代谢组学FAQ汇总

• • 非靶向代谢数据分析出来了，想找到差异代谢物，不明白差异代谢分的三类是啥，怎么查找想要的显著差异代谢物

  在非靶向代谢数据分析中差异代谢物是指在不同样本组（如对照组和实验组）之间存在显著差异的代谢产物。通过发现这些差异代谢物，可以更好地理解不同样本组之间的生物学差异，识别潜在的生物标志物或了解代谢通路的变化。差异代谢物可以分为三类：上调代谢物、下调代谢物和未变代谢物：1.上调代谢物：在实验组或受

• • 我是四组比较用了opals-da模型去筛选vip值，然后有的vip值是8点多，这正常吗？

  在生物信息分析中，VIP（Variable Importance in Projection）值用于评估一个变量在模型中的重要性。使用PLS-DA（Partial Least Squares Discriminant Analysis）或OPLS-DA（Orthogonal Partial

• • 用MALDI-TOF MS分析缩合单宁结构时有何注意事项？

    使用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）分析缩合单宁结构时，需要考虑以下几个注意事项： 1. 选择合适的基质：基质的选择对于MALDI-TOF MS分析至关重要。由于缩合单宁是一类极性较高的化合物，选择一个适合极性化合物的基质是关键。常用的基质有2,5-二羟

• • simca和metaboanlysist软件参数怎么设置

  对于Simca和MetaboAnalysis这两个软件，参数设置可以根据具体的分析目的和数据特点进行调整。以下是它们在一些常见应用中的参数设置和建议：Simca参数设置：• 主成分分析（PCA）：设置主成分的数量，一般可以通过观察样本间的方差贡献率来选择保留的主成分数量。可以尝试选择能够解释

• • 推荐下比较靠谱的测代谢组学的公司啦？

    北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基

• • 代谢组学、LC-MS,从Excel中得到的化合物,如何与化合物标准的质谱谱库进行匹配？

    在代谢组学研究中，使用LC-MS技术分析得到的数据通常需要与已知的质谱谱库进行匹配，以便于鉴定和注释代谢物。从Excel表格中获得的化合物数据可以通过以下步骤与化合物标准的质谱谱库进行匹配： 1. 整理数据：首先，确保Excel表格中的数据格式整齐、标准化，包括质荷比（m/z）、保留

• • 你好，请问怎么从想研究的代谢通路推出关键代谢物呢？代谢物可以和微生物相关联吗？

  要想从某个代谢通路推出关键代谢物，通常可以从以下几个方面入手： 1.关键代谢通路：对代谢通路的深入理解可以帮助你确定关键的代谢物。你可以特别注意那些在通路中起决定性作用的步骤，例如不可逆的步骤，或者控制通路流量的分支点。 2.关键代谢物：对于某些特异的代谢物，例如只在某一种生物或

• • 您好，请问如果提取的多糖里含有蛋白，会影响单糖组成和核磁的结果嘛？

  提取的多糖样品中如果含有蛋白质，可能会对多糖的化学和生物学性质分析，包括单糖组成分析和核磁共振（NMR）谱分析产生影响。 1.单糖组成分析：这是通过酶或酸水解多糖，然后分析生成的单糖的种类和比例。蛋白质的存在可能会干扰这种分析。因为蛋白质在酸环境下也可能发生水解，生成氨

• • 高效液相色谱串联质谱法检测血清25-羟维生素D，为什么能用氘代内标法定量？普通色谱法能否用此法定量？

    氘代内标法是一种定量分析方法，其原理是在样品中加入一定量的同位素标记物质（通常为氘代化合物）作为内标，与待测物质共同进入分析过程。氘代内标与待测物质的化学性质非常相似，但它们的质谱信号可以区分开来，因为同位素标记物质具有不同的质量。这种方法可以有效地校正实验过程中的误差，提高定量分析的

• • 请问老师有做过多糖的荧光标记吗

  对多糖进行荧光标记有多种方法。不过这种实验需要精密的操作和准确的实验条件。以下是一种常用的标记方法，供您参考：1.选择合适的荧光探针: 根据你的需要，选择一种能够与多糖形成共价键的荧光探针。一种常见的选择是荧光异硫氰酸酯（FITC）。它可以与含氨基的化合物形成共价键。2.准备多糖溶液: 将多