖是从灵芝中提取得到的一种多糖类化合物，通常是以固体形式存在的，它在一些生物活性研究和药物开发中具有重要作用。对于灵芝多糖的溶解，常用的溶解剂之一是二甲基亚砜（DMSO）。以下是将灵芝多糖用DMSO融化的步骤： 1.准备样品：将灵芝多糖制备成粉末状。可以通过冷冻干燥等方法将灵芝多糖溶
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• 用多糖做cck8要先灭菌吗？自己冻干的多糖如何灭菌，能过滤膜或者高压吗？
先来说第一个问题，关于灭菌的必要性，我们需要明确的是在进行细胞实验时，是需要严格灭菌的，以防止可能存在的细菌或其他微生物的污染。CCK-8实验也不例外。 过滤灭菌和高压灭菌都是常用的多糖灭菌方法，它们各自也有不同之处： • 过滤灭菌：适用于溶液型的多糖。如果多糖溶液的粘度不是特别高，并且
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分析非靶代谢组学(non-targeted metabolomics)结果是一个复杂的过程，涉及一系列生物信息学步骤： 1. 数据预处理 • 数据清洗：删除噪声和无关的信息。 • 峰值检测和对齐：检测代谢物的峰值，并在不同样品之间对其进行对齐。 • 归一化和标准化：消除由于实验条件或仪器
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• 肝脏代谢组学取材动物太多，不好分装取材。能统一用液氮冻速后转移到-80摄氏度解冻，再分装吗
在进行肝脏代谢组学研究时，反复冻融过程确实可能会对样品产生影响。因为反复的冻融过程可能引发样品中的代谢酶活性改变，同时代谢物可能被氧化或降解，导致代谢物的组成和浓度因此发生变化而影响到后续的液相色谱-质谱（LC-MS）分析结果。所以为了避免反复冻融，会将样品进行分装，尽量避免外界环境因素
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在多糖的提取纯化过程中，如果溶液较多，可以考虑使用以下浓缩方式： 1.滤过浓缩：通过合适的滤膜或滤纸，将多糖溶液经过滤，去除大分子物质和杂质，得到较为纯净的滤液。然后将滤液放置在适当的条件下，如降低温度或减压，使溶剂逐渐蒸发，从而实现浓缩。 2.膜分离浓缩：利用半透膜的分离特性，将多糖
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在做代谢组学研究时，进行平行实验有助于评估实验的重复性和稳定性，从而减少由实验误差引起的影响，同时增加对所得数据的可靠性。为了确保准确性和可重复性研究人员通常会进行多次独立的平行实验。 在科学研究中，通常是选择3个生物学重复，也是普遍被认可和接受的。如果条件允许，当然也可以选择更多的生
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真菌细胞壁多糖提取的过程大致包括菌种培养和收集、细胞壁分离、细胞壁多糖提取、多糖纯化这几个步骤，不同种类的真菌，可能需要一些特殊的处理步骤，以确保多糖的完整提取。这里我们以一种常见的真菌——酵母菌为例，详细介绍这个流程 ： 1. 真菌培养和收集：选择合适的酵母菌种进行培养。可以使用液体
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